RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.05■■□□□ 1.28
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHRNA2Q15822 529 aa23.05■■□□□ 1.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.05■■□□□ 1.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.04■■□□□ 1.28
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 C5P01031 1676 aa23.03■■□□□ 1.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSHZ3Q63HK5 1081 aa23.03■■□□□ 1.28
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 STAP2Q9UGK3 403 aa23.02■■□□□ 1.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.02■■□□□ 1.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF790Q6PG37 636 aa23.02■■□□□ 1.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KSR2Q6VAB6 950 aa23.02■■□□□ 1.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HYPKQ9NX55 129 aa23.02■■□□□ 1.28
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 STRCQ7RTU9 1775 aa23.01■■□□□ 1.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 REC8O95072 547 aa23.01■■□□□ 1.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.01■■□□□ 1.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRC1P22897 1456 aa23■■□□□ 1.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERC2O15083 957 aa23■■□□□ 1.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 RABEP1Q15276 862 aa23■■□□□ 1.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC39A6Q13433 755 aa22.99■■□□□ 1.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.99■■□□□ 1.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.99■■□□□ 1.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AOX1Q06278 1338 aa22.98■■□□□ 1.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDIA6Q15084 440 aa22.97■■□□□ 1.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYP27B1O15528 508 aa22.97■■□□□ 1.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTX1Q13505 466 aa22.96■■□□□ 1.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.96■■□□□ 1.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DCAF5Q96JK2 942 aa22.96■■□□□ 1.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.96■■□□□ 1.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.94■■□□□ 1.26
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 GRM8O00222 908 aa22.9■■□□□ 1.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.9■■□□□ 1.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.9■■□□□ 1.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLAIN2Q9P270 581 aa22.9■■□□□ 1.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.89■■□□□ 1.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.89■■□□□ 1.26
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABCA3Q99758 1704 aa22.89■■□□□ 1.25
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.89■■□□□ 1.25
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.88■■□□□ 1.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GLI3P10071 1580 aa22.88■■□□□ 1.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGKV5-2P06315 115 aa22.88■■□□□ 1.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.87■■□□□ 1.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.87■■□□□ 1.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.87■■□□□ 1.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.87■■□□□ 1.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ST18O60284 1047 aa22.86■■□□□ 1.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KAZALD1Q96I82 304 aa22.86■■□□□ 1.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SUCLG2Q96I99 432 aa22.86■■□□□ 1.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 USP16Q9Y5T5 823 aa22.86■■□□□ 1.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.86■■□□□ 1.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COPS6Q7L5N1 327 aa22.86■■□□□ 1.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.86■■□□□ 1.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.85■■□□□ 1.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.85■■□□□ 1.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.84■■□□□ 1.25
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