RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.28□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.28□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 ESCO1Q5FWF5 840 aa6.27□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.27□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 FAM182BQ5T319 152 aa6.27□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 TRIM11Q96F44 468 aa6.27□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 TRIM34Q9BYJ4 488 aa6.27□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 OSBPL3Q9H4L5 887 aa6.27□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.27□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 MYCP01106 439 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 NLRP8Q86W28 1048 aa6.26□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 MCM6Q14566 821 aa6.26□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 C4orf17Q53FE4 359 aa6.26□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.26□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 XAGE2Q96GT9 111 aa6.26□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 IL2RAP01589 272 aa6.25□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.25□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.25□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.25□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.25□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 ALAS2P22557 587 aa6.24□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 SCTRP47872 440 aa6.24□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 TXKP42681 527 aa6.24□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.24□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.23□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.23□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 PAX4O43316 350 aa6.22□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 FLIIQ13045 1269 aa6.22□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.22□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa6.22□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 SOCS7O14512 581 aa6.22□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 COBLO75128 1261 aa6.22□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 APBB1O00213 710 aa6.21□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.21□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.21□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.21□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 GPR37L1O60883 481 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 FBXO45P0C2W1 286 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 MCTP1Q6DN14 999 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 ELOA3Q8NG57 546 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 POM121Q96HA1 1249 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 C9orf172C9J069 976 aa6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 TNP2Q05952 138 aa6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 KLF15Q9UIH9 416 aa6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 UBTFP17480 764 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 COG6Q9Y2V7 657 aa6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 CD33P20138 364 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 ABL2P42684 1182 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 PLA2G4AP47712 749 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 NR1H3Q13133 447 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 LAMC2Q13753 1193 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 CLUAP1Q96AJ1 413 aa6.17□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 DCDC2BA2VCK2 349 aa6.17□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 FAM157BP0CG42 384 aa6.17□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 TLR1Q15399 786 aa6.17□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 GJA3Q9Y6H8 435 aa6.17□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 RAD21O60216 631 aa6.16□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 ELNP15502 786 aa6.16□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 IRF5Q13568 498 aa6.16□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 NBPF1Q3BBV0 1214 aa6.16□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 TATP17735 454 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 MARK1Q9P0L2 795 aa6.15□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 A0A1W2PNR3 127 aa6.15□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 ZMYND15Q9H091 742 aa6.15□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 ATP4AP20648 1035 aa6.14□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 AIDAQ96BJ3 306 aa6.14□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 M0R082 166 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 VAC14Q08AM6 782 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 ADGRE1Q14246 886 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 TXNRD3Q86VQ6 643 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 FAM229AH3BQW9 127 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 SIN3BO75182 1162 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 USP4Q13107 963 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 SIRT1Q96EB6 747 aa6.13□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 373.5 ms