RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 PIM2Q9P1W9 311 aa7.59□□□□□ -1.19
RNU6-171P-201ENST00000384354 KDM2BQ8NHM5 1336 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 MRC1P22897 1456 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 SCN4AP35499 1836 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 FOXN1O15353 648 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 TM4SF1P30408 202 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC24Q8N4L8 307 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 SMC1BQ8NDV3 1235 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.58□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 LTBP1Q14766 1721 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADRA2BP18089 450 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 NFIXQ14938 502 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 DNAJC10Q8IXB1 793 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRPM7Q96QT4 1865 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 GLTPD2A6NH11 291 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 ERVV-2B6SEH9 535 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 THSD7BQ9C0I4 1608 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 COL4A5P29400 1685 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC34A2O95436 690 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 LMNB1P20700 586 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 CABP4P57796 275 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC39A6Q13433 755 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 COL15A1P39059 1388 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC51AQ86UW1 340 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 LGR6Q9HBX8 967 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 DDNO94850 711 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 SERPINB2P05120 415 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 OLFM4Q6UX06 510 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 C2CD5Q86YS7 1000 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 CNTNAP1P78357 1384 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.2
RNU6-171P-201ENST00000384354 C21orf2O43822 256 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 MTHFSP49914 203 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM161AQ3B820 660 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 TBC1D9BQ66K14 1250 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 NARFQ9UHQ1 456 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 PASKQ96RG2 1323 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF541Q9H0D2 1346 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 VEGFBP49765 207 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 LBX1P52954 281 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 TTLL6Q8N841 843 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 CREBZFQ9NS37 354 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 TAF1P21675 1872 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 NUP98P52948 1817 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZPR1O75312 459 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 SULT6B1Q6IMI4 303 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRR5LQ6MZQ0 368 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 CHADLQ6NUI6 762 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 POLR3GLQ9BT43 218 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 LAMB2P55268 1798 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 CANXP27824 592 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 ERFEQ4G0M1 354 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC52A2Q9HAB3 445 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 SNED1Q8TER0 1413 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 DLG5Q8TDM6 1919 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 RNMTO43148 476 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 HMOX1P09601 288 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 IL13P35225 146 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 C1orf141Q5JVX7 400 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 ABHD8Q96I13 439 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 WBP1LQ9NX94 342 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 TSKSQ9UJT2 592 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 LAMB4A4D0S4 1761 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 H0YIN7 160 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 KCNQ3O43525 872 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 EIF5P55010 431 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 AMOTQ4VCS5 1084 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 TAOK3Q9H2K8 898 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 RNF123Q5XPI4 1314 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 LTBP3Q9NS15 1303 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-171P-201ENST00000384354 CAMTA2O94983 1202 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-171P-201ENST00000384354 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.4 ms