RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 DDR1Q08345 913 aa26.58■■□□□ 1.85
CTDSP2-204ENST00000548823 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.84
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.58■■□□□ 1.84
CTDSP2-204ENST00000548823 LMNB1P20700 586 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDSP2-204ENST00000548823 RASSF7Q02833 373 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDSP2-204ENST00000548823 FKBP8Q14318 412 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDSP2-204ENST00000548823 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
CTDSP2-204ENST00000548823 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CTDSP2-204ENST00000548823 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDSP2-204ENST00000548823 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CTDSP2-204ENST00000548823 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
CTDSP2-204ENST00000548823 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
CTDSP2-204ENST00000548823 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDSP2-204ENST00000548823 TM4SF1P30408 202 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDSP2-204ENST00000548823 CRKLP46109 303 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CTDSP2-204ENST00000548823 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CTDSP2-204ENST00000548823 CREBZFQ9NS37 354 aa26.49■■□□□ 1.83
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa26.49■■□□□ 1.83
CTDSP2-204ENST00000548823 POTECB2RU33 542 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDSP2-204ENST00000548823 TIAM2Q8IVF5 1701 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDSP2-204ENST00000548823 CABP4P57796 275 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDSP2-204ENST00000548823 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDSP2-204ENST00000548823 PRDM10Q9NQV6 1147 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDSP2-204ENST00000548823 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CTDSP2-204ENST00000548823 FOXN1O15353 648 aa26.46■■□□□ 1.83
CTDSP2-204ENST00000548823 DPY19L2Q6NUT2 758 aa26.46■■□□□ 1.83
CTDSP2-204ENST00000548823 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CTDSP2-204ENST00000548823 TTLL6Q8N841 843 aa26.44■■□□□ 1.82
CTDSP2-204ENST00000548823 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.43■■□□□ 1.82
CTDSP2-204ENST00000548823 ZPR1O75312 459 aa26.43■■□□□ 1.82
CTDSP2-204ENST00000548823 PPP2R1AP30153 589 aa26.43■■□□□ 1.82
CTDSP2-204ENST00000548823 POLKQ9UBT6 870 aa26.43■■□□□ 1.82
CTDSP2-204ENST00000548823 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.43■■□□□ 1.82
CTDSP2-204ENST00000548823 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CTDSP2-204ENST00000548823 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CTDSP2-204ENST00000548823 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CTDSP2-204ENST00000548823 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.41■■□□□ 1.82
CTDSP2-204ENST00000548823 CHADLQ6NUI6 762 aa26.41■■□□□ 1.82
CTDSP2-204ENST00000548823 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CTDSP2-204ENST00000548823 TJP1Q07157 1748 aa26.4■■□□□ 1.82
CTDSP2-204ENST00000548823 NFKBIEO00221 500 aa26.4■■□□□ 1.82
CTDSP2-204ENST00000548823 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.39■■□□□ 1.81
CTDSP2-204ENST00000548823 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
CTDSP2-204ENST00000548823 CNTNAP1P78357 1384 aa26.38■■□□□ 1.81
CTDSP2-204ENST00000548823 MTHFSP49914 203 aa26.37■■□□□ 1.81
CTDSP2-204ENST00000548823 NFIXQ14938 502 aa26.37■■□□□ 1.81
CTDSP2-204ENST00000548823 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.37■■□□□ 1.81
CTDSP2-204ENST00000548823 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.37■■□□□ 1.81
CTDSP2-204ENST00000548823 AIDAQ96BJ3 306 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDSP2-204ENST00000548823 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
CTDSP2-204ENST00000548823 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.35■■□□□ 1.81
CTDSP2-204ENST00000548823 H0YIN7 160 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDSP2-204ENST00000548823 SERPINB2P05120 415 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDSP2-204ENST00000548823 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
CTDSP2-204ENST00000548823 ERFEQ4G0M1 354 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDSP2-204ENST00000548823 NARFQ9UHQ1 456 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDSP2-204ENST00000548823 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDSP2-204ENST00000548823 POTEIP0CG38 1075 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDSP2-204ENST00000548823 POTEJP0CG39 1038 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDSP2-204ENST00000548823 PCDH10Q9P2E7 1040 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDSP2-204ENST00000548823 DNAJC10Q8IXB1 793 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDSP2-204ENST00000548823 PASKQ96RG2 1323 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM161AQ3B820 660 aa26.29■■□□□ 1.8
CTDSP2-204ENST00000548823 WBP1LQ9NX94 342 aa26.29■■□□□ 1.8
CTDSP2-204ENST00000548823 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa26.29■■□□□ 1.8
CTDSP2-204ENST00000548823 VEGFBP49765 207 aa26.28■■□□□ 1.8
CTDSP2-204ENST00000548823 LBX1P52954 281 aa26.28■■□□□ 1.8
CTDSP2-204ENST00000548823 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.28■■□□□ 1.8
CTDSP2-204ENST00000548823 ABHD8Q96I13 439 aa26.27■■□□□ 1.8
CTDSP2-204ENST00000548823 COL15A1P39059 1388 aa26.27■■□□□ 1.8
CTDSP2-204ENST00000548823 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CTDSP2-204ENST00000548823 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CTDSP2-204ENST00000548823 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CTDSP2-204ENST00000548823 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.26■■□□□ 1.79
CTDSP2-204ENST00000548823 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.26■■□□□ 1.79
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM88BA6NKF7 163 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDSP2-204ENST00000548823 C21orf2O43822 256 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDSP2-204ENST00000548823 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
CTDSP2-204ENST00000548823 MORC1Q86VD1 984 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDSP2-204ENST00000548823 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDSP2-204ENST00000548823 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.24■■□□□ 1.79
CTDSP2-204ENST00000548823 LDHDQ86WU2 507 aa26.24■■□□□ 1.79
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.24■■□□□ 1.79
CTDSP2-204ENST00000548823 IQCA1LA6NCM1 817 aa26.23■■□□□ 1.79
CTDSP2-204ENST00000548823 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.22■■□□□ 1.79
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
CTDSP2-204ENST00000548823 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa26.21■■□□□ 1.79
CTDSP2-204ENST00000548823 SCN4AP35499 1836 aa26.21■■□□□ 1.79
CTDSP2-204ENST00000548823 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.21■■□□□ 1.79
CTDSP2-204ENST00000548823 PDE6BP35913 854 aa26.2■■□□□ 1.79
CTDSP2-204ENST00000548823 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.2■■□□□ 1.79
CTDSP2-204ENST00000548823 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.2■■□□□ 1.79
CTDSP2-204ENST00000548823 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
CTDSP2-204ENST00000548823 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
CTDSP2-204ENST00000548823 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.2■■□□□ 1.78
CTDSP2-204ENST00000548823 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
CTDSP2-204ENST00000548823 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.19■■□□□ 1.78
CTDSP2-204ENST00000548823 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.5 ms