RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394106.6

CMTM4-202, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,187 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-202ENST00000394106 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.09
CMTM4-202ENST00000394106 CD2APQ9Y5K6 639 aa40.63■■■■■ 4.09
CMTM4-202ENST00000394106 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.09
CMTM4-202ENST00000394106 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP40.62■■■■■ 4.09
CMTM4-202ENST00000394106 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
CMTM4-202ENST00000394106 GPR162Q16538 588 aa40.6■■■■■ 4.09
CMTM4-202ENST00000394106 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
CMTM4-202ENST00000394106 COL15A1P39059 1388 aa40.6■■■■■ 4.09
CMTM4-202ENST00000394106 CCDC146Q8IYE0 955 aa40.59■■■■■ 4.09
CMTM4-202ENST00000394106 ZPR1O75312 459 aa40.58■■■■■ 4.09
CMTM4-202ENST00000394106 MIS18AQ9NYP9 233 aa40.58■■■■■ 4.09
CMTM4-202ENST00000394106 FKBP8Q14318 412 aa40.56■■■■■ 4.08
CMTM4-202ENST00000394106 RIPK4P57078 832 aa40.55■■■■■ 4.08
CMTM4-202ENST00000394106 USPL1Q5W0Q7 1092 aa40.55■■■■■ 4.08
CMTM4-202ENST00000394106 ADAMTS8Q9UP79 889 aa40.54■■■■■ 4.08
CMTM4-202ENST00000394106 PARP3Q9Y6F1 533 aa40.54■■■■■ 4.08
CMTM4-202ENST00000394106 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa40.52■■■■■ 4.08
CMTM4-202ENST00000394106 TMPOP42166 694 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
CMTM4-202ENST00000394106 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
CMTM4-202ENST00000394106 A1BGP04217 495 aa40.51■■■■■ 4.08
CMTM4-202ENST00000394106 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
CMTM4-202ENST00000394106 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
CMTM4-202ENST00000394106 NARFQ9UHQ1 456 aa40.51■■■■■ 4.08
CMTM4-202ENST00000394106 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
CMTM4-202ENST00000394106 EIF5P55010 431 aaKnown RBP40.5■■■■■ 4.07
CMTM4-202ENST00000394106 RUNDC1Q96C34 613 aa40.5■■■■■ 4.07
CMTM4-202ENST00000394106 USP16Q9Y5T5 823 aa40.5■■■■■ 4.07
CMTM4-202ENST00000394106 KDM3BQ7LBC6 1761 aa40.49■■■■■ 4.07
CMTM4-202ENST00000394106 YY1P25490 414 aa40.48■■■■■ 4.07
CMTM4-202ENST00000394106 NEUROD2Q15784 382 aa40.48■■■■■ 4.07
CMTM4-202ENST00000394106 A0A087WZG4 1122 aa40.47■■■■■ 4.07
CMTM4-202ENST00000394106 DDR1Q08345 913 aa40.45■■■■■ 4.07
CMTM4-202ENST00000394106 LMOD3Q0VAK6 560 aa40.45■■■■■ 4.07
CMTM4-202ENST00000394106 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
CMTM4-202ENST00000394106 KIF13BQ9NQT8 1826 aa40.44■■■■■ 4.06
CMTM4-202ENST00000394106 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP40.43■■■■■ 4.06
CMTM4-202ENST00000394106 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
CMTM4-202ENST00000394106 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP40.43■■■■■ 4.06
CMTM4-202ENST00000394106 C10orf71Q711Q0 1435 aa40.42■■■■■ 4.06
CMTM4-202ENST00000394106 WWC3Q9ULE0 1092 aa40.42■■■■■ 4.06
CMTM4-202ENST00000394106 BCL2L12Q9HB09 334 aa40.41■■■■■ 4.06
CMTM4-202ENST00000394106 TM4SF1P30408 202 aa40.4■■■■■ 4.06
CMTM4-202ENST00000394106 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa40.4■■■■■ 4.06
CMTM4-202ENST00000394106 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
CMTM4-202ENST00000394106 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
CMTM4-202ENST00000394106 NFIXQ14938 502 aa40.38■■■■■ 4.05
CMTM4-202ENST00000394106 LAMB4A4D0S4 1761 aa40.38■■■■■ 4.05
CMTM4-202ENST00000394106 TSPYL4Q9UJ04 414 aa40.37■■■■■ 4.05
CMTM4-202ENST00000394106 CHD4Q14839 1912 aa40.36■■■■■ 4.05
CMTM4-202ENST00000394106 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
CMTM4-202ENST00000394106 ANP32CO43423 234 aa40.36■■■■■ 4.05
CMTM4-202ENST00000394106 CCDC184Q52MB2 194 aa40.36■■■■■ 4.05
CMTM4-202ENST00000394106 PXDNLA1KZ92 1463 aa40.36■■■■■ 4.05
CMTM4-202ENST00000394106 SCN7AQ01118 1682 aa40.36■■■■■ 4.05
CMTM4-202ENST00000394106 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa40.34■■■■■ 4.05
CMTM4-202ENST00000394106 GRIN3BO60391 1043 aa40.34■■■■■ 4.05
CMTM4-202ENST00000394106 TGFB2P61812 414 aa40.34■■■■■ 4.05
CMTM4-202ENST00000394106 BICDL1Q6ZP65 573 aa40.34■■■■■ 4.05
CMTM4-202ENST00000394106 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
CMTM4-202ENST00000394106 A0A0G2JLW4 131 aa40.32■■■■■ 4.05
CMTM4-202ENST00000394106 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
CMTM4-202ENST00000394106 TRIM35Q9UPQ4 493 aa40.32■■■■■ 4.05
CMTM4-202ENST00000394106 NBPF26B4DH59 902 aa40.31■■■■■ 4.04
CMTM4-202ENST00000394106 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
CMTM4-202ENST00000394106 NBPF15Q8N660 670 aa40.31■■■■■ 4.04
CMTM4-202ENST00000394106 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
CMTM4-202ENST00000394106 CAMTA2O94983 1202 aa40.28■■■■■ 4.04
CMTM4-202ENST00000394106 DPEP1P16444 411 aa40.28■■■■■ 4.04
CMTM4-202ENST00000394106 TBC1D9BQ66K14 1250 aa40.28■■■■■ 4.04
CMTM4-202ENST00000394106 SERPINB2P05120 415 aa40.27■■■■■ 4.04
CMTM4-202ENST00000394106 BABAM1Q9NWV8 329 aa40.27■■■■■ 4.04
CMTM4-202ENST00000394106 BCORQ6W2J9 1755 aa40.27■■■■■ 4.04
CMTM4-202ENST00000394106 UTRNP46939 3433 aa40.27■■■■■ 4.04
CMTM4-202ENST00000394106 APAF1O14727 1248 aa40.26■■■■■ 4.04
CMTM4-202ENST00000394106 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
CMTM4-202ENST00000394106 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.03
CMTM4-202ENST00000394106 NRXN2Q9P2S2 1712 aa40.24■■■■■ 4.03
CMTM4-202ENST00000394106 MRS2Q9HD23 443 aa40.22■■■■■ 4.03
CMTM4-202ENST00000394106 NGEFQ8N5V2 710 aa40.2■■■■■ 4.03
CMTM4-202ENST00000394106 BCS1LQ9Y276 419 aa40.2■■■■■ 4.03
CMTM4-202ENST00000394106 CHL1O00533 1208 aa40.18■■■■■ 4.02
CMTM4-202ENST00000394106 CHRNA5P30532 468 aa40.18■■■■■ 4.02
CMTM4-202ENST00000394106 CARMIL3Q8ND23 1372 aa40.18■■■■■ 4.02
CMTM4-202ENST00000394106 MYL6BP14649 208 aa40.17■■■■■ 4.02
CMTM4-202ENST00000394106 SETDB2Q96T68 719 aa40.17■■■■■ 4.02
CMTM4-202ENST00000394106 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
CMTM4-202ENST00000394106 KCNA3P22001 575 aa40.16■■■■■ 4.02
CMTM4-202ENST00000394106 ZNF652Q9Y2D9 606 aa40.16■■■■■ 4.02
CMTM4-202ENST00000394106 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
CMTM4-202ENST00000394106 PIM2Q9P1W9 311 aa40.14■■■■■ 4.02
CMTM4-202ENST00000394106 CLEC4GQ6UXB4 293 aa40.13■■■■■ 4.01
CMTM4-202ENST00000394106 NPHP1O15259 732 aa40.11■■■■■ 4.01
CMTM4-202ENST00000394106 KRT24Q2M2I5 525 aa40.1■■■■■ 4.01
CMTM4-202ENST00000394106 CCDC24Q8N4L8 307 aa40.1■■■■■ 4.01
CMTM4-202ENST00000394106 CFAP44Q96MT7 982 aa40.1■■■■■ 4.01
CMTM4-202ENST00000394106 ERBB4Q15303 1308 aa40.1■■■■■ 4.01
CMTM4-202ENST00000394106 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa40.09■■■■■ 4.01
CMTM4-202ENST00000394106 PRR5LQ6MZQ0 368 aa40.09■■■■■ 4.01
CMTM4-202ENST00000394106 HLFQ16534 295 aa40.08■■■■■ 4.01
CMTM4-202ENST00000394106 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP40.08■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms