RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.28□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.28□□□□□ -1.4
CCDC82-202ENST00000423339 ESCO1Q5FWF5 840 aa6.27□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.27□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 FAM182BQ5T319 152 aa6.27□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 TRIM11Q96F44 468 aa6.27□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 TRIM34Q9BYJ4 488 aa6.27□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 OSBPL3Q9H4L5 887 aa6.27□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.27□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 MYCP01106 439 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 NLRP8Q86W28 1048 aa6.26□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 MCM6Q14566 821 aa6.26□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 C4orf17Q53FE4 359 aa6.26□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.26□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 XAGE2Q96GT9 111 aa6.26□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 IL2RAP01589 272 aa6.25□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.25□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.25□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.25□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.25□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 ALAS2P22557 587 aa6.24□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 SCTRP47872 440 aa6.24□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 TXKP42681 527 aa6.24□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.24□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.23□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.23□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 PAX4O43316 350 aa6.22□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 FLIIQ13045 1269 aa6.22□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.22□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa6.22□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 SOCS7O14512 581 aa6.22□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 COBLO75128 1261 aa6.22□□□□□ -1.41
CCDC82-202ENST00000423339 APBB1O00213 710 aa6.21□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.21□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.21□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.21□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 GPR37L1O60883 481 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 FBXO45P0C2W1 286 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 MCTP1Q6DN14 999 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 ELOA3Q8NG57 546 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 POM121Q96HA1 1249 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 C9orf172C9J069 976 aa6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 TNP2Q05952 138 aa6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 KLF15Q9UIH9 416 aa6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 UBTFP17480 764 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 COG6Q9Y2V7 657 aa6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 CD33P20138 364 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 ABL2P42684 1182 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 PLA2G4AP47712 749 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 NR1H3Q13133 447 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 LAMC2Q13753 1193 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 CLUAP1Q96AJ1 413 aa6.17□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 DCDC2BA2VCK2 349 aa6.17□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 FAM157BP0CG42 384 aa6.17□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 TLR1Q15399 786 aa6.17□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 GJA3Q9Y6H8 435 aa6.17□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 RAD21O60216 631 aa6.16□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 ELNP15502 786 aa6.16□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 IRF5Q13568 498 aa6.16□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 NBPF1Q3BBV0 1214 aa6.16□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 TATP17735 454 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 MARK1Q9P0L2 795 aa6.15□□□□□ -1.42
CCDC82-202ENST00000423339 A0A1W2PNR3 127 aa6.15□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 ZMYND15Q9H091 742 aa6.15□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 ATP4AP20648 1035 aa6.14□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 AIDAQ96BJ3 306 aa6.14□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 M0R082 166 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 VAC14Q08AM6 782 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 ADGRE1Q14246 886 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 TXNRD3Q86VQ6 643 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 FAM229AH3BQW9 127 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 SIN3BO75182 1162 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 USP4Q13107 963 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC82-202ENST00000423339 SIRT1Q96EB6 747 aa6.13□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms