RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462123.5

SIKE1-204, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIKE1, Length 394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-204ENST00000462123 FKBP8Q14318 412 aa27.66■■■□□ 2.02
SIKE1-204ENST00000462123 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
SIKE1-204ENST00000462123 COL15A1P39059 1388 aa27.65■■■□□ 2.02
SIKE1-204ENST00000462123 MCM10Q7L590 875 aa27.65■■■□□ 2.02
SIKE1-204ENST00000462123 C10orf71Q711Q0 1435 aa27.65■■■□□ 2.02
SIKE1-204ENST00000462123 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
SIKE1-204ENST00000462123 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
SIKE1-204ENST00000462123 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
SIKE1-204ENST00000462123 USPL1Q5W0Q7 1092 aa27.63■■■□□ 2.01
SIKE1-204ENST00000462123 NFE2L2Q16236 605 aa27.62■■■□□ 2.01
SIKE1-204ENST00000462123 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
SIKE1-204ENST00000462123 UBR2Q8IWV8 1755 aa27.62■■■□□ 2.01
SIKE1-204ENST00000462123 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
SIKE1-204ENST00000462123 CANXP27824 592 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
SIKE1-204ENST00000462123 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
SIKE1-204ENST00000462123 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.6■■■□□ 2.01
SIKE1-204ENST00000462123 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
SIKE1-204ENST00000462123 KCNQ3O43525 872 aa27.59■■■□□ 2.01
SIKE1-204ENST00000462123 DDR1Q08345 913 aa27.59■■■□□ 2.01
SIKE1-204ENST00000462123 DCTN1Q14203 1278 aa27.59■■■□□ 2.01
SIKE1-204ENST00000462123 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2
SIKE1-204ENST00000462123 PXDNLA1KZ92 1463 aa27.57■■■□□ 2
SIKE1-204ENST00000462123 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
SIKE1-204ENST00000462123 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.57■■■□□ 2
SIKE1-204ENST00000462123 C4AP0C0L4 1744 aa27.57■■■□□ 2
SIKE1-204ENST00000462123 NFIXQ14938 502 aa27.55■■■□□ 2
SIKE1-204ENST00000462123 A1BGP04217 495 aa27.54■■■□□ 2
SIKE1-204ENST00000462123 USP16Q9Y5T5 823 aa27.54■■■□□ 2
SIKE1-204ENST00000462123 A0A0G2JLW4 131 aa27.53■■■□□ 2
SIKE1-204ENST00000462123 RGL2O15211 777 aa27.53■■■□□ 2
SIKE1-204ENST00000462123 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
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SIKE1-204ENST00000462123 DPEP1P16444 411 aa27.52■■■□□ 2
SIKE1-204ENST00000462123 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
SIKE1-204ENST00000462123 KCNA3P22001 575 aa27.51■■□□□ 1.99
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SIKE1-204ENST00000462123 KIF13BQ9NQT8 1826 aa27.51■■□□□ 1.99
SIKE1-204ENST00000462123 SERPINB2P05120 415 aa27.5■■□□□ 1.99
SIKE1-204ENST00000462123 LMOD3Q0VAK6 560 aa27.5■■□□□ 1.99
SIKE1-204ENST00000462123 PIM2Q9P1W9 311 aa27.5■■□□□ 1.99
SIKE1-204ENST00000462123 CHD4Q14839 1912 aa27.48■■□□□ 1.99
SIKE1-204ENST00000462123 CLEC4GQ6UXB4 293 aa27.48■■□□□ 1.99
SIKE1-204ENST00000462123 BCS1LQ9Y276 419 aa27.48■■□□□ 1.99
SIKE1-204ENST00000462123 RIPK4P57078 832 aa27.47■■□□□ 1.99
SIKE1-204ENST00000462123 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa27.47■■□□□ 1.99
SIKE1-204ENST00000462123 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa27.47■■□□□ 1.99
SIKE1-204ENST00000462123 CAMTA2O94983 1202 aa27.46■■□□□ 1.99
SIKE1-204ENST00000462123 TMPOP42166 694 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
SIKE1-204ENST00000462123 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.46■■□□□ 1.99
SIKE1-204ENST00000462123 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
SIKE1-204ENST00000462123 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa27.45■■□□□ 1.98
SIKE1-204ENST00000462123 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
SIKE1-204ENST00000462123 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
SIKE1-204ENST00000462123 MIS18AQ9NYP9 233 aa27.45■■□□□ 1.98
SIKE1-204ENST00000462123 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
SIKE1-204ENST00000462123 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
SIKE1-204ENST00000462123 RUNDC1Q96C34 613 aa27.44■■□□□ 1.98
SIKE1-204ENST00000462123 TBC1D9BQ66K14 1250 aa27.43■■□□□ 1.98
SIKE1-204ENST00000462123 ZNF652Q9Y2D9 606 aa27.43■■□□□ 1.98
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SIKE1-204ENST00000462123 SETDB2Q96T68 719 aa27.42■■□□□ 1.98
SIKE1-204ENST00000462123 WWC3Q9ULE0 1092 aa27.42■■□□□ 1.98
SIKE1-204ENST00000462123 CARMIL3Q8ND23 1372 aa27.42■■□□□ 1.98
SIKE1-204ENST00000462123 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa27.41■■□□□ 1.98
SIKE1-204ENST00000462123 ADCY9O60503 1353 aa27.41■■□□□ 1.98
SIKE1-204ENST00000462123 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
SIKE1-204ENST00000462123 BRIP1Q9BX63 1249 aa27.4■■□□□ 1.98
SIKE1-204ENST00000462123 BICDL1Q6ZP65 573 aa27.39■■□□□ 1.98
SIKE1-204ENST00000462123 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.39■■□□□ 1.98
SIKE1-204ENST00000462123 ERBB4Q15303 1308 aa27.39■■□□□ 1.97
SIKE1-204ENST00000462123 CHRNA5P30532 468 aa27.38■■□□□ 1.97
SIKE1-204ENST00000462123 TSPYL4Q9UJ04 414 aa27.38■■□□□ 1.97
SIKE1-204ENST00000462123 H0YIN7 160 aa27.37■■□□□ 1.97
SIKE1-204ENST00000462123 PDE6BP35913 854 aa27.37■■□□□ 1.97
SIKE1-204ENST00000462123 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa27.37■■□□□ 1.97
SIKE1-204ENST00000462123 NRXN2Q9P2S2 1712 aa27.37■■□□□ 1.97
SIKE1-204ENST00000462123 PRR5LQ6MZQ0 368 aa27.36■■□□□ 1.97
SIKE1-204ENST00000462123 ATP10DQ9P241 1426 aa27.35■■□□□ 1.97
SIKE1-204ENST00000462123 ERVV-1B6SEH8 477 aa27.35■■□□□ 1.97
SIKE1-204ENST00000462123 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
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SIKE1-204ENST00000462123 CNBD1Q8NA66 436 aa27.34■■□□□ 1.97
SIKE1-204ENST00000462123 SCN7AQ01118 1682 aa27.33■■□□□ 1.97
SIKE1-204ENST00000462123 C2CD5Q86YS7 1000 aa27.33■■□□□ 1.97
SIKE1-204ENST00000462123 CCDC146Q8IYE0 955 aa27.33■■□□□ 1.97
SIKE1-204ENST00000462123 CHL1O00533 1208 aa27.32■■□□□ 1.96
SIKE1-204ENST00000462123 ST5P78524 1137 aa27.32■■□□□ 1.96
SIKE1-204ENST00000462123 TRIM35Q9UPQ4 493 aa27.32■■□□□ 1.96
SIKE1-204ENST00000462123 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
SIKE1-204ENST00000462123 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
SIKE1-204ENST00000462123 KDM3BQ7LBC6 1761 aa27.3■■□□□ 1.96
SIKE1-204ENST00000462123 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
SIKE1-204ENST00000462123 C1QTNF8P60827 252 aa27.3■■□□□ 1.96
SIKE1-204ENST00000462123 TPTE2Q6XPS3 522 aa27.3■■□□□ 1.96
SIKE1-204ENST00000462123 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
SIKE1-204ENST00000462123 NEUROD2Q15784 382 aa27.29■■□□□ 1.96
SIKE1-204ENST00000462123 DLG5Q8TDM6 1919 aa27.28■■□□□ 1.96
SIKE1-204ENST00000462123 NPHP1O15259 732 aa27.28■■□□□ 1.96
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