RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448514.1

GGTLC2-202, Transcript of gamma-glutamyltransferase light chain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGTLC2, Length 678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC2-202ENST00000448514 COL15A1P39059 1388 aa20.63■□□□□ 0.89
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GGTLC2-202ENST00000448514 GNAT3A8MTJ3 354 aa20.62■□□□□ 0.89
GGTLC2-202ENST00000448514 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
GGTLC2-202ENST00000448514 STARD3NLO95772 234 aa20.62■□□□□ 0.89
GGTLC2-202ENST00000448514 NFIXQ14938 502 aa20.62■□□□□ 0.89
GGTLC2-202ENST00000448514 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.62■□□□□ 0.89
GGTLC2-202ENST00000448514 IL17REQ8NFR9 667 aa20.61■□□□□ 0.89
GGTLC2-202ENST00000448514 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
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GGTLC2-202ENST00000448514 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.6■□□□□ 0.89
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GGTLC2-202ENST00000448514 BCL2L12Q9HB09 334 aa20.6■□□□□ 0.89
GGTLC2-202ENST00000448514 A0A087WZG4 1122 aa20.59■□□□□ 0.89
GGTLC2-202ENST00000448514 TOMM70O94826 608 aa20.59■□□□□ 0.89
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GGTLC2-202ENST00000448514 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.59■□□□□ 0.89
GGTLC2-202ENST00000448514 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
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GGTLC2-202ENST00000448514 HEG1Q9ULI3 1381 aa20.57■□□□□ 0.88
GGTLC2-202ENST00000448514 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.55■□□□□ 0.88
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GGTLC2-202ENST00000448514 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
GGTLC2-202ENST00000448514 NRXN2Q9P2S2 1712 aa20.54■□□□□ 0.88
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GGTLC2-202ENST00000448514 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
GGTLC2-202ENST00000448514 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.54■□□□□ 0.88
GGTLC2-202ENST00000448514 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.54■□□□□ 0.88
GGTLC2-202ENST00000448514 NUDCQ9Y266 331 aa20.54■□□□□ 0.88
GGTLC2-202ENST00000448514 PRKAR2BP31323 418 aa20.53■□□□□ 0.88
GGTLC2-202ENST00000448514 APLP1P51693 650 aa20.53■□□□□ 0.88
GGTLC2-202ENST00000448514 RNF181Q9P0P0 153 aa20.53■□□□□ 0.88
GGTLC2-202ENST00000448514 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.53■□□□□ 0.88
GGTLC2-202ENST00000448514 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
GGTLC2-202ENST00000448514 TTLL6Q8N841 843 aa20.52■□□□□ 0.88
GGTLC2-202ENST00000448514 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
GGTLC2-202ENST00000448514 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.52■□□□□ 0.88
GGTLC2-202ENST00000448514 BTBD11A6QL63 1104 aa20.51■□□□□ 0.87
GGTLC2-202ENST00000448514 H0YIN7 160 aa20.51■□□□□ 0.87
GGTLC2-202ENST00000448514 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.51■□□□□ 0.87
GGTLC2-202ENST00000448514 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
GGTLC2-202ENST00000448514 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
GGTLC2-202ENST00000448514 PPP2R1AP30153 589 aa20.49■□□□□ 0.87
GGTLC2-202ENST00000448514 TBC1D9BQ66K14 1250 aa20.49■□□□□ 0.87
GGTLC2-202ENST00000448514 BICDL1Q6ZP65 573 aa20.49■□□□□ 0.87
GGTLC2-202ENST00000448514 BRIP1Q9BX63 1249 aa20.49■□□□□ 0.87
GGTLC2-202ENST00000448514 LMNB1P20700 586 aa20.48■□□□□ 0.87
GGTLC2-202ENST00000448514 FSTL1Q12841 308 aa20.48■□□□□ 0.87
GGTLC2-202ENST00000448514 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
GGTLC2-202ENST00000448514 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
GGTLC2-202ENST00000448514 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.48■□□□□ 0.87
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GGTLC2-202ENST00000448514 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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GGTLC2-202ENST00000448514 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
GGTLC2-202ENST00000448514 KCNQ3O43525 872 aa20.46■□□□□ 0.87
GGTLC2-202ENST00000448514 CAMTA2O94983 1202 aa20.46■□□□□ 0.87
GGTLC2-202ENST00000448514 RASSF7Q02833 373 aa20.46■□□□□ 0.87
GGTLC2-202ENST00000448514 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
GGTLC2-202ENST00000448514 PRR5LQ6MZQ0 368 aa20.45■□□□□ 0.86
GGTLC2-202ENST00000448514 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa20.45■□□□□ 0.86
GGTLC2-202ENST00000448514 SETDB2Q96T68 719 aa20.45■□□□□ 0.86
GGTLC2-202ENST00000448514 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
GGTLC2-202ENST00000448514 DLEC1Q9Y238 1755 aa20.44■□□□□ 0.86
GGTLC2-202ENST00000448514 IFFO2Q5TF58 517 aa20.44■□□□□ 0.86
GGTLC2-202ENST00000448514 RRAGCQ9HB90 399 aa20.44■□□□□ 0.86
GGTLC2-202ENST00000448514 USP16Q9Y5T5 823 aa20.44■□□□□ 0.86
GGTLC2-202ENST00000448514 SBF1O95248 1867 aa20.43■□□□□ 0.86
GGTLC2-202ENST00000448514 SCN7AQ01118 1682 aa20.43■□□□□ 0.86
GGTLC2-202ENST00000448514 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
GGTLC2-202ENST00000448514 PRELPP51888 382 aa20.43■□□□□ 0.86
GGTLC2-202ENST00000448514 CLEC4GQ6UXB4 293 aa20.43■□□□□ 0.86
GGTLC2-202ENST00000448514 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
GGTLC2-202ENST00000448514 GLTPD2A6NH11 291 aa20.42■□□□□ 0.86
GGTLC2-202ENST00000448514 NFKBIEO00221 500 aa20.42■□□□□ 0.86
GGTLC2-202ENST00000448514 RGL2O15211 777 aa20.42■□□□□ 0.86
GGTLC2-202ENST00000448514 MCM10Q7L590 875 aa20.42■□□□□ 0.86
GGTLC2-202ENST00000448514 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
GGTLC2-202ENST00000448514 CNBD1Q8NA66 436 aa20.41■□□□□ 0.86
GGTLC2-202ENST00000448514 ST5P78524 1137 aa20.4■□□□□ 0.86
GGTLC2-202ENST00000448514 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
GGTLC2-202ENST00000448514 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
GGTLC2-202ENST00000448514 STYK1Q6J9G0 422 aa20.39■□□□□ 0.85
GGTLC2-202ENST00000448514 SMC1BQ8NDV3 1235 aa20.39■□□□□ 0.85
GGTLC2-202ENST00000448514 CNKSR1Q969H4 720 aa20.39■□□□□ 0.85
GGTLC2-202ENST00000448514 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.38■□□□□ 0.85
GGTLC2-202ENST00000448514 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa20.38■□□□□ 0.85
GGTLC2-202ENST00000448514 SRGNP10124 158 aa20.38■□□□□ 0.85
GGTLC2-202ENST00000448514 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
GGTLC2-202ENST00000448514 ZNF652Q9Y2D9 606 aa20.38■□□□□ 0.85
GGTLC2-202ENST00000448514 NPHP1O15259 732 aa20.37■□□□□ 0.85
GGTLC2-202ENST00000448514 C21orf2O43822 256 aa20.37■□□□□ 0.85
GGTLC2-202ENST00000448514 DCTN1Q14203 1278 aa20.37■□□□□ 0.85
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