RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 SLC4A3P48751 1232 aa23.76■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.76■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 GNAI2P04899 355 aa23.75■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.74■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 DCTPP1Q9H773 170 aa23.74■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 ANXA1P04083 346 aa23.74■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.74■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.73■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.73■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 PAPPAQ13219 1627 aa23.73■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 PROSER3Q2NL68 480 aa23.72■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 ADCY9O60503 1353 aa23.72■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.72■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 HMMRO75330 724 aa23.72■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 PDIA6Q15084 440 aa23.72■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 NFKBIBQ15653 356 aa23.72■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.72■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 GLI3P10071 1580 aa23.72■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 NRAPQ86VF7 1730 aa23.71■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.71■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 UBR2Q8IWV8 1755 aa23.71■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.71■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 BEND3Q5T5X7 828 aa23.71■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 KSR2Q6VAB6 950 aa23.71■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 LNPKQ9C0E8 428 aa23.71■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 ADAMTS2O95450 1211 aa23.7■■□□□ 1.38
SYF2-204ENST00000476231 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
SYF2-204ENST00000476231 USP44Q9H0E7 712 aa23.7■■□□□ 1.38
SYF2-204ENST00000476231 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.7■■□□□ 1.38
SYF2-204ENST00000476231 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.68■■□□□ 1.38
SYF2-204ENST00000476231 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
SYF2-204ENST00000476231 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.67■■□□□ 1.38
SYF2-204ENST00000476231 USP16Q9Y5T5 823 aa23.67■■□□□ 1.38
SYF2-204ENST00000476231 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
SYF2-204ENST00000476231 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.66■■□□□ 1.38
SYF2-204ENST00000476231 ALDH1L1O75891 902 aa23.66■■□□□ 1.38
SYF2-204ENST00000476231 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SYF2-204ENST00000476231 TNS2Q63HR2 1409 aa23.66■■□□□ 1.38
SYF2-204ENST00000476231 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.65■■□□□ 1.38
SYF2-204ENST00000476231 LRP6O75581 1613 aa23.65■■□□□ 1.38
SYF2-204ENST00000476231 ERBB4Q15303 1308 aa23.65■■□□□ 1.38
SYF2-204ENST00000476231 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SYF2-204ENST00000476231 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SYF2-204ENST00000476231 ATP8B2P98198 1209 aa23.65■■□□□ 1.38
SYF2-204ENST00000476231 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SYF2-204ENST00000476231 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.65■■□□□ 1.38
SYF2-204ENST00000476231 EXOC5O00471 708 aa23.64■■□□□ 1.38
SYF2-204ENST00000476231 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
SYF2-204ENST00000476231 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa23.64■■□□□ 1.37
SYF2-204ENST00000476231 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.63■■□□□ 1.37
SYF2-204ENST00000476231 SLIT2O94813 1529 aa23.63■■□□□ 1.37
SYF2-204ENST00000476231 MYL6BP14649 208 aa23.63■■□□□ 1.37
SYF2-204ENST00000476231 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SYF2-204ENST00000476231 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SYF2-204ENST00000476231 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.62■■□□□ 1.37
SYF2-204ENST00000476231 LINS1Q8NG48 757 aa23.61■■□□□ 1.37
SYF2-204ENST00000476231 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SYF2-204ENST00000476231 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.61■■□□□ 1.37
SYF2-204ENST00000476231 JCADQ9P266 1359 aa23.6■■□□□ 1.37
SYF2-204ENST00000476231 COPS6Q7L5N1 327 aa23.6■■□□□ 1.37
SYF2-204ENST00000476231 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.6■■□□□ 1.37
SYF2-204ENST00000476231 HDAC5Q9UQL6 1122 aa23.6■■□□□ 1.37
SYF2-204ENST00000476231 ITGB4P16144 1822 aa23.6■■□□□ 1.37
SYF2-204ENST00000476231 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.59■■□□□ 1.37
SYF2-204ENST00000476231 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SYF2-204ENST00000476231 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
SYF2-204ENST00000476231 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa23.58■■□□□ 1.37
SYF2-204ENST00000476231 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa23.58■■□□□ 1.37
SYF2-204ENST00000476231 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.58■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 PIGBQ92521 554 aa23.58■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.57■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.57■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 SSH3Q8TE77 659 aa23.57■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.57■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.56■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 BARGINQ6ZT62 677 aa23.55■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 UTYO14607 1347 aa23.55■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 BCL9O00512 1426 aa23.55■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 POLA2Q14181 598 aa23.54■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 DDB1Q16531 1140 aa23.54■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa23.54■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.53■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 NBPF26B4DH59 902 aa23.53■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 GRM8O00222 908 aa23.53■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 IGKV5-2P06315 115 aa23.53■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 GSE1Q14687 1217 aa23.53■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 NBPF14Q5TI25 921 aa23.53■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.53■■□□□ 1.36
SYF2-204ENST00000476231 NBPF15Q8N660 670 aa23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms