RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447950.1

PTPRD-AS1-202, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD-AS1, Length 1,668 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SCN7AQ01118 1682 aa19.28■□□□□ 0.68
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TTC5Q8N0Z6 440 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NLGN1Q8N2Q7 840 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PLEKHF1Q96S99 279 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DDR1Q08345 913 aa19.27■□□□□ 0.67
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NRXN2Q9P2S2 1712 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BCORQ6W2J9 1755 aa19.25■□□□□ 0.67
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LAMB4A4D0S4 1761 aa19.25■□□□□ 0.67
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BCL2L12Q9HB09 334 aa19.24■□□□□ 0.67
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa19.24■□□□□ 0.67
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DLEC1Q9Y238 1755 aa19.19■□□□□ 0.66
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa19.15■□□□□ 0.66
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ATP10DQ9P241 1426 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NUP98P52948 1817 aa19.1■□□□□ 0.65
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RIPK4P57078 832 aa19.09■□□□□ 0.65
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CCDC24Q8N4L8 307 aa19.08■□□□□ 0.64
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa19.06■□□□□ 0.64
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PIM2Q9P1W9 311 aa19.05■□□□□ 0.64
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP19.05■□□□□ 0.64
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NEUROD2Q15784 382 aa19.05■□□□□ 0.64
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PRR5LQ6MZQ0 368 aa19.05■□□□□ 0.64
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa19.04■□□□□ 0.64
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa19.04■□□□□ 0.64
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRIM35Q9UPQ4 493 aa19.04■□□□□ 0.64
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CCDC184Q52MB2 194 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RUNDC1Q96C34 613 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TSPYL4Q9UJ04 414 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLX4Q8IY92 1834 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HLFQ16534 295 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C2CD5Q86YS7 1000 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NGEFQ8N5V2 710 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SETDB2Q96T68 719 aa19.01■□□□□ 0.63
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