RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416453.6

GTF3C2-AS1-201, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GTF3C2-AS1, Length 863 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KCNQ3O43525 872 aa13.52□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF790Q6PG37 636 aa13.52□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MRS2Q9HD23 443 aa13.52□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HEG1Q9ULI3 1381 aa13.51□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TMPOP42166 694 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PTGER2P43116 358 aa13.51□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CRKLP46109 303 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RIPK4P57078 832 aa13.51□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MSL1Q68DK7 614 aa13.51□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RUNDC1Q96C34 613 aa13.51□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SSFA2P28290 1259 aa13.5□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NEUROD2Q15784 382 aa13.5□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FKBP8Q14318 412 aa13.49□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FLAD1Q8NFF5 587 aa13.49□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SGIP1Q9BQI5 828 aa13.49□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LMOD3Q0VAK6 560 aa13.48□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SLC16A10Q8TF71 515 aa13.48□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FMNL2Q96PY5 1086 aa13.48□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MIS18AQ9NYP9 233 aa13.48□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SCN7AQ01118 1682 aa13.47□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 VSIG10Q8N0Z9 540 aa13.47□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CCDC87Q9NVE4 849 aa13.47□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa13.47□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa13.46□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa13.46□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 APAF1O14727 1248 aa13.46□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RPS6KA4O75676 772 aa13.46□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRIM35Q9UPQ4 493 aa13.46□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 COL15A1P39059 1388 aa13.45□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 BCORQ6W2J9 1755 aa13.45□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 POLD1P28340 1107 aa13.45□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRAPPC3LQ5T215 181 aa13.45□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KLHL34Q8N239 644 aa13.44□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ARXQ96QS3 562 aa13.44□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 STARD3NLO95772 234 aa13.43□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CANXP27824 592 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RFC4P35249 363 aa13.43□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TSPYL4Q9UJ04 414 aa13.43□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa13.43□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A1BGP04217 495 aa13.41□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GYS1P13807 737 aa13.41□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 USP16Q9Y5T5 823 aa13.41□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAM9BQ8IZU0 186 aa13.4□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MIER1Q8N108 512 aa13.4□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa13.39□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KIF13BQ9NQT8 1826 aa13.39□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MMP10P09238 476 aa13.39□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 EIF5P55010 431 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 USPL1Q5W0Q7 1092 aa13.39□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZPR1O75312 459 aa13.38□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SYT17Q9BSW7 474 aa13.38□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPDYE4A6NLX3 237 aa13.37□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NBPF26B4DH59 902 aa13.37□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CHL1O00533 1208 aa13.37□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRT24Q2M2I5 525 aa13.37□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NBPF15Q8N660 670 aa13.37□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NLGN2Q8NFZ4 835 aa13.37□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 BABAM1Q9NWV8 329 aa13.37□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NARFQ9UHQ1 456 aa13.37□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NRXN2Q9P2S2 1712 aa13.36□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DDR1Q08345 913 aa13.36□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NLGN1Q8N2Q7 840 aa13.36□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CFAP44Q96MT7 982 aa13.36□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 BCL2L12Q9HB09 334 aa13.36□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MBIPQ9NS73 344 aa13.36□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa13.36□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C10orf71Q711Q0 1435 aa13.36□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A0A087WZG4 1122 aa13.35□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IFT57Q9NWB7 429 aa13.35□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NECTIN2Q92692 538 aa13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms