RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464710.1

IL6-208, Transcript of interleukin 6, human

TSL 4

Gene IL6, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IL6-208	ENST00000464710	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		10.78	□□□□□ -0.68
IL6-208	ENST00000464710	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
IL6-208	ENST00000464710	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	RPS6KA4	O75676	772 aa		10.77	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		10.77	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	AKT1S1	Q96B36	256 aa		10.77	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		10.77	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		10.77	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		10.76	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	VAMP4	O75379	141 aa		10.76	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	ZNF827	Q17R98	1081 aa		10.76	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		10.76	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		10.76	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	RFC4	P35249	363 aa		10.75	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		10.75	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	STK31	Q9BXU1	1019 aa		10.75	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		10.75	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	ANXA1	P04083	346 aa		10.74	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	SLC4A2	P04920	1241 aa		10.74	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	HOXB7	P09629	217 aa		10.74	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		10.74	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		10.74	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710		A0A087WZG4	1122 aa		10.73	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	NBPF26	B4DH59	902 aa		10.73	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	ZPR1	O75312	459 aa		10.73	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	NBPF15	Q8N660	670 aa		10.73	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	10.73	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		10.73	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	SSFA2	P28290	1259 aa		10.72	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	COPS6	Q7L5N1	327 aa		10.72	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	HYPK	Q9NX55	129 aa		10.72	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	10.72	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	10.72	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	ADRA2B	P18089	450 aa		10.71	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	PDIA6	Q15084	440 aa		10.71	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	PROSER3	Q2NL68	480 aa		10.71	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		10.71	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		10.71	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		10.71	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		10.71	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		10.71	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	10.71	□□□□□ -0.69
IL6-208	ENST00000464710	LY75	O60449	1722 aa		10.7	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	ERBB4	Q15303	1308 aa		10.7	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		10.7	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	10.7	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	10.7	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	10.7	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	ZBTB7A	O95365	584 aa		10.69	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	MSL1	Q68DK7	614 aa		10.69	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		10.69	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		10.69	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	G2E3	Q7L622	706 aa		10.69	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		10.69	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		10.69	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		10.69	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	NARF	Q9UHQ1	456 aa		10.69	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		10.69	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		10.68	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		10.68	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		10.68	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		10.68	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	ZNF428	Q96B54	188 aa		10.68	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	PAPPA	Q13219	1627 aa		10.68	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	C4B	P0C0L5	1744 aa		10.67	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	COL15A1	P39059	1388 aa		10.67	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		10.67	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		10.67	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		10.66	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	FAM177B	A6PVY3	158 aa		10.66	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	BCAR3	O75815	825 aa		10.66	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	GYS1	P13807	737 aa		10.66	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	FLII	Q13045	1269 aa		10.66	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	FKBP8	Q14318	412 aa		10.66	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	HLF	Q16534	295 aa		10.66	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		10.66	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7

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