RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371786.3

C9orf116-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 116, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf116, Length 612 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116-201ENST00000371786 CACNA1FO60840 1977 aa22.76■■□□□ 1.23
C9orf116-201ENST00000371786 PALLDQ8WX93 1383 aa22.76■■□□□ 1.23
C9orf116-201ENST00000371786 FKBP8Q14318 412 aa22.75■■□□□ 1.23
C9orf116-201ENST00000371786 PDE3AQ14432 1141 aa22.75■■□□□ 1.23
C9orf116-201ENST00000371786 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.75■■□□□ 1.23
C9orf116-201ENST00000371786 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.75■■□□□ 1.23
C9orf116-201ENST00000371786 G2E3Q7L622 706 aa22.75■■□□□ 1.23
C9orf116-201ENST00000371786 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.74■■□□□ 1.23
C9orf116-201ENST00000371786 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.74■■□□□ 1.23
C9orf116-201ENST00000371786 MS4A1P11836 297 aa22.73■■□□□ 1.23
C9orf116-201ENST00000371786 TRIM27P14373 513 aa22.73■■□□□ 1.23
C9orf116-201ENST00000371786 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
C9orf116-201ENST00000371786 TNNQ9UQP3 1299 aa22.73■■□□□ 1.23
C9orf116-201ENST00000371786 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.72■■□□□ 1.23
C9orf116-201ENST00000371786 SIK1P57059 783 aa22.72■■□□□ 1.23
C9orf116-201ENST00000371786 PDIA6Q15084 440 aa22.72■■□□□ 1.23
C9orf116-201ENST00000371786 PTPRCP08575 1304 aa22.72■■□□□ 1.23
C9orf116-201ENST00000371786 ERBB4Q15303 1308 aa22.72■■□□□ 1.23
C9orf116-201ENST00000371786 ANXA1P04083 346 aa22.71■■□□□ 1.23
C9orf116-201ENST00000371786 PROSER3Q2NL68 480 aa22.71■■□□□ 1.23
C9orf116-201ENST00000371786 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
C9orf116-201ENST00000371786 HYPKQ9NX55 129 aa22.71■■□□□ 1.23
C9orf116-201ENST00000371786 TJP1Q07157 1748 aa22.71■■□□□ 1.23
C9orf116-201ENST00000371786 TRIM37O94972 964 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf116-201ENST00000371786 STARD3NLO95772 234 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf116-201ENST00000371786 ATP6V1AP38606 617 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf116-201ENST00000371786 FLIIQ13045 1269 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf116-201ENST00000371786 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
C9orf116-201ENST00000371786 PANK1Q8TE04 598 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf116-201ENST00000371786 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf116-201ENST00000371786 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
C9orf116-201ENST00000371786 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
C9orf116-201ENST00000371786 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.69■■□□□ 1.22
C9orf116-201ENST00000371786 RLBP1P12271 317 aa22.69■■□□□ 1.22
C9orf116-201ENST00000371786 A1BGP04217 495 aa22.68■■□□□ 1.22
C9orf116-201ENST00000371786 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
C9orf116-201ENST00000371786 CRBNQ96SW2 442 aa22.68■■□□□ 1.22
C9orf116-201ENST00000371786 NBPF26B4DH59 902 aa22.67■■□□□ 1.22
C9orf116-201ENST00000371786 MYL6BP14649 208 aa22.67■■□□□ 1.22
C9orf116-201ENST00000371786 NBPF14Q5TI25 921 aa22.67■■□□□ 1.22
C9orf116-201ENST00000371786 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
C9orf116-201ENST00000371786 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.67■■□□□ 1.22
C9orf116-201ENST00000371786 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
C9orf116-201ENST00000371786 NBPF15Q8N660 670 aa22.67■■□□□ 1.22
C9orf116-201ENST00000371786 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
C9orf116-201ENST00000371786 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
C9orf116-201ENST00000371786 ITPK1Q13572 414 aa22.66■■□□□ 1.22
C9orf116-201ENST00000371786 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.66■■□□□ 1.22
C9orf116-201ENST00000371786 LY75O60449 1722 aa22.65■■□□□ 1.22
C9orf116-201ENST00000371786 ABCC4O15439 1325 aa22.65■■□□□ 1.22
C9orf116-201ENST00000371786 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.65■■□□□ 1.22
C9orf116-201ENST00000371786 COG6Q9Y2V7 657 aa22.64■■□□□ 1.21
C9orf116-201ENST00000371786 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.63■■□□□ 1.21
C9orf116-201ENST00000371786 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.63■■□□□ 1.21
C9orf116-201ENST00000371786 COPS6Q7L5N1 327 aa22.62■■□□□ 1.21
C9orf116-201ENST00000371786 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
C9orf116-201ENST00000371786 F6X3S4 739 aa22.61■■□□□ 1.21
C9orf116-201ENST00000371786 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
C9orf116-201ENST00000371786 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
C9orf116-201ENST00000371786 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
C9orf116-201ENST00000371786 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.61■■□□□ 1.21
C9orf116-201ENST00000371786 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
C9orf116-201ENST00000371786 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
C9orf116-201ENST00000371786 KCNQ4P56696 695 aa22.6■■□□□ 1.21
C9orf116-201ENST00000371786 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
C9orf116-201ENST00000371786 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
C9orf116-201ENST00000371786 KSR2Q6VAB6 950 aa22.6■■□□□ 1.21
C9orf116-201ENST00000371786 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.6■■□□□ 1.21
C9orf116-201ENST00000371786 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.6■■□□□ 1.21
C9orf116-201ENST00000371786 RREB1Q92766 1687 aa22.59■■□□□ 1.21
C9orf116-201ENST00000371786 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.59■■□□□ 1.21
C9orf116-201ENST00000371786 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.59■■□□□ 1.21
C9orf116-201ENST00000371786 ADCY9O60503 1353 aa22.59■■□□□ 1.21
C9orf116-201ENST00000371786 PLSCR1O15162 318 aa22.58■■□□□ 1.21
C9orf116-201ENST00000371786 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.58■■□□□ 1.21
C9orf116-201ENST00000371786 APBA3O96018 575 aa22.57■■□□□ 1.2
C9orf116-201ENST00000371786 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
C9orf116-201ENST00000371786 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.57■■□□□ 1.2
C9orf116-201ENST00000371786 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.57■■□□□ 1.2
C9orf116-201ENST00000371786 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.57■■□□□ 1.2
C9orf116-201ENST00000371786 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
C9orf116-201ENST00000371786 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.57■■□□□ 1.2
C9orf116-201ENST00000371786 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.56■■□□□ 1.2
C9orf116-201ENST00000371786 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
C9orf116-201ENST00000371786 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.56■■□□□ 1.2
C9orf116-201ENST00000371786 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
C9orf116-201ENST00000371786 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.56■■□□□ 1.2
C9orf116-201ENST00000371786 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.56■■□□□ 1.2
C9orf116-201ENST00000371786 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.56■■□□□ 1.2
C9orf116-201ENST00000371786 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.55■■□□□ 1.2
C9orf116-201ENST00000371786 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.55■■□□□ 1.2
C9orf116-201ENST00000371786 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.55■■□□□ 1.2
C9orf116-201ENST00000371786 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.55■■□□□ 1.2
C9orf116-201ENST00000371786 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
C9orf116-201ENST00000371786 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
C9orf116-201ENST00000371786 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
C9orf116-201ENST00000371786 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
C9orf116-201ENST00000371786 EP400Q96L91 3159 aa22.53■■□□□ 1.2
C9orf116-201ENST00000371786 AAMPQ13685 434 aa22.53■■□□□ 1.2
C9orf116-201ENST00000371786 TXNRD1Q16881 649 aa22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms