RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503051.1

USP46-AS1-201, USP46 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP46-AS1, Length 1,048 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-AS1-201ENST00000503051 STARD3NLO95772 234 aa25.42■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 MCM10Q7L590 875 aa25.42■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.42■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.42■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 UTRNP46939 3433 aa25.41■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 ANP32CO43423 234 aa25.41■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 GRIN3BO60391 1043 aa25.41■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.41■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.4■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 SCN7AQ01118 1682 aa25.39■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.39■■□□□ 1.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.39■■□□□ 1.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 DCTN1Q14203 1278 aa25.38■■□□□ 1.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.37■■□□□ 1.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 FKBP8Q14318 412 aa25.37■■□□□ 1.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 NFE2L2Q16236 605 aa25.37■■□□□ 1.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.37■■□□□ 1.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.36■■□□□ 1.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 BCORQ6W2J9 1755 aa25.34■■□□□ 1.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 KCNQ3O43525 872 aa25.34■■□□□ 1.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.34■■□□□ 1.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 NARFQ9UHQ1 456 aa25.34■■□□□ 1.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 A0A087WZG4 1122 aa25.33■■□□□ 1.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.33■■□□□ 1.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 TGFB2P61812 414 aa25.32■■□□□ 1.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCDC184Q52MB2 194 aa25.32■■□□□ 1.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa25.32■■□□□ 1.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 DDR1Q08345 913 aa25.31■■□□□ 1.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.31■■□□□ 1.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 RUNDC1Q96C34 613 aa25.29■■□□□ 1.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 A0A0G2JLW4 131 aa25.27■■□□□ 1.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 A1BGP04217 495 aa25.27■■□□□ 1.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 MRS2Q9HD23 443 aa25.27■■□□□ 1.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 DLEC1Q9Y238 1755 aa25.26■■□□□ 1.63
USP46-AS1-201ENST00000503051 DPEP1P16444 411 aa25.26■■□□□ 1.63
USP46-AS1-201ENST00000503051 NFIXQ14938 502 aa25.26■■□□□ 1.63
USP46-AS1-201ENST00000503051 BCS1LQ9Y276 419 aa25.26■■□□□ 1.63
USP46-AS1-201ENST00000503051 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
USP46-AS1-201ENST00000503051 TM4SF1P30408 202 aa25.25■■□□□ 1.63
USP46-AS1-201ENST00000503051 RIPK4P57078 832 aa25.25■■□□□ 1.63
USP46-AS1-201ENST00000503051 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
USP46-AS1-201ENST00000503051 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.24■■□□□ 1.63
USP46-AS1-201ENST00000503051 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.24■■□□□ 1.63
USP46-AS1-201ENST00000503051 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.24■■□□□ 1.63
USP46-AS1-201ENST00000503051 USP16Q9Y5T5 823 aa25.24■■□□□ 1.63
USP46-AS1-201ENST00000503051 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.23■■□□□ 1.63
USP46-AS1-201ENST00000503051 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.23■■□□□ 1.63
USP46-AS1-201ENST00000503051 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.23■■□□□ 1.63
USP46-AS1-201ENST00000503051 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
USP46-AS1-201ENST00000503051 SERPINB2P05120 415 aa25.21■■□□□ 1.63
USP46-AS1-201ENST00000503051 NEUROD2Q15784 382 aa25.21■■□□□ 1.63
USP46-AS1-201ENST00000503051 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.21■■□□□ 1.63
USP46-AS1-201ENST00000503051 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
USP46-AS1-201ENST00000503051 CACNA1SQ13698 1873 aa25.19■■□□□ 1.62
USP46-AS1-201ENST00000503051 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.19■■□□□ 1.62
USP46-AS1-201ENST00000503051 PIM2Q9P1W9 311 aa25.19■■□□□ 1.62
USP46-AS1-201ENST00000503051 NPHP1O15259 732 aa25.18■■□□□ 1.62
USP46-AS1-201ENST00000503051 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.18■■□□□ 1.62
USP46-AS1-201ENST00000503051 CHRNA5P30532 468 aa25.17■■□□□ 1.62
USP46-AS1-201ENST00000503051 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.17■■□□□ 1.62
USP46-AS1-201ENST00000503051 ATP10DQ9P241 1426 aa25.17■■□□□ 1.62
USP46-AS1-201ENST00000503051 CAMTA2O94983 1202 aa25.16■■□□□ 1.62
USP46-AS1-201ENST00000503051 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.16■■□□□ 1.62
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.16■■□□□ 1.62
USP46-AS1-201ENST00000503051 NUP98P52948 1817 aa25.16■■□□□ 1.62
USP46-AS1-201ENST00000503051 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
USP46-AS1-201ENST00000503051 APAF1O14727 1248 aa25.15■■□□□ 1.62
USP46-AS1-201ENST00000503051 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
USP46-AS1-201ENST00000503051 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.14■■□□□ 1.62
USP46-AS1-201ENST00000503051 SETDB2Q96T68 719 aa25.14■■□□□ 1.62
USP46-AS1-201ENST00000503051 KCNA3P22001 575 aa25.13■■□□□ 1.61
USP46-AS1-201ENST00000503051 ADCY9O60503 1353 aa25.13■■□□□ 1.61
USP46-AS1-201ENST00000503051 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
USP46-AS1-201ENST00000503051 SBF1O95248 1867 aa25.12■■□□□ 1.61
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa25.11■■□□□ 1.61
USP46-AS1-201ENST00000503051 NBPF26B4DH59 902 aa25.11■■□□□ 1.61
USP46-AS1-201ENST00000503051 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
USP46-AS1-201ENST00000503051 NBPF15Q8N660 670 aa25.11■■□□□ 1.61
USP46-AS1-201ENST00000503051 CNBD1Q8NA66 436 aa25.11■■□□□ 1.61
USP46-AS1-201ENST00000503051 ST5P78524 1137 aa25.1■■□□□ 1.61
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