RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
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CCBE1-202ENST00000439986 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP13.5□□□□□ -0.25
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CCBE1-202ENST00000439986 MBIPQ9NS73 344 aa13.44□□□□□ -0.26
CCBE1-202ENST00000439986 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa13.43□□□□□ -0.26
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF76P36508 570 aa13.43□□□□□ -0.26
CCBE1-202ENST00000439986 SOGA3Q5TF21 947 aa13.43□□□□□ -0.26
CCBE1-202ENST00000439986 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
CCBE1-202ENST00000439986 DYNC1I1O14576 645 aa13.43□□□□□ -0.26
CCBE1-202ENST00000439986 NOS1P29475 1434 aa13.43□□□□□ -0.26
CCBE1-202ENST00000439986 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa13.43□□□□□ -0.26
CCBE1-202ENST00000439986 NEBLO76041 1014 aa13.43□□□□□ -0.26
CCBE1-202ENST00000439986 MPHOSPH8Q99549 860 aa13.43□□□□□ -0.26
CCBE1-202ENST00000439986 RAI14Q9P0K7 980 aa13.43□□□□□ -0.26
CCBE1-202ENST00000439986 ADCY5O95622 1261 aa13.42□□□□□ -0.26
CCBE1-202ENST00000439986 TMX1Q9H3N1 280 aa13.42□□□□□ -0.26
CCBE1-202ENST00000439986 SDSP20132 328 aa13.42□□□□□ -0.26
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