RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494815.1

TSPAN4-212, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 2,187 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-212ENST00000494815 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
TSPAN4-212ENST00000494815 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.1■■□□□ 1.29
TSPAN4-212ENST00000494815 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.29
TSPAN4-212ENST00000494815 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.1■■□□□ 1.29
TSPAN4-212ENST00000494815 GNAI2P04899 355 aa23.1■■□□□ 1.29
TSPAN4-212ENST00000494815 DCTPP1Q9H773 170 aa23.1■■□□□ 1.29
TSPAN4-212ENST00000494815 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
TSPAN4-212ENST00000494815 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.09■■□□□ 1.29
TSPAN4-212ENST00000494815 DISP2A7MBM2 1401 aa23.08■■□□□ 1.29
TSPAN4-212ENST00000494815 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.08■■□□□ 1.29
TSPAN4-212ENST00000494815 HMMRO75330 724 aa23.08■■□□□ 1.29
TSPAN4-212ENST00000494815 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.08■■□□□ 1.29
TSPAN4-212ENST00000494815 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.08■■□□□ 1.29
TSPAN4-212ENST00000494815 ANXA1P04083 346 aa23.07■■□□□ 1.28
TSPAN4-212ENST00000494815 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
TSPAN4-212ENST00000494815 C5P01031 1676 aa23.07■■□□□ 1.28
TSPAN4-212ENST00000494815 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.07■■□□□ 1.28
TSPAN4-212ENST00000494815 ADCY9O60503 1353 aa23.07■■□□□ 1.28
TSPAN4-212ENST00000494815 PROSER3Q2NL68 480 aa23.07■■□□□ 1.28
TSPAN4-212ENST00000494815 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.07■■□□□ 1.28
TSPAN4-212ENST00000494815 LNPKQ9C0E8 428 aa23.07■■□□□ 1.28
TSPAN4-212ENST00000494815 PIP4K2BP78356 416 aa23.06■■□□□ 1.28
TSPAN4-212ENST00000494815 PDIA6Q15084 440 aa23.06■■□□□ 1.28
TSPAN4-212ENST00000494815 BEND3Q5T5X7 828 aa23.05■■□□□ 1.28
TSPAN4-212ENST00000494815 KSR2Q6VAB6 950 aa23.05■■□□□ 1.28
TSPAN4-212ENST00000494815 USP44Q9H0E7 712 aa23.05■■□□□ 1.28
TSPAN4-212ENST00000494815 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
TSPAN4-212ENST00000494815 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
TSPAN4-212ENST00000494815 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.03■■□□□ 1.28
TSPAN4-212ENST00000494815 GLI3P10071 1580 aa23.03■■□□□ 1.28
TSPAN4-212ENST00000494815 PAPPAQ13219 1627 aa23.02■■□□□ 1.28
TSPAN4-212ENST00000494815 UBR2Q8IWV8 1755 aa23.02■■□□□ 1.28
TSPAN4-212ENST00000494815 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.01■■□□□ 1.27
TSPAN4-212ENST00000494815 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.01■■□□□ 1.27
TSPAN4-212ENST00000494815 ALDH1L1O75891 902 aa23.01■■□□□ 1.27
TSPAN4-212ENST00000494815 ADAMTS2O95450 1211 aa23.01■■□□□ 1.27
TSPAN4-212ENST00000494815 TNS2Q63HR2 1409 aa23■■□□□ 1.27
TSPAN4-212ENST00000494815 LAMB4A4D0S4 1761 aa23■■□□□ 1.27
TSPAN4-212ENST00000494815 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
TSPAN4-212ENST00000494815 ERBB4Q15303 1308 aa23■■□□□ 1.27
TSPAN4-212ENST00000494815 USP16Q9Y5T5 823 aa23■■□□□ 1.27
TSPAN4-212ENST00000494815 NRAPQ86VF7 1730 aa22.99■■□□□ 1.27
TSPAN4-212ENST00000494815 ATP8B2P98198 1209 aa22.99■■□□□ 1.27
TSPAN4-212ENST00000494815 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
TSPAN4-212ENST00000494815 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
TSPAN4-212ENST00000494815 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.99■■□□□ 1.27
TSPAN4-212ENST00000494815 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.99■■□□□ 1.27
TSPAN4-212ENST00000494815 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
TSPAN4-212ENST00000494815 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.98■■□□□ 1.27
TSPAN4-212ENST00000494815 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.98■■□□□ 1.27
TSPAN4-212ENST00000494815 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4-212ENST00000494815 LINS1Q8NG48 757 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4-212ENST00000494815 LRP6O75581 1613 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4-212ENST00000494815 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-212ENST00000494815 EXOC5O00471 708 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-212ENST00000494815 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-212ENST00000494815 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-212ENST00000494815 MYL6BP14649 208 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-212ENST00000494815 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-212ENST00000494815 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-212ENST00000494815 SLIT2O94813 1529 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-212ENST00000494815 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-212ENST00000494815 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-212ENST00000494815 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-212ENST00000494815 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-212ENST00000494815 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-212ENST00000494815 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-212ENST00000494815 COPS6Q7L5N1 327 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-212ENST00000494815 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN4-212ENST00000494815 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN4-212ENST00000494815 SSH3Q8TE77 659 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN4-212ENST00000494815 JCADQ9P266 1359 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4-212ENST00000494815 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-212ENST00000494815 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-212ENST00000494815 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-212ENST00000494815 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-212ENST00000494815 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-212ENST00000494815 UTYO14607 1347 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-212ENST00000494815 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-212ENST00000494815 PIGBQ92521 554 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-212ENST00000494815 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-212ENST00000494815 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-212ENST00000494815 POLA2Q14181 598 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-212ENST00000494815 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-212ENST00000494815 MTX1Q13505 466 aa22.89■■□□□ 1.26
TSPAN4-212ENST00000494815 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
TSPAN4-212ENST00000494815 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
TSPAN4-212ENST00000494815 BCL9O00512 1426 aa22.89■■□□□ 1.25
TSPAN4-212ENST00000494815 SEC24BO95487 1268 aa22.89■■□□□ 1.25
TSPAN4-212ENST00000494815 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.89■■□□□ 1.25
TSPAN4-212ENST00000494815 GRM8O00222 908 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-212ENST00000494815 BARGINQ6ZT62 677 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-212ENST00000494815 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-212ENST00000494815 ITGB4P16144 1822 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-212ENST00000494815 NBPF26B4DH59 902 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-212ENST00000494815 IGKV5-2P06315 115 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-212ENST00000494815 NBPF14Q5TI25 921 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-212ENST00000494815 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-212ENST00000494815 NBPF15Q8N660 670 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-212ENST00000494815 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.9 ms