RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 GPR162Q16538 588 aa25■■□□□ 1.59
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25■■□□□ 1.59
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25■■□□□ 1.59
TRAPPC10-208ENST00000469521 C10orf71Q711Q0 1435 aa25■■□□□ 1.59
TRAPPC10-208ENST00000469521 SCN7AQ01118 1682 aa25■■□□□ 1.59
TRAPPC10-208ENST00000469521 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC10-208ENST00000469521 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC10-208ENST00000469521 NFE2L2Q16236 605 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC10-208ENST00000469521 DCTN1Q14203 1278 aa24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC10-208ENST00000469521 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC10-208ENST00000469521 KCNQ3O43525 872 aa24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZPR1O75312 459 aa24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC10-208ENST00000469521 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC10-208ENST00000469521 FKBP8Q14318 412 aa24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC10-208ENST00000469521 NARFQ9UHQ1 456 aa24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC10-208ENST00000469521 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC10-208ENST00000469521 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC10-208ENST00000469521 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC10-208ENST00000469521 BCORQ6W2J9 1755 aa24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC10-208ENST00000469521 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC10-208ENST00000469521 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC10-208ENST00000469521 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC10-208ENST00000469521 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC10-208ENST00000469521 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC10-208ENST00000469521 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC10-208ENST00000469521 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC10-208ENST00000469521 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC10-208ENST00000469521 GRIN3BO60391 1043 aa24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC10-208ENST00000469521 A0A087WZG4 1122 aa24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC10-208ENST00000469521 DDR1Q08345 913 aa24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC10-208ENST00000469521 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC10-208ENST00000469521 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC10-208ENST00000469521 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC10-208ENST00000469521 TGFB2P61812 414 aa24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC10-208ENST00000469521 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC10-208ENST00000469521 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC10-208ENST00000469521 TM4SF1P30408 202 aa24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC10-208ENST00000469521 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC10-208ENST00000469521 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10-208ENST00000469521 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-208ENST00000469521 A1BGP04217 495 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-208ENST00000469521 NFIXQ14938 502 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-208ENST00000469521 USP16Q9Y5T5 823 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-208ENST00000469521 DLEC1Q9Y238 1755 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10-208ENST00000469521 RIPK4P57078 832 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10-208ENST00000469521 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10-208ENST00000469521 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10-208ENST00000469521 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10-208ENST00000469521 RUNDC1Q96C34 613 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC10-208ENST00000469521 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC10-208ENST00000469521 A0A0G2JLW4 131 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC10-208ENST00000469521 DPEP1P16444 411 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC10-208ENST00000469521 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC10-208ENST00000469521 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC10-208ENST00000469521 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC10-208ENST00000469521 CAMTA2O94983 1202 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC10-208ENST00000469521 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC10-208ENST00000469521 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC10-208ENST00000469521 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC10-208ENST00000469521 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC10-208ENST00000469521 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC10-208ENST00000469521 NBPF26B4DH59 902 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10-208ENST00000469521 SERPINB2P05120 415 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10-208ENST00000469521 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10-208ENST00000469521 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10-208ENST00000469521 NBPF15Q8N660 670 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10-208ENST00000469521 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10-208ENST00000469521 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC10-208ENST00000469521 RGL2O15211 777 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-208ENST00000469521 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC10-208ENST00000469521 KCNA3P22001 575 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC10-208ENST00000469521 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC10-208ENST00000469521 BCS1LQ9Y276 419 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC10-208ENST00000469521 NEUROD2Q15784 382 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-208ENST00000469521 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-208ENST00000469521 PIM2Q9P1W9 311 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-208ENST00000469521 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC10-208ENST00000469521 ADCY9O60503 1353 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC10-208ENST00000469521 ERBB4Q15303 1308 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10-208ENST00000469521 SETDB2Q96T68 719 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC10-208ENST00000469521 CHRNA5P30532 468 aa24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC10-208ENST00000469521 NUP98P52948 1817 aa24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC10-208ENST00000469521 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC10-208ENST00000469521 CHL1O00533 1208 aa24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC10-208ENST00000469521 CNBD1Q8NA66 436 aa24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC10-208ENST00000469521 ATP10DQ9P241 1426 aa24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC10-208ENST00000469521 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC10-208ENST00000469521 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC10-208ENST00000469521 ANP32CO43423 234 aa24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC10-208ENST00000469521 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.64■■□□□ 1.54
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