RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517261.1

RNU6-794P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 794, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-794P, Length 64 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-794P-201ENST00000517261 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 PAX4O43316 350 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 USP17L8P0C7I0 530 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 RNF20Q5VTR2 975 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 TRIM34Q9BYJ4 488 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 STRN4Q9NRL3 753 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 ZBBXA8MT70 800 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 ATP4AP20648 1035 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 TXKP42681 527 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 FAM182BQ5T319 152 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 M0R082 166 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 PLA2G4AP47712 749 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 ELOA3Q8NG57 546 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 ELNP15502 786 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 SELPP16109 830 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 FZD5Q13467 585 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 ADGRE1Q14246 886 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 MBTPS1Q14703 1052 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 CCDC125Q86Z20 511 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 TP53INP1Q96A56 240 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 NACC1Q96RE7 527 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 MDFIQ99750 246 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 ALAS2P22557 587 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 NLRP8Q86W28 1048 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 AIDAQ96BJ3 306 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-794P-201ENST00000517261 A0A1W2PNR3 127 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-794P-201ENST00000517261 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-794P-201ENST00000517261 SYT9Q86SS6 491 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-794P-201ENST00000517261 ALBP02768 609 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-794P-201ENST00000517261 NID1P14543 1247 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-794P-201ENST00000517261 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-794P-201ENST00000517261 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-794P-201ENST00000517261 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-794P-201ENST00000517261 C9orf172C9J069 976 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-794P-201ENST00000517261 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-794P-201ENST00000517261 TXNRD3Q86VQ6 643 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-794P-201ENST00000517261 RNF112Q9ULX5 631 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-794P-201ENST00000517261 TLR1Q15399 786 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-794P-201ENST00000517261 TSGA10IPQ3SY00 556 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-794P-201ENST00000517261 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-794P-201ENST00000517261 TRAPPC3LQ5T215 181 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-794P-201ENST00000517261 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-794P-201ENST00000517261 MARK1Q9P0L2 795 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-794P-201ENST00000517261 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-794P-201ENST00000517261 ESCO1Q5FWF5 840 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-794P-201ENST00000517261 ZIC5Q96T25 663 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-794P-201ENST00000517261 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-794P-201ENST00000517261 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-794P-201ENST00000517261 FAM157BP0CG42 384 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-794P-201ENST00000517261 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-794P-201ENST00000517261 A0A0A0MRY4 1105 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-794P-201ENST00000517261 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-794P-201ENST00000517261 EFSO43281 561 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-794P-201ENST00000517261 MYCP01106 439 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-794P-201ENST00000517261 SSTR4P31391 388 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-794P-201ENST00000517261 SH3D19Q5HYK7 790 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-794P-201ENST00000517261 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-794P-201ENST00000517261 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-794P-201ENST00000517261 RFC5P40937 340 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-794P-201ENST00000517261 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-794P-201ENST00000517261 SLC30A3Q99726 388 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-794P-201ENST00000517261 RNF114Q9Y508 228 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-794P-201ENST00000517261 SIN3BO75182 1162 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-794P-201ENST00000517261 IRAK1P51617 712 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-794P-201ENST00000517261 NR1H3Q13133 447 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-794P-201ENST00000517261 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-794P-201ENST00000517261 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-794P-201ENST00000517261 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-794P-201ENST00000517261 GJA3Q9Y6H8 435 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-794P-201ENST00000517261 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU6-794P-201ENST00000517261 LAMC2Q13753 1193 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-794P-201ENST00000517261 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU6-794P-201ENST00000517261 TNFRSF25Q93038 417 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-794P-201ENST00000517261 USP21Q9UK80 565 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-794P-201ENST00000517261 USP3Q9Y6I4 520 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-794P-201ENST00000517261 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU6-794P-201ENST00000517261 MED26O95402 600 aa6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85 ms