RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 RUBCNLQ9H714 662 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 MBIPQ9NS73 344 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 A6NJR5 290 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 A6NJY4 79 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 AIDAQ96BJ3 306 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF358Q9NW07 568 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 EFHC2Q5JST6 749 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 SLC4A9Q96Q91 983 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 CABP1Q9NZU7 370 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 MTFR1Q15390 333 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 NBPF1Q3BBV0 1214 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 TPCN2Q8NHX9 752 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 BICRAQ9NZM4 1560 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 IGF1RP08069 1367 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-211ENST00000484135 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 CDK2AP1O14519 115 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 BCRP11274 1271 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 MX2P20592 715 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 PHF24Q9UPV7 400 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 KIAA1024Q9UPX6 916 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 USP3Q9Y6I4 520 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 THBS1P07996 1170 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 CLDN10P78369 228 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC102BQ68D86 513 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 OGFOD1Q8N543 542 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 TATP17735 454 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 C1orf216Q8TAB5 229 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 PROCP04070 461 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 ATP4AP20648 1035 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 CFHR5Q9BXR6 569 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 PARP3Q9Y6F1 533 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 TBCELQ5QJ74 424 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 SLC9A9Q8IVB4 645 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 TNS4Q8IZW8 715 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 LARGE2Q8N3Y3 721 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 ABHD17AQ96GS6 310 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 RASA1P20936 1047 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 FIGNL1Q6PIW4 674 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 BICDL1Q6ZP65 573 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 SIX5Q8N196 739 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 GJA3Q9Y6H8 435 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-211ENST00000484135 MAP2K3P46734 347 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 EPHA4P54764 986 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PNR3 127 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 SFI1A8K8P3 1242 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 ITGB2P05107 769 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 FGFR3P22607 806 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 NLRP8Q86W28 1048 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 LRRC4BQ9NT99 713 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 DCDC2BA2VCK2 349 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 BNIP3LO60238 219 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 BMP4P12644 408 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 NOS2P35228 1153 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 TXLNAP40222 546 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 TEAD4Q15561 434 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 Q8N3U1 123 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 L3MBTL2Q969R5 705 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 ACDQ96AP0 544 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 SERTM1A2A2V5 107 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 M0R2N6 131 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 BAG6P46379 1132 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 ZIC5Q96T25 663 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 NDFIP2Q9NV92 336 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 USP17L15C9J2P7 530 aa8.47□□□□□ -1.05
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