RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
HOXA4-202ENST00000428284 STARD3NLO95772 234 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXA4-202ENST00000428284 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXA4-202ENST00000428284 RREB1Q92766 1687 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXA4-202ENST00000428284 C4BP0C0L5 1744 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF428Q96B54 188 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXA4-202ENST00000428284 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXA4-202ENST00000428284 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXA4-202ENST00000428284 LRRC4BQ9NT99 713 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXA4-202ENST00000428284 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
HOXA4-202ENST00000428284 PROM2Q8N271 834 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXA4-202ENST00000428284 LINC00116Q8NCU8 138 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXA4-202ENST00000428284 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
HOXA4-202ENST00000428284 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXA4-202ENST00000428284 STK31Q9BXU1 1019 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXA4-202ENST00000428284 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXA4-202ENST00000428284 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXA4-202ENST00000428284 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXA4-202ENST00000428284 A1BGP04217 495 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXA4-202ENST00000428284 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXA4-202ENST00000428284 CRKLP46109 303 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
HOXA4-202ENST00000428284 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
HOXA4-202ENST00000428284 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
HOXA4-202ENST00000428284 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXA4-202ENST00000428284 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXA4-202ENST00000428284 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXA4-202ENST00000428284 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
HOXA4-202ENST00000428284 ERBB4Q15303 1308 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC87Q9NVE4 849 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXA4-202ENST00000428284 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXA4-202ENST00000428284 ANXA1P04083 346 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXA4-202ENST00000428284 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
HOXA4-202ENST00000428284 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXA4-202ENST00000428284 SLC4A2P04920 1241 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXA4-202ENST00000428284 MYL6BP14649 208 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXA4-202ENST00000428284 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
HOXA4-202ENST00000428284 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.41■■□□□ 1.82
HOXA4-202ENST00000428284 UBR3Q6ZT12 1888 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXA4-202ENST00000428284 NBPF26B4DH59 902 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXA4-202ENST00000428284 PROSER3Q2NL68 480 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXA4-202ENST00000428284 NBPF14Q5TI25 921 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXA4-202ENST00000428284 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
HOXA4-202ENST00000428284 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
HOXA4-202ENST00000428284 NBPF15Q8N660 670 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXA4-202ENST00000428284 PDIA6Q15084 440 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
HOXA4-202ENST00000428284 BCAR3O75815 825 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXA4-202ENST00000428284 AK7Q96M32 723 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXA4-202ENST00000428284 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXA4-202ENST00000428284 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
HOXA4-202ENST00000428284 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
HOXA4-202ENST00000428284 GNPATO15228 680 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXA4-202ENST00000428284 HYPKQ9NX55 129 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXA4-202ENST00000428284 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
HOXA4-202ENST00000428284 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
HOXA4-202ENST00000428284 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
HOXA4-202ENST00000428284 G2E3Q7L622 706 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXA4-202ENST00000428284 KIF16BQ96L93 1317 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXA4-202ENST00000428284 C4AP0C0L4 1744 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXA4-202ENST00000428284 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.33■■□□□ 1.8
HOXA4-202ENST00000428284 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.8
HOXA4-202ENST00000428284 COL15A1P39059 1388 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXA4-202ENST00000428284 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
HOXA4-202ENST00000428284 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
HOXA4-202ENST00000428284 FLIIQ13045 1269 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXA4-202ENST00000428284 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
HOXA4-202ENST00000428284 RPS6KA4O75676 772 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXA4-202ENST00000428284 EIF5P55010 431 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF827Q17R98 1081 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXA4-202ENST00000428284 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXA4-202ENST00000428284 COPS6Q7L5N1 327 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXA4-202ENST00000428284 AKT1S1Q96B36 256 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXA4-202ENST00000428284 ARXQ96QS3 562 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXA4-202ENST00000428284 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
HOXA4-202ENST00000428284 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXA4-202ENST00000428284 PHF14O94880 888 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXA4-202ENST00000428284 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
HOXA4-202ENST00000428284 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
HOXA4-202ENST00000428284 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXA4-202ENST00000428284 QSER1Q2KHR3 1735 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXA4-202ENST00000428284 STK32BQ9NY57 414 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXA4-202ENST00000428284 BCORQ6W2J9 1755 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXA4-202ENST00000428284 SMIM5Q71RC9 77 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXA4-202ENST00000428284 PTPRCP08575 1304 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXA4-202ENST00000428284 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXA4-202ENST00000428284 AMIGO3Q86WK7 504 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXA4-202ENST00000428284 NUP98P52948 1817 aa26.26■■□□□ 1.8
HOXA4-202ENST00000428284 A0A087WZG4 1122 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 SSFA2P28290 1259 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 SCN7AQ01118 1682 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 ADRA2BP18089 450 aa26.24■■□□□ 1.79
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