RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-208ENST00000482785 OATP04181 439 aa5.97□□□□□ -1.45
SHQ1-208ENST00000482785 TMEM259Q4ZIN3 620 aa5.97□□□□□ -1.45
SHQ1-208ENST00000482785 TMCO4Q5TGY1 634 aa5.97□□□□□ -1.45
SHQ1-208ENST00000482785 MYSM1Q5VVJ2 828 aa5.97□□□□□ -1.45
SHQ1-208ENST00000482785 C9orf131Q5VYM1 1079 aa5.97□□□□□ -1.45
SHQ1-208ENST00000482785 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP5.97□□□□□ -1.45
SHQ1-208ENST00000482785 CDHR5Q9HBB8 845 aa5.97□□□□□ -1.45
SHQ1-208ENST00000482785 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa5.97□□□□□ -1.45
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SHQ1-208ENST00000482785 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
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SHQ1-208ENST00000482785 TNS3Q68CZ2 1445 aa5.91□□□□□ -1.46
SHQ1-208ENST00000482785 TUSC1Q2TAM9 212 aa5.91□□□□□ -1.46
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SHQ1-208ENST00000482785 TYW1BQ6NUM6 668 aa5.91□□□□□ -1.46
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SHQ1-208ENST00000482785 LRRC4BQ9NT99 713 aa5.91□□□□□ -1.46
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SHQ1-208ENST00000482785 ZNF710Q8N1W2 664 aa5.9□□□□□ -1.46
SHQ1-208ENST00000482785 MTMR14Q8NCE2 650 aa5.9□□□□□ -1.46
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SHQ1-208ENST00000482785 POTECB2RU33 542 aa5.89□□□□□ -1.47
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SHQ1-208ENST00000482785 MARVELD3Q96A59 401 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-208ENST00000482785 RNF181Q9P0P0 153 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-208ENST00000482785 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-208ENST00000482785 PASKQ96RG2 1323 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-208ENST00000482785 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SHQ1-208ENST00000482785 MUC6Q6W4X9 2439 aa5.88□□□□□ -1.47
SHQ1-208ENST00000482785 ATRXP46100 2492 aa5.88□□□□□ -1.47
SHQ1-208ENST00000482785 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
SHQ1-208ENST00000482785 KAT6BQ8WYB5 2073 aa5.88□□□□□ -1.47
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