RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468532.5

CHKB-205, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 5

Gene CHKB, Length 1,052 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-205ENST00000468532 COL15A1P39059 1388 aa41.13■■■■■ 4.18
CHKB-205ENST00000468532 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
CHKB-205ENST00000468532 CANXP27824 592 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
CHKB-205ENST00000468532 GPR162Q16538 588 aa41.12■■■■■ 4.17
CHKB-205ENST00000468532 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
CHKB-205ENST00000468532 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP41.11■■■■■ 4.17
CHKB-205ENST00000468532 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
CHKB-205ENST00000468532 ZPR1O75312 459 aa41.09■■■■■ 4.17
CHKB-205ENST00000468532 FKBP8Q14318 412 aa41.08■■■■■ 4.17
CHKB-205ENST00000468532 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.17
CHKB-205ENST00000468532 USPL1Q5W0Q7 1092 aa41.06■■■■■ 4.16
CHKB-205ENST00000468532 PARP3Q9Y6F1 533 aa41.06■■■■■ 4.16
CHKB-205ENST00000468532 CCDC146Q8IYE0 955 aa41.05■■■■■ 4.16
CHKB-205ENST00000468532 MIS18AQ9NYP9 233 aa41.05■■■■■ 4.16
CHKB-205ENST00000468532 YY1P25490 414 aa41.04■■■■■ 4.16
CHKB-205ENST00000468532 NARFQ9UHQ1 456 aa41.04■■■■■ 4.16
CHKB-205ENST00000468532 KDM3BQ7LBC6 1761 aa41.04■■■■■ 4.16
CHKB-205ENST00000468532 RIPK4P57078 832 aa41.03■■■■■ 4.16
CHKB-205ENST00000468532 KIF13BQ9NQT8 1826 aa41.02■■■■■ 4.16
CHKB-205ENST00000468532 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
CHKB-205ENST00000468532 EIF5P55010 431 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
CHKB-205ENST00000468532 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
CHKB-205ENST00000468532 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa41.01■■■■■ 4.16
CHKB-205ENST00000468532 TMPOP42166 694 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
CHKB-205ENST00000468532 A1BGP04217 495 aa41■■■■■ 4.15
CHKB-205ENST00000468532 ADAMTS8Q9UP79 889 aa41■■■■■ 4.15
CHKB-205ENST00000468532 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP41■■■■■ 4.15
CHKB-205ENST00000468532 USP16Q9Y5T5 823 aa41■■■■■ 4.15
CHKB-205ENST00000468532 C10orf71Q711Q0 1435 aa41■■■■■ 4.15
CHKB-205ENST00000468532 UTRNP46939 3433 aa40.99■■■■■ 4.15
CHKB-205ENST00000468532 CHD4Q14839 1912 aa40.99■■■■■ 4.15
CHKB-205ENST00000468532 A0A087WZG4 1122 aa40.98■■■■■ 4.15
CHKB-205ENST00000468532 DDR1Q08345 913 aa40.98■■■■■ 4.15
CHKB-205ENST00000468532 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP40.97■■■■■ 4.15
CHKB-205ENST00000468532 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
CHKB-205ENST00000468532 RUNDC1Q96C34 613 aa40.97■■■■■ 4.15
CHKB-205ENST00000468532 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
CHKB-205ENST00000468532 LMOD3Q0VAK6 560 aa40.95■■■■■ 4.15
CHKB-205ENST00000468532 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
CHKB-205ENST00000468532 BCL2L12Q9HB09 334 aa40.94■■■■■ 4.14
CHKB-205ENST00000468532 TM4SF1P30408 202 aa40.93■■■■■ 4.14
CHKB-205ENST00000468532 NEUROD2Q15784 382 aa40.93■■■■■ 4.14
CHKB-205ENST00000468532 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa40.93■■■■■ 4.14
CHKB-205ENST00000468532 LAMB4A4D0S4 1761 aa40.92■■■■■ 4.14
CHKB-205ENST00000468532 SCN7AQ01118 1682 aa40.92■■■■■ 4.14
CHKB-205ENST00000468532 PXDNLA1KZ92 1463 aa40.92■■■■■ 4.14
CHKB-205ENST00000468532 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
CHKB-205ENST00000468532 WWC3Q9ULE0 1092 aa40.92■■■■■ 4.14
CHKB-205ENST00000468532 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
CHKB-205ENST00000468532 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
CHKB-205ENST00000468532 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
CHKB-205ENST00000468532 NFIXQ14938 502 aa40.9■■■■■ 4.14
CHKB-205ENST00000468532 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa40.9■■■■■ 4.14
CHKB-205ENST00000468532 GRIN3BO60391 1043 aa40.89■■■■■ 4.14
CHKB-205ENST00000468532 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
CHKB-205ENST00000468532 TGFB2P61812 414 aa40.88■■■■■ 4.13
CHKB-205ENST00000468532 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
CHKB-205ENST00000468532 TSPYL4Q9UJ04 414 aa40.86■■■■■ 4.13
CHKB-205ENST00000468532 A0A0G2JLW4 131 aa40.84■■■■■ 4.13
CHKB-205ENST00000468532 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
CHKB-205ENST00000468532 BICDL1Q6ZP65 573 aa40.83■■■■■ 4.13
CHKB-205ENST00000468532 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
CHKB-205ENST00000468532 BCORQ6W2J9 1755 aa40.83■■■■■ 4.13
CHKB-205ENST00000468532 NRXN2Q9P2S2 1712 aa40.81■■■■■ 4.12
CHKB-205ENST00000468532 NBPF26B4DH59 902 aa40.81■■■■■ 4.12
CHKB-205ENST00000468532 DPEP1P16444 411 aa40.81■■■■■ 4.12
CHKB-205ENST00000468532 CCDC184Q52MB2 194 aa40.81■■■■■ 4.12
CHKB-205ENST00000468532 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
CHKB-205ENST00000468532 NBPF15Q8N660 670 aa40.81■■■■■ 4.12
CHKB-205ENST00000468532 TRIM35Q9UPQ4 493 aa40.81■■■■■ 4.12
CHKB-205ENST00000468532 ANP32CO43423 234 aa40.8■■■■■ 4.12
CHKB-205ENST00000468532 CAMTA2O94983 1202 aa40.8■■■■■ 4.12
CHKB-205ENST00000468532 SERPINB2P05120 415 aa40.79■■■■■ 4.12
CHKB-205ENST00000468532 TBC1D9BQ66K14 1250 aa40.79■■■■■ 4.12
CHKB-205ENST00000468532 BABAM1Q9NWV8 329 aa40.78■■■■■ 4.12
CHKB-205ENST00000468532 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
CHKB-205ENST00000468532 APAF1O14727 1248 aa40.72■■■■■ 4.11
CHKB-205ENST00000468532 BCS1LQ9Y276 419 aa40.72■■■■■ 4.11
CHKB-205ENST00000468532 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP40.71■■■■■ 4.11
CHKB-205ENST00000468532 CARMIL3Q8ND23 1372 aa40.71■■■■■ 4.11
CHKB-205ENST00000468532 KCNA3P22001 575 aa40.7■■■■■ 4.11
CHKB-205ENST00000468532 CHRNA5P30532 468 aa40.69■■■■■ 4.1
CHKB-205ENST00000468532 CHL1O00533 1208 aa40.67■■■■■ 4.1
CHKB-205ENST00000468532 NGEFQ8N5V2 710 aa40.67■■■■■ 4.1
CHKB-205ENST00000468532 SETDB2Q96T68 719 aa40.67■■■■■ 4.1
CHKB-205ENST00000468532 MRS2Q9HD23 443 aa40.67■■■■■ 4.1
CHKB-205ENST00000468532 PIM2Q9P1W9 311 aa40.67■■■■■ 4.1
CHKB-205ENST00000468532 ZNF652Q9Y2D9 606 aa40.67■■■■■ 4.1
CHKB-205ENST00000468532 CLEC4GQ6UXB4 293 aa40.66■■■■■ 4.1
CHKB-205ENST00000468532 MYL6BP14649 208 aa40.65■■■■■ 4.1
CHKB-205ENST00000468532 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
CHKB-205ENST00000468532 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.09
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CHKB-205ENST00000468532 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa40.63■■■■■ 4.09
CHKB-205ENST00000468532 PRR5LQ6MZQ0 368 aa40.62■■■■■ 4.09
CHKB-205ENST00000468532 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa40.61■■■■■ 4.09
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CHKB-205ENST00000468532 NPHP1O15259 732 aa40.59■■■■■ 4.09
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