RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 SEPT3Q9UH03 358 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 MAN1A2O60476 641 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 UPP2O95045 317 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 IGFBP4P22692 258 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 Q6ZVU0 165 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 CHMP3Q9Y3E7 222 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 CENPCQ03188 943 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 CLN3Q13286 438 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC27Q2M243 656 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 CAPN12Q6ZSI9 719 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 FOXO3O43524 673 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 EPHA4P54764 986 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 SOWAHDA6NJG2 315 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 CDK2AP1O14519 115 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 C21orf2O43822 256 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 CABP1Q9NZU7 370 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 DNMT3LQ9UJW3 386 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 NISCHQ9Y2I1 1504 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 H3BRB1 525 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 FOXK2Q01167 660 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 MTFR1Q15390 333 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 GLYCTKQ8IVS8 523 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 NBPF15Q8N660 670 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 NGLY1Q96IV0 654 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 MTMR3Q13615 1198 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 USP3Q9Y6I4 520 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 SERTM1A2A2V5 107 aa7.42□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 PPFIA3O75145 1194 aa7.42□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 VSIG8P0DPA2 414 aa7.42□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa7.42□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.41□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 ICMTO60725 284 aa7.41□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP7.41□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 GNASQ5JWF2 1037 aa7.41□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 COL26A1Q96A83 441 aa7.41□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.41□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 HRH3Q9Y5N1 445 aa7.41□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 FIGNL2A6NMB9 653 aa7.4□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 TTLL8A6PVC2 850 aa7.4□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 NOS2P35228 1153 aa7.4□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 AAMPQ13685 434 aa7.4□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 C16orf46Q6P387 395 aa7.4□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.4□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 AIDAQ96BJ3 306 aa7.4□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
POLR1B-215ENST00000498054 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 PHKA2P46019 1235 aa7.39□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 MARSP56192 900 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 TEAD4Q15561 434 aa7.39□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.39□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 STAG2Q8N3U4 1231 aa7.39□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 RGS22Q8NE09 1264 aa7.39□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 HELQQ8TDG4 1101 aa7.39□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.39□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 SPINT1O43278 529 aa7.38□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 PLA2G4AP47712 749 aa7.38□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa7.38□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.38□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.38□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.38□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 EML1O00423 815 aa7.37□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 FAM13AO94988 1023 aa7.37□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 GPC1P35052 558 aa7.37□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 PTSQ03393 145 aa7.37□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 COX20Q5RI15 118 aa7.37□□□□□ -1.23
POLR1B-215ENST00000498054 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.37□□□□□ -1.23
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