RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 RNF34Q969K3 372 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 TANGO6Q9C0B7 1094 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 TGIF2Q9GZN2 237 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 NIF3L1Q9GZT8 377 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 ATP2B2Q01814 1243 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 TRIM32Q13049 653 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 PDE3BQ13370 1112 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 MTFR1Q15390 333 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 DPH6Q7L8W6 267 aa7.51□□□□□ -1.21
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HERC3-209ENST00000504994 ABTB2Q8N961 1025 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 RAB6BQ9NRW1 208 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 POLIQ9UNA4 740 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 CADPSQ9ULU8 1353 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 A6NJY4 79 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
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HERC3-209ENST00000504994 CYP2U1Q7Z449 544 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 MYO19Q96H55 970 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
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HERC3-209ENST00000504994 CCSER2Q9H7U1 834 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 CAPN10Q9HC96 672 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 SMTNP53814 917 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 ARID5BQ14865 1188 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa7.49□□□□□ -1.21
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HERC3-209ENST00000504994 ITGAEP38570 1179 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 TNNI2P48788 182 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 PLA2G2CQ5R387 149 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 POTEAQ6S8J7 498 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 SLC43A3Q8NBI5 491 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 EDEM1Q92611 657 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 NGLY1Q96IV0 654 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 TLL2Q9Y6L7 1015 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 IL2RAP01589 272 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 GRM5P41594 1212 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 WNT7BP56706 349 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 ESCO1Q5FWF5 840 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 ALG1LQ6GMV1 187 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 CDK15Q96Q40 435 aa7.47□□□□□ -1.21
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HERC3-209ENST00000504994 BRD2P25440 801 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 GNA15P30679 374 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 EHBP1Q8NDI1 1231 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 PTPN5P54829 565 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 MYT1Q01538 1121 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 ORC1Q13415 861 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 DGKZQ13574 1117 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 TLR1Q15399 786 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 CRELD1Q96HD1 420 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 CDK2AP1O14519 115 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 ZAP70P43403 619 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 CCDC116Q8IYX3 515 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 XAGE2Q96GT9 111 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 CSRNP1Q96S65 589 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 KLK14Q9P0G3 267 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 CHMP3Q9Y3E7 222 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 HRH3Q9Y5N1 445 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 SERTM1A2A2V5 107 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 RNF223E7ERA6 249 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 ATP2B1P20020 1258 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP7.43□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 USP5P45974 858 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 ZNF394Q53GI3 561 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 FBF1Q8TES7 1133 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 TRIM52Q96A61 297 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 AK5Q9Y6K8 562 aa7.43□□□□□ -1.22
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