RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543656.1

RUSC1-AS1-204, RUSC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RUSC1-AS1, Length 1,357 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.4■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.4■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SPG7Q9UQ90 795 aa22.4■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KCNA3P22001 575 aa22.39■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PRELPP51888 382 aa22.38■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CCDC27Q2M243 656 aa22.38■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 GYS1P13807 737 aa22.38■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.38■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RRAGCQ9HB90 399 aa22.37■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.36■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PHKG2P15735 406 aa22.36■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RIPK4P57078 832 aa22.36■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.36■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.35■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SBF1O95248 1867 aa22.35■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 DCAF5Q96JK2 942 aa22.35■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RNF181Q9P0P0 153 aa22.35■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.35■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.34■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PIM2Q9P1W9 311 aa22.33■■□□□ 1.17
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.32■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ADRA2BP18089 450 aa22.32■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RFC4P35249 363 aa22.32■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.32■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.32■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.31■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NEUROD2Q15784 382 aa22.3■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.3■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.3■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.29■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 WWC1Q8IX03 1113 aa22.29■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RPS6KA4O75676 772 aa22.28■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CHRNA5P30532 468 aa22.28■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ZNF521Q96K83 1311 aa22.28■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 DDR1Q08345 913 aa22.27■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 WDR63Q8IWG1 891 aa22.27■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.27■■□□□ 1.16
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 IL17REQ8NFR9 667 aa22.26■■□□□ 1.15
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FKBP8Q14318 412 aa22.25■■□□□ 1.15
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RASSF7Q02833 373 aa22.25■■□□□ 1.15
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 LGR6Q9HBX8 967 aa22.24■■□□□ 1.15
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.24■■□□□ 1.15
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 IL16Q14005 1332 aa22.23■■□□□ 1.15
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.22■■□□□ 1.15
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.22■■□□□ 1.15
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TJP1Q07157 1748 aa22.21■■□□□ 1.15
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.21■■□□□ 1.15
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 DCTN1Q14203 1278 aa22.21■■□□□ 1.15
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MCM10Q7L590 875 aa22.21■■□□□ 1.15
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.2■■□□□ 1.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 GOLGA2Q08379 1002 aa22.19■■□□□ 1.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.18■■□□□ 1.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.18■■□□□ 1.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 GLTPD2A6NH11 291 aa22.17■■□□□ 1.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ZNF853P0CG23 659 aa22.17■■□□□ 1.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CABP4P57796 275 aa22.17■■□□□ 1.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CFAP44Q96MT7 982 aa22.16■■□□□ 1.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.16■■□□□ 1.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.16■■□□□ 1.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 LMNB1P20700 586 aa22.15■■□□□ 1.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SLFN5Q08AF3 891 aa22.15■■□□□ 1.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 IFT57Q9NWB7 429 aa22.15■■□□□ 1.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 E9PSI1 815 aa22.14■■□□□ 1.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CHL1O00533 1208 aa22.14■■□□□ 1.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TM4SF1P30408 202 aa22.14■■□□□ 1.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 GNAI1P63096 354 aa22.14■■□□□ 1.14
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TEFQ10587 303 aa22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms