RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471978.5

C9orf3-213, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 478 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-213ENST00000471978 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP30.17■■■□□ 2.421e-6■■■■□ 22.3
C9orf3-213ENST00000471978 COL15A1P39059 1388 aa30.16■■■□□ 2.42
C9orf3-213ENST00000471978 ZNF790Q6PG37 636 aa30.16■■■□□ 2.42
C9orf3-213ENST00000471978 STARD3NLO95772 234 aa30.15■■■□□ 2.42
C9orf3-213ENST00000471978 TM4SF1P30408 202 aa30.15■■■□□ 2.42
C9orf3-213ENST00000471978 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
C9orf3-213ENST00000471978 NARFQ9UHQ1 456 aa30.15■■■□□ 2.42
C9orf3-213ENST00000471978 ADCY9O60503 1353 aa30.15■■■□□ 2.42
C9orf3-213ENST00000471978 CANXP27824 592 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
C9orf3-213ENST00000471978 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa30.14■■■□□ 2.41
C9orf3-213ENST00000471978 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
C9orf3-213ENST00000471978 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
C9orf3-213ENST00000471978 HEG1Q9ULI3 1381 aa30.12■■■□□ 2.41
C9orf3-213ENST00000471978 FCHSD2O94868 740 aa30.11■■■□□ 2.41
C9orf3-213ENST00000471978 KCNA3P22001 575 aa30.11■■■□□ 2.41
C9orf3-213ENST00000471978 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
C9orf3-213ENST00000471978 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
C9orf3-213ENST00000471978 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
C9orf3-213ENST00000471978 FMNL2Q96PY5 1086 aa30.09■■■□□ 2.41
C9orf3-213ENST00000471978 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa30.08■■■□□ 2.41
C9orf3-213ENST00000471978 BTBD11A6QL63 1104 aa30.08■■■□□ 2.41
C9orf3-213ENST00000471978 EIF5P55010 431 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
C9orf3-213ENST00000471978 NFIXQ14938 502 aa30.08■■■□□ 2.41
C9orf3-213ENST00000471978 PIM2Q9P1W9 311 aa30.08■■■□□ 2.41
C9orf3-213ENST00000471978 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa30.07■■■□□ 2.4
C9orf3-213ENST00000471978 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
C9orf3-213ENST00000471978 BCL2L12Q9HB09 334 aa30.07■■■□□ 2.4
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C9orf3-213ENST00000471978 A0A087WZG4 1122 aa30.06■■■□□ 2.4
C9orf3-213ENST00000471978 KCNQ3O43525 872 aa30.05■■■□□ 2.4
C9orf3-213ENST00000471978 CHRNA5P30532 468 aa30.04■■■□□ 2.4
C9orf3-213ENST00000471978 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
C9orf3-213ENST00000471978 MCM10Q7L590 875 aa30.04■■■□□ 2.4
C9orf3-213ENST00000471978 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
C9orf3-213ENST00000471978 SERPINB2P05120 415 aa30.01■■■□□ 2.39
C9orf3-213ENST00000471978 A1BGP04217 495 aa30■■■□□ 2.39
C9orf3-213ENST00000471978 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
C9orf3-213ENST00000471978 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
C9orf3-213ENST00000471978 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
C9orf3-213ENST00000471978 DCTN1Q14203 1278 aa29.99■■■□□ 2.39
C9orf3-213ENST00000471978 BICDL1Q6ZP65 573 aa29.99■■■□□ 2.39
C9orf3-213ENST00000471978 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa29.99■■■□□ 2.39
C9orf3-213ENST00000471978 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa29.99■■■□□ 2.39
C9orf3-213ENST00000471978 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
C9orf3-213ENST00000471978 NRXN2Q9P2S2 1712 aa29.98■■■□□ 2.39
C9orf3-213ENST00000471978 NEFMP07197 916 aa29.96■■■□□ 2.39
C9orf3-213ENST00000471978 TBC1D9BQ66K14 1250 aa29.95■■■□□ 2.39
C9orf3-213ENST00000471978 USP16Q9Y5T5 823 aa29.95■■■□□ 2.39
C9orf3-213ENST00000471978 CEP350Q5VT06 3117 aa29.94■■■□□ 2.38
C9orf3-213ENST00000471978 SCN7AQ01118 1682 aa29.93■■■□□ 2.38
C9orf3-213ENST00000471978 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa29.93■■■□□ 2.38
C9orf3-213ENST00000471978 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
C9orf3-213ENST00000471978 C9orf131Q5VYM1 1079 aa29.92■■■□□ 2.38
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C9orf3-213ENST00000471978 CARMIL3Q8ND23 1372 aa29.9■■■□□ 2.38
C9orf3-213ENST00000471978 CAMTA2O94983 1202 aa29.9■■■□□ 2.38
C9orf3-213ENST00000471978 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
C9orf3-213ENST00000471978 C2CD5Q86YS7 1000 aa29.9■■■□□ 2.38
C9orf3-213ENST00000471978 PLEKHF1Q96S99 279 aa29.9■■■□□ 2.38
C9orf3-213ENST00000471978 H0YIN7 160 aa29.89■■■□□ 2.38
C9orf3-213ENST00000471978 KIF3CO14782 793 aa29.89■■■□□ 2.38
C9orf3-213ENST00000471978 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
C9orf3-213ENST00000471978 MIS18AQ9NYP9 233 aa29.88■■■□□ 2.37
C9orf3-213ENST00000471978 TTLL6Q8N841 843 aa29.87■■■□□ 2.37
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C9orf3-213ENST00000471978 RNF181Q9P0P0 153 aa29.86■■■□□ 2.37
C9orf3-213ENST00000471978 DLEC1Q9Y238 1755 aa29.85■■■□□ 2.37
C9orf3-213ENST00000471978 NFE2L2Q16236 605 aa29.85■■■□□ 2.37
C9orf3-213ENST00000471978 PRR5LQ6MZQ0 368 aa29.85■■■□□ 2.37
C9orf3-213ENST00000471978 BRIP1Q9BX63 1249 aa29.85■■■□□ 2.37
C9orf3-213ENST00000471978 RALBP1Q15311 655 aa29.84■■■□□ 2.37
C9orf3-213ENST00000471978 CCDC24Q8N4L8 307 aa29.84■■■□□ 2.37
C9orf3-213ENST00000471978 DLG5Q8TDM6 1919 aa29.84■■■□□ 2.37
C9orf3-213ENST00000471978 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.83■■■□□ 2.37
C9orf3-213ENST00000471978 PDE6BP35913 854 aa29.83■■■□□ 2.37
C9orf3-213ENST00000471978 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
C9orf3-213ENST00000471978 BCORQ6W2J9 1755 aa29.82■■■□□ 2.36
C9orf3-213ENST00000471978 NPHP1O15259 732 aa29.82■■■□□ 2.36
C9orf3-213ENST00000471978 CNBD1Q8NA66 436 aa29.82■■■□□ 2.36
C9orf3-213ENST00000471978 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa29.82■■■□□ 2.36
C9orf3-213ENST00000471978 NBPF26B4DH59 902 aa29.81■■■□□ 2.36
C9orf3-213ENST00000471978 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
C9orf3-213ENST00000471978 NBPF15Q8N660 670 aa29.81■■■□□ 2.36
C9orf3-213ENST00000471978 NMRK2Q9NPI5 230 aa29.81■■■□□ 2.36
C9orf3-213ENST00000471978 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa29.8■■■□□ 2.36
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C9orf3-213ENST00000471978 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP29.8■■■□□ 2.36
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C9orf3-213ENST00000471978 HSPA6P17066 643 aa29.78■■■□□ 2.36
C9orf3-213ENST00000471978 ST5P78524 1137 aa29.78■■■□□ 2.36
C9orf3-213ENST00000471978 SBF1O95248 1867 aa29.78■■■□□ 2.36
C9orf3-213ENST00000471978 KDM3BQ7LBC6 1761 aa29.76■■■□□ 2.35
C9orf3-213ENST00000471978 KDM2BQ8NHM5 1336 aa29.75■■■□□ 2.35
C9orf3-213ENST00000471978 TOMM70O94826 608 aa29.75■■■□□ 2.35
C9orf3-213ENST00000471978 LMNB1P20700 586 aa29.75■■■□□ 2.35
C9orf3-213ENST00000471978 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
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