RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464025.5

LMO2-204, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LMO2, Length 1,550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-204ENST00000464025 AOX1Q06278 1338 aa21.58■■□□□ 1.04
LMO2-204ENST00000464025 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
LMO2-204ENST00000464025 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
LMO2-204ENST00000464025 KSR2Q6VAB6 950 aa21.57■■□□□ 1.04
LMO2-204ENST00000464025 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.57■■□□□ 1.04
LMO2-204ENST00000464025 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
LMO2-204ENST00000464025 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
LMO2-204ENST00000464025 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa21.57■■□□□ 1.04
LMO2-204ENST00000464025 MTX1Q13505 466 aa21.56■■□□□ 1.04
LMO2-204ENST00000464025 ZNF790Q6PG37 636 aa21.56■■□□□ 1.04
LMO2-204ENST00000464025 DCAF5Q96JK2 942 aa21.56■■□□□ 1.04
LMO2-204ENST00000464025 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.55■■□□□ 1.04
LMO2-204ENST00000464025 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.54■■□□□ 1.04
LMO2-204ENST00000464025 USP26Q9BXU7 913 aa21.54■■□□□ 1.04
LMO2-204ENST00000464025 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
LMO2-204ENST00000464025 APBB1O00213 710 aa21.53■■□□□ 1.04
LMO2-204ENST00000464025 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.53■■□□□ 1.04
LMO2-204ENST00000464025 C5P01031 1676 aa21.53■■□□□ 1.04
LMO2-204ENST00000464025 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
LMO2-204ENST00000464025 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
LMO2-204ENST00000464025 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
LMO2-204ENST00000464025 MX1P20591 662 aa21.53■■□□□ 1.04
LMO2-204ENST00000464025 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21.53■■□□□ 1.04
LMO2-204ENST00000464025 UTYO14607 1347 aa21.52■■□□□ 1.04
LMO2-204ENST00000464025 PDIA6Q15084 440 aa21.52■■□□□ 1.04
LMO2-204ENST00000464025 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa21.52■■□□□ 1.04
LMO2-204ENST00000464025 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.52■■□□□ 1.04
LMO2-204ENST00000464025 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.51■■□□□ 1.03
LMO2-204ENST00000464025 REC8O95072 547 aa21.51■■□□□ 1.03
LMO2-204ENST00000464025 DDIT3P35638 169 aa21.51■■□□□ 1.03
LMO2-204ENST00000464025 SLAIN2Q9P270 581 aa21.51■■□□□ 1.03
LMO2-204ENST00000464025 ABCA3Q99758 1704 aa21.5■■□□□ 1.03
LMO2-204ENST00000464025 CYP27B1O15528 508 aa21.5■■□□□ 1.03
LMO2-204ENST00000464025 ANXA1P04083 346 aa21.5■■□□□ 1.03
LMO2-204ENST00000464025 CHRNA2Q15822 529 aa21.5■■□□□ 1.03
LMO2-204ENST00000464025 PROSER3Q2NL68 480 aa21.5■■□□□ 1.03
LMO2-204ENST00000464025 LINS1Q8NG48 757 aa21.5■■□□□ 1.03
LMO2-204ENST00000464025 RABEP1Q15276 862 aa21.49■■□□□ 1.03
LMO2-204ENST00000464025 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.49■■□□□ 1.03
LMO2-204ENST00000464025 KIF1BPQ96EK5 621 aa21.49■■□□□ 1.03
LMO2-204ENST00000464025 WDR17Q8IZU2 1322 aa21.49■■□□□ 1.03
LMO2-204ENST00000464025 ERC2O15083 957 aa21.48■■□□□ 1.03
LMO2-204ENST00000464025 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
LMO2-204ENST00000464025 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.48■■□□□ 1.03
LMO2-204ENST00000464025 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.48■■□□□ 1.03
LMO2-204ENST00000464025 SRGAP3O43295 1099 aa21.48■■□□□ 1.03
LMO2-204ENST00000464025 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.47■■□□□ 1.03
LMO2-204ENST00000464025 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
LMO2-204ENST00000464025 SURF6O75683 361 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
LMO2-204ENST00000464025 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.47■■□□□ 1.03
LMO2-204ENST00000464025 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
LMO2-204ENST00000464025 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
LMO2-204ENST00000464025 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.03
LMO2-204ENST00000464025 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 SLC39A6Q13433 755 aa21.45■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.44■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 PRDM11Q9NQV5 511 aa21.44■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 AK9Q5TCS8 1911 aa21.44■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 GRM8O00222 908 aa21.44■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 GSE1Q14687 1217 aa21.44■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.44■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 GLI3P10071 1580 aa21.44■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.43■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.43■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.43■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.42■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 CABP4P57796 275 aa21.42■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 ERC1Q8IUD2 1116 aa21.42■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 IL27Q8NEV9 243 aa21.42■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 IL17RAQ96F46 866 aa21.42■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.42■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 CARD10Q9BWT7 1032 aa21.42■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 ERBB4Q15303 1308 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 CHMLP26374 656 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 PI4K2BQ8TCG2 481 aa21.4■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 BCL11AQ9H165 835 aa21.4■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 COL15A1P39059 1388 aa21.4■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 PAPPAQ13219 1627 aa21.4■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 TTC41PQ6P2S7 1318 aa21.4■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.4■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.4■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa21.4■■□□□ 1.02
LMO2-204ENST00000464025 SHANK3Q9BYB0 1731 aa21.39■■□□□ 1.01
LMO2-204ENST00000464025 IGKV5-2P06315 115 aa21.39■■□□□ 1.01
LMO2-204ENST00000464025 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa21.39■■□□□ 1.01
LMO2-204ENST00000464025 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.39■■□□□ 1.01
LMO2-204ENST00000464025 USP16Q9Y5T5 823 aa21.39■■□□□ 1.01
LMO2-204ENST00000464025 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.38■■□□□ 1.01
LMO2-204ENST00000464025 KAZALD1Q96I82 304 aa21.38■■□□□ 1.01
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