RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 BECN1Q14457 450 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-202ENST00000435136 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-202ENST00000435136 USP35Q9P2H5 1018 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-202ENST00000435136 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2-202ENST00000435136 GLI3P10071 1580 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2-202ENST00000435136 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2-202ENST00000435136 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2-202ENST00000435136 NRAPQ86VF7 1730 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2-202ENST00000435136 PHKG2P15735 406 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2-202ENST00000435136 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2-202ENST00000435136 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2-202ENST00000435136 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2-202ENST00000435136 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2-202ENST00000435136 NECTIN2Q92692 538 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2-202ENST00000435136 KCNQ3O43525 872 aa23.16■■□□□ 1.3
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SH3BP2-202ENST00000435136 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP2-202ENST00000435136 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SH3BP2-202ENST00000435136 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2-202ENST00000435136 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2-202ENST00000435136 ATP8B2P98198 1209 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2-202ENST00000435136 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2-202ENST00000435136 EP400Q96L91 3159 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2-202ENST00000435136 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.14■■□□□ 1.3
SH3BP2-202ENST00000435136 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
SH3BP2-202ENST00000435136 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP2-202ENST00000435136 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
SH3BP2-202ENST00000435136 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
SH3BP2-202ENST00000435136 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-202ENST00000435136 SEPT12Q8IYM1 358 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-202ENST00000435136 DCAF5Q96JK2 942 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-202ENST00000435136 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-202ENST00000435136 USP44Q9H0E7 712 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-202ENST00000435136 TTC22Q5TAA0 569 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-202ENST00000435136 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.12■■□□□ 1.29
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SH3BP2-202ENST00000435136 HYPKQ9NX55 129 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-202ENST00000435136 CDC45O75419 566 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-202ENST00000435136 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-202ENST00000435136 OSBPL3Q9H4L5 887 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2-202ENST00000435136 BEND3Q5T5X7 828 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2-202ENST00000435136 ADCY9O60503 1353 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A0G2JS52 829 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF790Q6PG37 636 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-202ENST00000435136 C5P01031 1676 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-202ENST00000435136 ALDH1L1O75891 902 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-202ENST00000435136 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-202ENST00000435136 HDAC5Q9UQL6 1122 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-202ENST00000435136 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.28
SH3BP2-202ENST00000435136 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
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SH3BP2-202ENST00000435136 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-202ENST00000435136 KSR2Q6VAB6 950 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-202ENST00000435136 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-202ENST00000435136 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-202ENST00000435136 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-202ENST00000435136 CYP27B1O15528 508 aa23.05■■□□□ 1.28
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SH3BP2-202ENST00000435136 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP2-202ENST00000435136 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-202ENST00000435136 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC4A3P48751 1232 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-202ENST00000435136 POLA2Q14181 598 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-202ENST00000435136 RAB11FIP3O75154 756 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-202ENST00000435136 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-202ENST00000435136 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM182BQ5T319 152 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-202ENST00000435136 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-202ENST00000435136 SALL3Q9BXA9 1300 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-202ENST00000435136 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-202ENST00000435136 BARGINQ6ZT62 677 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-202ENST00000435136 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-202ENST00000435136 AOX1Q06278 1338 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-202ENST00000435136 MTX1Q13505 466 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-202ENST00000435136 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-202ENST00000435136 PAPPAQ13219 1627 aa23.01■■□□□ 1.27
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SH3BP2-202ENST00000435136 PDIA6Q15084 440 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-202ENST00000435136 CASC1Q6TDU7 716 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-202ENST00000435136 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-202ENST00000435136 UBR2Q8IWV8 1755 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-202ENST00000435136 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SH3BP2-202ENST00000435136 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SH3BP2-202ENST00000435136 KRT27Q7Z3Y8 459 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-202ENST00000435136 TTC5Q8N0Z6 440 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-202ENST00000435136 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-202ENST00000435136 PDE1AP54750 535 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-202ENST00000435136 SNX21Q969T3 373 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-202ENST00000435136 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-202ENST00000435136 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-202ENST00000435136 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-202ENST00000435136 UTYO14607 1347 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-202ENST00000435136 NBR1Q14596 966 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-202ENST00000435136 PROSER3Q2NL68 480 aa22.99■■□□□ 1.27
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