RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429295.1

MRPL23-206, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L23, humanhuman

TSL 5

Gene MRPL23, Length 805 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23-206ENST00000429295 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa29.19■■■□□ 2.26
MRPL23-206ENST00000429295 DPEP1P16444 411 aa29.19■■■□□ 2.26
MRPL23-206ENST00000429295 ZNF790Q6PG37 636 aa29.19■■■□□ 2.26
MRPL23-206ENST00000429295 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
MRPL23-206ENST00000429295 RALBP1Q15311 655 aa29.18■■■□□ 2.26
MRPL23-206ENST00000429295 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
MRPL23-206ENST00000429295 NEFMP07197 916 aa29.17■■■□□ 2.26
MRPL23-206ENST00000429295 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa29.17■■■□□ 2.26
MRPL23-206ENST00000429295 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
MRPL23-206ENST00000429295 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
MRPL23-206ENST00000429295 BTBD11A6QL63 1104 aa29.15■■■□□ 2.26
MRPL23-206ENST00000429295 STARD3NLO95772 234 aa29.15■■■□□ 2.26
MRPL23-206ENST00000429295 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
MRPL23-206ENST00000429295 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
MRPL23-206ENST00000429295 ZPR1O75312 459 aa29.14■■■□□ 2.26
MRPL23-206ENST00000429295 FKBP8Q14318 412 aa29.14■■■□□ 2.26
MRPL23-206ENST00000429295 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
MRPL23-206ENST00000429295 FMNL2Q96PY5 1086 aa29.13■■■□□ 2.25
MRPL23-206ENST00000429295 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa29.13■■■□□ 2.25
MRPL23-206ENST00000429295 HEG1Q9ULI3 1381 aa29.13■■■□□ 2.25
MRPL23-206ENST00000429295 HSPA6P17066 643 aa29.12■■■□□ 2.25
MRPL23-206ENST00000429295 MCM10Q7L590 875 aa29.12■■■□□ 2.25
MRPL23-206ENST00000429295 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
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MRPL23-206ENST00000429295 UBR2Q8IWV8 1755 aa29.1■■■□□ 2.25
MRPL23-206ENST00000429295 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
MRPL23-206ENST00000429295 CANXP27824 592 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
MRPL23-206ENST00000429295 DDR1Q08345 913 aa29.09■■■□□ 2.25
MRPL23-206ENST00000429295 USPL1Q5W0Q7 1092 aa29.09■■■□□ 2.25
MRPL23-206ENST00000429295 KIF3CO14782 793 aa29.08■■■□□ 2.25
MRPL23-206ENST00000429295 KCNQ3O43525 872 aa29.08■■■□□ 2.25
MRPL23-206ENST00000429295 DCTN1Q14203 1278 aa29.08■■■□□ 2.25
MRPL23-206ENST00000429295 NARFQ9UHQ1 456 aa29.08■■■□□ 2.25
MRPL23-206ENST00000429295 COL15A1P39059 1388 aa29.08■■■□□ 2.25
MRPL23-206ENST00000429295 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
MRPL23-206ENST00000429295 PLEKHF1Q96S99 279 aa29.07■■■□□ 2.24
MRPL23-206ENST00000429295 KCNA3P22001 575 aa29.06■■■□□ 2.24
MRPL23-206ENST00000429295 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
MRPL23-206ENST00000429295 A0A087WZG4 1122 aa29.04■■■□□ 2.24
MRPL23-206ENST00000429295 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
MRPL23-206ENST00000429295 TM4SF1P30408 202 aa29.04■■■□□ 2.24
MRPL23-206ENST00000429295 EIF5P55010 431 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
MRPL23-206ENST00000429295 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
MRPL23-206ENST00000429295 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.03■■■□□ 2.24
MRPL23-206ENST00000429295 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
MRPL23-206ENST00000429295 CHRNA5P30532 468 aa29.02■■■□□ 2.24
MRPL23-206ENST00000429295 NFE2L2Q16236 605 aa29.02■■■□□ 2.24
MRPL23-206ENST00000429295 C9orf131Q5VYM1 1079 aa29.02■■■□□ 2.24
MRPL23-206ENST00000429295 SBF1O95248 1867 aa29.02■■■□□ 2.24
MRPL23-206ENST00000429295 A1BGP04217 495 aa29■■■□□ 2.23
MRPL23-206ENST00000429295 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
MRPL23-206ENST00000429295 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
MRPL23-206ENST00000429295 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
MRPL23-206ENST00000429295 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
MRPL23-206ENST00000429295 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
MRPL23-206ENST00000429295 NRXN2Q9P2S2 1712 aa28.99■■■□□ 2.23
MRPL23-206ENST00000429295 DLEC1Q9Y238 1755 aa28.98■■■□□ 2.23
MRPL23-206ENST00000429295 TOMM70O94826 608 aa28.98■■■□□ 2.23
MRPL23-206ENST00000429295 NFIXQ14938 502 aa28.98■■■□□ 2.23
MRPL23-206ENST00000429295 BCL2L12Q9HB09 334 aa28.98■■■□□ 2.23
MRPL23-206ENST00000429295 NMRK2Q9NPI5 230 aa28.98■■■□□ 2.23
MRPL23-206ENST00000429295 USP16Q9Y5T5 823 aa28.98■■■□□ 2.23
MRPL23-206ENST00000429295 RNF181Q9P0P0 153 aa28.97■■■□□ 2.23
MRPL23-206ENST00000429295 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
MRPL23-206ENST00000429295 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
MRPL23-206ENST00000429295 MIS18AQ9NYP9 233 aa28.96■■■□□ 2.23
MRPL23-206ENST00000429295 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa28.94■■■□□ 2.22
MRPL23-206ENST00000429295 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa28.94■■■□□ 2.22
MRPL23-206ENST00000429295 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
MRPL23-206ENST00000429295 APLP1P51693 650 aa28.93■■■□□ 2.22
MRPL23-206ENST00000429295 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa28.93■■■□□ 2.22
MRPL23-206ENST00000429295 KDM2BQ8NHM5 1336 aa28.93■■■□□ 2.22
MRPL23-206ENST00000429295 SERPINB2P05120 415 aa28.92■■■□□ 2.22
MRPL23-206ENST00000429295 SCN7AQ01118 1682 aa28.91■■■□□ 2.22
MRPL23-206ENST00000429295 BICDL1Q6ZP65 573 aa28.91■■■□□ 2.22
MRPL23-206ENST00000429295 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
MRPL23-206ENST00000429295 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
MRPL23-206ENST00000429295 RIPK4P57078 832 aa28.9■■■□□ 2.22
MRPL23-206ENST00000429295 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
MRPL23-206ENST00000429295 WDR90Q96KV7 1748 aa28.89■■■□□ 2.21
MRPL23-206ENST00000429295 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.88■■■□□ 2.21
MRPL23-206ENST00000429295 TBC1D9BQ66K14 1250 aa28.88■■■□□ 2.21
MRPL23-206ENST00000429295 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
MRPL23-206ENST00000429295 DLG5Q8TDM6 1919 aa28.88■■■□□ 2.21
MRPL23-206ENST00000429295 RASSF7Q02833 373 aa28.87■■■□□ 2.21
MRPL23-206ENST00000429295 TIAM2Q8IVF5 1701 aa28.86■■■□□ 2.21
MRPL23-206ENST00000429295 CAMTA2O94983 1202 aa28.86■■■□□ 2.21
MRPL23-206ENST00000429295 TMPOP42166 694 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
MRPL23-206ENST00000429295 C2CD5Q86YS7 1000 aa28.86■■■□□ 2.21
MRPL23-206ENST00000429295 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
MRPL23-206ENST00000429295 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa28.86■■■□□ 2.21
MRPL23-206ENST00000429295 H0YIN7 160 aa28.85■■■□□ 2.21
MRPL23-206ENST00000429295 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
MRPL23-206ENST00000429295 LMOD3Q0VAK6 560 aa28.85■■■□□ 2.21
MRPL23-206ENST00000429295 IFFO2Q5TF58 517 aa28.85■■■□□ 2.21
MRPL23-206ENST00000429295 TTLL6Q8N841 843 aa28.85■■■□□ 2.21
MRPL23-206ENST00000429295 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.84■■■□□ 2.21
MRPL23-206ENST00000429295 CARMIL3Q8ND23 1372 aa28.84■■■□□ 2.21
MRPL23-206ENST00000429295 CACNA1SQ13698 1873 aa28.83■■■□□ 2.21
MRPL23-206ENST00000429295 NBPF26B4DH59 902 aa28.83■■■□□ 2.21
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