RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa8.39□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 SMIM5Q71RC9 77 aa8.39□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 KNSTRNQ9Y448 316 aa8.39□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 STK24Q9Y6E0 443 aa8.39□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 C4BP0C0L5 1744 aa8.39□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 SCN11AQ9UI33 1791 aa8.38□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 SLC27A3Q5K4L6 730 aa8.38□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 AEBP1Q8IUX7 1158 aa8.38□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 MTFR1LQ9H019 292 aa8.38□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 SPG7Q9UQ90 795 aa8.38□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 PALLDQ8WX93 1383 aa8.37□□□□□ -1.07
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MITF-215ENST00000478490 MSL1Q68DK7 614 aa8.37□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 PIGBQ92521 554 aa8.37□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 STK25O00506 426 aa8.36□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 PHKG2P15735 406 aa8.36□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 IFNL2Q8IZJ0 200 aa8.36□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 ASAP1Q9ULH1 1129 aa8.36□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 IGSF1Q8N6C5 1336 aa8.35□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 AMIGO3Q86WK7 504 aa8.35□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 SYT17Q9BSW7 474 aa8.35□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 TMOD3Q9NYL9 352 aa8.35□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 PHF14O94880 888 aa8.34□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 YY1P25490 414 aa8.34□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 SULT6B1Q6IMI4 303 aa8.34□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 LINC00116Q8NCU8 138 aa8.34□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 NEFLP07196 543 aa8.33□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 HMOX1P09601 288 aa8.33□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 POLD1P28340 1107 aa8.33□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 IL13P35225 146 aa8.33□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 MTHFSP49914 203 aa8.33□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 C3orf67Q6ZVT6 689 aa8.33□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 MS4A4AQ96JQ5 239 aa8.33□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.33□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 ITPK1Q13572 414 aa8.32□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 NLGN2Q8NFZ4 835 aa8.32□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 AK7Q96M32 723 aa8.32□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 ATG3Q9NT62 314 aa8.32□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 C4AP0C0L4 1744 aa8.32□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 TJP1Q07157 1748 aa8.32□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa8.32□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 ATP6V1AP38606 617 aa8.32□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 SIK1P57059 783 aa8.32□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 HOMEZQ8IX15 550 aa8.32□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 SLC16A10Q8TF71 515 aa8.32□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 CABP4P57796 275 aa8.31□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 TPRNQ4KMQ1 711 aa8.31□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 SLC4A9Q96Q91 983 aa8.31□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 MRS2Q9HD23 443 aa8.31□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 ZNF831Q5JPB2 1677 aa8.3□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 G3V3G9 751 aa8.3□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 GNPATO15228 680 aa8.3□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 PLCB2Q00722 1185 aa8.3□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 RALBP1Q15311 655 aa8.3□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 GPR162Q16538 588 aa8.3□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 C1orf141Q5JVX7 400 aa8.3□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 WWC3Q9ULE0 1092 aa8.3□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 DLG5Q8TDM6 1919 aa8.29□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 ERVV-2B6SEH9 535 aa8.29□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 AMOTQ4VCS5 1084 aa8.29□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa8.29□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 DCAF5Q96JK2 942 aa8.29□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 LGR6Q9HBX8 967 aa8.29□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 MFRPQ9BY79 579 aa8.29□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 KDRP35968 1356 aa8.28□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 ERICH6BQ5W0A0 696 aa8.28□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.28□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 ZBED9Q6R2W3 1325 aa8.27□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 UBR2Q8IWV8 1755 aa8.27□□□□□ -1.08
MITF-215ENST00000478490 MAP3K5Q99683 1374 aa8.27□□□□□ -1.09
MITF-215ENST00000478490 KIF13BQ9NQT8 1826 aa8.27□□□□□ -1.09
MITF-215ENST00000478490 POTEMA6NI47 508 aa8.27□□□□□ -1.09
MITF-215ENST00000478490 SLC39A6Q13433 755 aa8.27□□□□□ -1.09
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