RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496565.5

LPIN3-204, Transcript of lipin 3, human

TSL 3

Gene LPIN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	USP35	Q9P2H5	1018 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	RGS12	O14924	1447 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	KCNQ3	O43525	872 aa		11.82	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	GCC1	Q96CN9	775 aa		11.82	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	C8orf37	Q96NL8	207 aa		11.82	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		11.82	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	HMMR	O75330	724 aa		11.81	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	STARD3NL	O95772	234 aa		11.81	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		11.81	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		11.81	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	PIGB	Q92521	554 aa		11.8	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		11.8	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		11.8	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	ITGB4	P16144	1822 aa		11.79	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	ATRN	O75882	1429 aa		11.79	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	RGL2	O15211	777 aa		11.79	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	GNAI2	P04899	355 aa		11.79	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		11.79	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	SLC39A6	Q13433	755 aa		11.79	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	PDIA6	Q15084	440 aa		11.79	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	G2E3	Q7L622	706 aa		11.79	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	SMC5	Q8IY18	1101 aa		11.79	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	LINS1	Q8NG48	757 aa		11.79	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		11.79	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		11.78	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		11.78	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		11.78	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	TNN	Q9UQP3	1299 aa		11.78	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	BEND3	Q5T5X7	828 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	ATG3	Q9NT62	314 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	USP16	Q9Y5T5	823 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	AFF2	P51816	1311 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	COL15A1	P39059	1388 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		11.76	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		11.76	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	UTY	O14607	1347 aa		11.76	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	IGHD	P01880	384 aa		11.75	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		11.75	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		11.75	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		11.75	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	DCTPP1	Q9H773	170 aa		11.75	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	ATP8B2	P98198	1209 aa		11.74	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	COPS6	Q7L5N1	327 aa		11.74	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	USP44	Q9H0E7	712 aa		11.74	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		11.74	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	ADCY9	O60503	1353 aa		11.74	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	GLI3	P10071	1580 aa		11.74	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565		F6X3S4	739 aa		11.73	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	C5	P01031	1676 aa		11.73	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	MTX1	Q13505	466 aa		11.73	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		11.73	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	POTEA	Q6S8J7	498 aa		11.73	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	NECTIN2	Q92692	538 aa		11.73	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		11.73	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		11.72	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	CEP85	Q6P2H3	762 aa		11.72	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		11.72	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		11.72	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	MEIS3	Q99687	375 aa		11.72	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		11.72	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565		A0A087WZG4	1122 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	GRM8	O00222	908 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	RAB11FIP3	O75154	756 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	NUCB1	Q02818	461 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LPIN3-204	ENST00000496565	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LPIN3-204	ENST00000496565	NBPF26	B4DH59	902 aa		11.7	□□□□□ -0.54

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