RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479433.5

FBXO18-211, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 3

Gene FBXO18, Length 527 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-211ENST00000479433 SCN7AQ01118 1682 aa8.68□□□□□ -1.02
FBXO18-211ENST00000479433 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
FBXO18-211ENST00000479433 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa8.67□□□□□ -1.02
FBXO18-211ENST00000479433 PRKAR2BP31323 418 aa8.67□□□□□ -1.02
FBXO18-211ENST00000479433 RFC4P35249 363 aa8.67□□□□□ -1.02
FBXO18-211ENST00000479433 TGFB2P61812 414 aa8.67□□□□□ -1.02
FBXO18-211ENST00000479433 NFIXQ14938 502 aa8.67□□□□□ -1.02
FBXO18-211ENST00000479433 USPL1Q5W0Q7 1092 aa8.67□□□□□ -1.02
FBXO18-211ENST00000479433 HEG1Q9ULI3 1381 aa8.67□□□□□ -1.02
FBXO18-211ENST00000479433 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa8.66□□□□□ -1.02
FBXO18-211ENST00000479433 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa8.66□□□□□ -1.02
FBXO18-211ENST00000479433 GNAT3A8MTJ3 354 aa8.66□□□□□ -1.02
FBXO18-211ENST00000479433 KIF3CO14782 793 aa8.66□□□□□ -1.02
FBXO18-211ENST00000479433 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
FBXO18-211ENST00000479433 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
FBXO18-211ENST00000479433 ZNF790Q6PG37 636 aa8.66□□□□□ -1.02
FBXO18-211ENST00000479433 PLEKHF1Q96S99 279 aa8.66□□□□□ -1.02
FBXO18-211ENST00000479433 NARFQ9UHQ1 456 aa8.66□□□□□ -1.02
FBXO18-211ENST00000479433 DLEC1Q9Y238 1755 aa8.66□□□□□ -1.02
FBXO18-211ENST00000479433 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
FBXO18-211ENST00000479433 CHRNA5P30532 468 aa8.65□□□□□ -1.02
FBXO18-211ENST00000479433 GAS2L2Q8NHY3 880 aa8.65□□□□□ -1.02
FBXO18-211ENST00000479433 BCORQ6W2J9 1755 aa8.64□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 NBPF26B4DH59 902 aa8.64□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 CAMTA2O94983 1202 aa8.64□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 A1BGP04217 495 aa8.64□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 DCTN1Q14203 1278 aa8.64□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 NBPF15Q8N660 670 aa8.64□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 FCHSD2O94868 740 aa8.63□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 TBC1D9BQ66K14 1250 aa8.63□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 MCM10Q7L590 875 aa8.63□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 USP16Q9Y5T5 823 aa8.63□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 PARP3Q9Y6F1 533 aa8.63□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 KDM3BQ7LBC6 1761 aa8.63□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 SBF1O95248 1867 aa8.62□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 CANXP27824 592 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 BCS1LQ9Y276 419 aa8.62□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 DLG5Q8TDM6 1919 aa8.62□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 NFKBIEO00221 500 aa8.61□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 SERPINB2P05120 415 aa8.61□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP8.61□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 LRP10Q7Z4F1 713 aa8.61□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa8.61□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 SNED1Q8TER0 1413 aa8.61□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 STARD3NLO95772 234 aa8.6□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 TEFQ10587 303 aa8.6□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 PRR5LQ6MZQ0 368 aa8.6□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 FMNL2Q96PY5 1086 aa8.6□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 NMRK2Q9NPI5 230 aa8.6□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 MIS18AQ9NYP9 233 aa8.6□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 PIM2Q9P1W9 311 aa8.6□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa8.59□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 BTBD11A6QL63 1104 aa8.59□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 ZPR1O75312 459 aa8.59□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 C9orf131Q5VYM1 1079 aa8.59□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 CCDC24Q8N4L8 307 aa8.59□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 CFAP53Q96M91 514 aa8.59□□□□□ -1.03
FBXO18-211ENST00000479433 LAMB4A4D0S4 1761 aa8.58□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 RASSF7Q02833 373 aa8.58□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa8.58□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 SLC51AQ86UW1 340 aa8.58□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 TTC5Q8N0Z6 440 aa8.58□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.58□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 SLX4Q8IY92 1834 aa8.57□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 POTECB2RU33 542 aa8.57□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 NFE2L2Q16236 605 aa8.57□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa8.57□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 BRIP1Q9BX63 1249 aa8.57□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 NUDCQ9Y266 331 aa8.57□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa8.57□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa8.56□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 A0A087WZG4 1122 aa8.56□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 RGL2O15211 777 aa8.56□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 SRGNP10124 158 aa8.56□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 HSPA6P17066 643 aa8.56□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 PDIA6Q15084 440 aa8.56□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 HLFQ16534 295 aa8.56□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 BICDL1Q6ZP65 573 aa8.56□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 C2CD5Q86YS7 1000 aa8.56□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 ABCC12Q96J65 1359 aa8.56□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 COL4A5P29400 1685 aa8.56□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 TTLL7Q6ZT98 887 aa8.55□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
FBXO18-211ENST00000479433 TTLL6Q8N841 843 aa8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms