RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485176.1

PRKCE-211, Transcript of protein kinase C epsilon, human

TSL 2

Gene PRKCE, Length 372 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCE-211	ENST00000485176	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRKCE-211	ENST00000485176	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176		E9PSI1	815 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176		H3BRB1	525 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	ABL1	P00519	1130 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	IRS1	P35568	1242 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	MTFR1	Q15390	333 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	NPR3	P17342	541 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	SCNN1A	P37088	669 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	TNS4	Q8IZW8	715 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	NBPF15	Q8N660	670 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	XAGE2	Q96GT9	111 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	SEPT3	Q9UH03	358 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176		A6NJY4	79 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176		H3BM21	787 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	CDK2AP1	O14519	115 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	FAM13A	O94988	1023 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	ADH1A	P07327	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	NR3C2	P08235	984 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	SMTN	P53814	917 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	KANK3	Q6NY19	840 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	LGR5	O75473	907 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	SLURP2	P0DP57	97 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	CLN3	Q13286	438 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	NNT	Q13423	1086 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	COL19A1	Q14993	1142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	ECM1	Q16610	540 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	C16orf46	Q6P387	395 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	POTEA	Q6S8J7	498 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176		Q6ZVU0	165 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176		A0A1W2PRU2	124 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	ALDH1A1	P00352	501 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	IL2RA	P01589	272 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	MAPK1	P28482	360 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	TLR1	Q15399	786 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	CNKSR1	Q969H4	720 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	ZNF428	Q96B54	188 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	ASB16	Q96NS5	453 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	PTGIR	P43119	386 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	ARHGAP4	P98171	946 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	TEAD4	Q15561	434 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	KIFC2	Q96AC6	838 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	MYO19	Q96H55	970 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	CITED4	Q96RK1	184 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PRKCE-211	ENST00000485176	SERTM1	A2A2V5	107 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRKCE-211	ENST00000485176	NDUFB5	O43674	189 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRKCE-211	ENST00000485176	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PRKCE-211	ENST00000485176	VEGFB	P49765	207 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRKCE-211	ENST00000485176	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PRKCE-211	ENST00000485176	ABTB2	Q8N961	1025 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRKCE-211	ENST00000485176	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PRKCE-211	ENST00000485176	NLRP3	Q96P20	1036 aa		4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms