RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502470.5

MIB2-215, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 5

Gene MIB2, Length 780 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB2-215ENST00000502470 C10orf71Q711Q0 1435 aa36.04■■■■□ 3.36
MIB2-215ENST00000502470 WWC3Q9ULE0 1092 aa36.04■■■■□ 3.36
MIB2-215ENST00000502470 PARP3Q9Y6F1 533 aa36.04■■■■□ 3.36
MIB2-215ENST00000502470 GRIN3BO60391 1043 aa36.03■■■■□ 3.36
MIB2-215ENST00000502470 FMNL2Q96PY5 1086 aa36.03■■■■□ 3.36
MIB2-215ENST00000502470 PLEKHF1Q96S99 279 aa36.03■■■■□ 3.36
MIB2-215ENST00000502470 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
MIB2-215ENST00000502470 STARD3NLO95772 234 aa36.02■■■■□ 3.36
MIB2-215ENST00000502470 CANXP27824 592 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
MIB2-215ENST00000502470 USPL1Q5W0Q7 1092 aa36.02■■■■□ 3.36
MIB2-215ENST00000502470 PXDNLA1KZ92 1463 aa36.01■■■■□ 3.36
MIB2-215ENST00000502470 ZPR1O75312 459 aa36.01■■■■□ 3.36
MIB2-215ENST00000502470 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
MIB2-215ENST00000502470 NEFMP07197 916 aa35.99■■■■□ 3.35
MIB2-215ENST00000502470 DDR1Q08345 913 aa35.99■■■■□ 3.35
MIB2-215ENST00000502470 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
MIB2-215ENST00000502470 NARFQ9UHQ1 456 aa35.99■■■■□ 3.35
MIB2-215ENST00000502470 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
MIB2-215ENST00000502470 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
MIB2-215ENST00000502470 TM4SF1P30408 202 aa35.96■■■■□ 3.35
MIB2-215ENST00000502470 EIF5P55010 431 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
MIB2-215ENST00000502470 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
MIB2-215ENST00000502470 TGFB2P61812 414 aa35.95■■■■□ 3.35
MIB2-215ENST00000502470 KDM3BQ7LBC6 1761 aa35.94■■■■□ 3.34
MIB2-215ENST00000502470 BCL2L12Q9HB09 334 aa35.94■■■■□ 3.34
MIB2-215ENST00000502470 NFE2L2Q16236 605 aa35.93■■■■□ 3.34
MIB2-215ENST00000502470 SCN7AQ01118 1682 aa35.93■■■■□ 3.34
MIB2-215ENST00000502470 NRXN2Q9P2S2 1712 aa35.92■■■■□ 3.34
MIB2-215ENST00000502470 A0A0G2JLW4 131 aa35.92■■■■□ 3.34
MIB2-215ENST00000502470 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
MIB2-215ENST00000502470 A1BGP04217 495 aa35.92■■■■□ 3.34
MIB2-215ENST00000502470 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
MIB2-215ENST00000502470 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa35.91■■■■□ 3.34
MIB2-215ENST00000502470 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
MIB2-215ENST00000502470 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa35.9■■■■□ 3.34
MIB2-215ENST00000502470 USP16Q9Y5T5 823 aa35.9■■■■□ 3.34
MIB2-215ENST00000502470 DPEP1P16444 411 aa35.89■■■■□ 3.34
MIB2-215ENST00000502470 NFIXQ14938 502 aa35.89■■■■□ 3.34
MIB2-215ENST00000502470 MIS18AQ9NYP9 233 aa35.89■■■■□ 3.34
MIB2-215ENST00000502470 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
MIB2-215ENST00000502470 A0A087WZG4 1122 aa35.87■■■■□ 3.33
MIB2-215ENST00000502470 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
MIB2-215ENST00000502470 LAMB4A4D0S4 1761 aa35.87■■■■□ 3.33
MIB2-215ENST00000502470 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
MIB2-215ENST00000502470 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
MIB2-215ENST00000502470 BCORQ6W2J9 1755 aa35.86■■■■□ 3.33
MIB2-215ENST00000502470 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
MIB2-215ENST00000502470 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa35.84■■■■□ 3.33
MIB2-215ENST00000502470 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa35.84■■■■□ 3.33
MIB2-215ENST00000502470 KCNA3P22001 575 aa35.83■■■■□ 3.33
MIB2-215ENST00000502470 BCS1LQ9Y276 419 aa35.82■■■■□ 3.32
MIB2-215ENST00000502470 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
MIB2-215ENST00000502470 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
MIB2-215ENST00000502470 SERPINB2P05120 415 aa35.79■■■■□ 3.32
MIB2-215ENST00000502470 BICDL1Q6ZP65 573 aa35.79■■■■□ 3.32
MIB2-215ENST00000502470 TBC1D9BQ66K14 1250 aa35.78■■■■□ 3.32
MIB2-215ENST00000502470 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
MIB2-215ENST00000502470 DLEC1Q9Y238 1755 aa35.77■■■■□ 3.32
MIB2-215ENST00000502470 CHRNA5P30532 468 aa35.77■■■■□ 3.32
MIB2-215ENST00000502470 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
MIB2-215ENST00000502470 RIPK4P57078 832 aa35.76■■■■□ 3.32
MIB2-215ENST00000502470 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa35.75■■■■□ 3.31
MIB2-215ENST00000502470 CAMTA2O94983 1202 aa35.75■■■■□ 3.31
MIB2-215ENST00000502470 CCDC146Q8IYE0 955 aa35.75■■■■□ 3.31
MIB2-215ENST00000502470 NBPF26B4DH59 902 aa35.74■■■■□ 3.31
MIB2-215ENST00000502470 TMPOP42166 694 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
MIB2-215ENST00000502470 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
MIB2-215ENST00000502470 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
MIB2-215ENST00000502470 NBPF15Q8N660 670 aa35.74■■■■□ 3.31
MIB2-215ENST00000502470 PIM2Q9P1W9 311 aa35.74■■■■□ 3.31
MIB2-215ENST00000502470 CARMIL3Q8ND23 1372 aa35.73■■■■□ 3.31
MIB2-215ENST00000502470 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
MIB2-215ENST00000502470 ADCY9O60503 1353 aa35.72■■■■□ 3.31
MIB2-215ENST00000502470 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP35.71■■■■□ 3.31
MIB2-215ENST00000502470 ATP10DQ9P241 1426 aa35.71■■■■□ 3.31
MIB2-215ENST00000502470 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
MIB2-215ENST00000502470 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
MIB2-215ENST00000502470 ADAMTS8Q9UP79 889 aa35.69■■■■□ 3.3
MIB2-215ENST00000502470 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
MIB2-215ENST00000502470 NEUROD2Q15784 382 aa35.66■■■■□ 3.3
MIB2-215ENST00000502470 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa35.66■■■■□ 3.3
MIB2-215ENST00000502470 RUNDC1Q96C34 613 aa35.66■■■■□ 3.3
MIB2-215ENST00000502470 TSPYL4Q9UJ04 414 aa35.65■■■■□ 3.3
MIB2-215ENST00000502470 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
MIB2-215ENST00000502470 LMOD3Q0VAK6 560 aa35.64■■■■□ 3.3
MIB2-215ENST00000502470 PRR5LQ6MZQ0 368 aa35.64■■■■□ 3.3
MIB2-215ENST00000502470 SETDB2Q96T68 719 aa35.64■■■■□ 3.3
MIB2-215ENST00000502470 CCDC24Q8N4L8 307 aa35.63■■■■□ 3.29
MIB2-215ENST00000502470 NUP98P52948 1817 aa35.62■■■■□ 3.29
MIB2-215ENST00000502470 SBF1O95248 1867 aa35.61■■■■□ 3.29
MIB2-215ENST00000502470 CLEC4GQ6UXB4 293 aa35.6■■■■□ 3.29
MIB2-215ENST00000502470 C2CD5Q86YS7 1000 aa35.6■■■■□ 3.29
MIB2-215ENST00000502470 TRIM35Q9UPQ4 493 aa35.59■■■■□ 3.29
MIB2-215ENST00000502470 CACNA1SQ13698 1873 aa35.58■■■■□ 3.29
MIB2-215ENST00000502470 ZNF652Q9Y2D9 606 aa35.58■■■■□ 3.29
MIB2-215ENST00000502470 NGEFQ8N5V2 710 aa35.57■■■■□ 3.28
MIB2-215ENST00000502470 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
MIB2-215ENST00000502470 BABAM1Q9NWV8 329 aa35.57■■■■□ 3.28
MIB2-215ENST00000502470 H0YIN7 160 aa35.56■■■■□ 3.28
MIB2-215ENST00000502470 CNBD1Q8NA66 436 aa35.56■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.7 ms