RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335523.7

VSTM2B-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VSTM2B, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2B-201ENST00000335523 KCNQ2O43526 872 aa24.88■■□□□ 1.57
VSTM2B-201ENST00000335523 PANK1Q8TE04 598 aa24.88■■□□□ 1.57
VSTM2B-201ENST00000335523 CLUAP1Q96AJ1 413 aa24.88■■□□□ 1.57
VSTM2B-201ENST00000335523 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.88■■□□□ 1.57
VSTM2B-201ENST00000335523 USP16Q9Y5T5 823 aa24.88■■□□□ 1.57
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM196AQ6ZSG2 479 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM2B-201ENST00000335523 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.57
VSTM2B-201ENST00000335523 HYPKQ9NX55 129 aa24.87■■□□□ 1.57
VSTM2B-201ENST00000335523 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.86■■□□□ 1.57
VSTM2B-201ENST00000335523 FLIIQ13045 1269 aa24.85■■□□□ 1.57
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM182BQ5T319 152 aa24.85■■□□□ 1.57
VSTM2B-201ENST00000335523 G2E3Q7L622 706 aa24.85■■□□□ 1.57
VSTM2B-201ENST00000335523 KCPQ6ZWJ8 1503 aa24.85■■□□□ 1.57
VSTM2B-201ENST00000335523 ERBB4Q15303 1308 aa24.85■■□□□ 1.57
VSTM2B-201ENST00000335523 ITGB4P16144 1822 aa24.84■■□□□ 1.57
VSTM2B-201ENST00000335523 TNNQ9UQP3 1299 aa24.84■■□□□ 1.57
VSTM2B-201ENST00000335523 STARD3NLO95772 234 aa24.83■■□□□ 1.57
VSTM2B-201ENST00000335523 RLBP1P12271 317 aa24.83■■□□□ 1.57
VSTM2B-201ENST00000335523 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.83■■□□□ 1.57
VSTM2B-201ENST00000335523 COG6Q9Y2V7 657 aa24.83■■□□□ 1.57
VSTM2B-201ENST00000335523 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
VSTM2B-201ENST00000335523 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.83■■□□□ 1.56
VSTM2B-201ENST00000335523 PAPPAQ13219 1627 aa24.82■■□□□ 1.56
VSTM2B-201ENST00000335523 MVPQ14764 893 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
VSTM2B-201ENST00000335523 PDIA6Q15084 440 aa24.81■■□□□ 1.56
VSTM2B-201ENST00000335523 AAMPQ13685 434 aa24.8■■□□□ 1.56
VSTM2B-201ENST00000335523 DNAJC10Q8IXB1 793 aa24.8■■□□□ 1.56
VSTM2B-201ENST00000335523 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
VSTM2B-201ENST00000335523 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
VSTM2B-201ENST00000335523 ABCC4O15439 1325 aa24.8■■□□□ 1.56
VSTM2B-201ENST00000335523 UBR2Q8IWV8 1755 aa24.79■■□□□ 1.56
VSTM2B-201ENST00000335523 PALLDQ8WX93 1383 aa24.79■■□□□ 1.56
VSTM2B-201ENST00000335523 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.79■■□□□ 1.56
VSTM2B-201ENST00000335523 ANXA1P04083 346 aa24.79■■□□□ 1.56
VSTM2B-201ENST00000335523 SIK1P57059 783 aa24.79■■□□□ 1.56
VSTM2B-201ENST00000335523 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.79■■□□□ 1.56
VSTM2B-201ENST00000335523 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
VSTM2B-201ENST00000335523 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.79■■□□□ 1.56
VSTM2B-201ENST00000335523 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
VSTM2B-201ENST00000335523 PROSER3Q2NL68 480 aa24.78■■□□□ 1.56
VSTM2B-201ENST00000335523 ITPRIPQ8IWB1 547 aa24.78■■□□□ 1.56
VSTM2B-201ENST00000335523 MYL6BP14649 208 aa24.77■■□□□ 1.56
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC4A9Q96Q91 983 aa24.77■■□□□ 1.56
VSTM2B-201ENST00000335523 CACNA1FO60840 1977 aa24.77■■□□□ 1.56
VSTM2B-201ENST00000335523 ATP6V1AP38606 617 aa24.77■■□□□ 1.56
VSTM2B-201ENST00000335523 A1BGP04217 495 aa24.76■■□□□ 1.55
VSTM2B-201ENST00000335523 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
VSTM2B-201ENST00000335523 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
VSTM2B-201ENST00000335523 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.75■■□□□ 1.55
VSTM2B-201ENST00000335523 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
VSTM2B-201ENST00000335523 NBPF26B4DH59 902 aa24.73■■□□□ 1.55
VSTM2B-201ENST00000335523 F6X3S4 739 aa24.73■■□□□ 1.55
VSTM2B-201ENST00000335523 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
VSTM2B-201ENST00000335523 NBPF14Q5TI25 921 aa24.73■■□□□ 1.55
VSTM2B-201ENST00000335523 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.73■■□□□ 1.55
VSTM2B-201ENST00000335523 KSR2Q6VAB6 950 aa24.73■■□□□ 1.55
VSTM2B-201ENST00000335523 COPS6Q7L5N1 327 aa24.73■■□□□ 1.55
VSTM2B-201ENST00000335523 NBPF15Q8N660 670 aa24.73■■□□□ 1.55
VSTM2B-201ENST00000335523 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.73■■□□□ 1.55
VSTM2B-201ENST00000335523 C5P01031 1676 aa24.73■■□□□ 1.55
VSTM2B-201ENST00000335523 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.72■■□□□ 1.55
VSTM2B-201ENST00000335523 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
VSTM2B-201ENST00000335523 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.72■■□□□ 1.55
VSTM2B-201ENST00000335523 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.71■■□□□ 1.55
VSTM2B-201ENST00000335523 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.71■■□□□ 1.55
VSTM2B-201ENST00000335523 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.7■■□□□ 1.55
VSTM2B-201ENST00000335523 NHSQ6T4R5 1651 aa24.7■■□□□ 1.54
VSTM2B-201ENST00000335523 TRIM37O94972 964 aa24.7■■□□□ 1.54
VSTM2B-201ENST00000335523 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.7■■□□□ 1.54
VSTM2B-201ENST00000335523 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.7■■□□□ 1.54
VSTM2B-201ENST00000335523 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
VSTM2B-201ENST00000335523 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.68■■□□□ 1.54
VSTM2B-201ENST00000335523 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
VSTM2B-201ENST00000335523 ITPK1Q13572 414 aa24.68■■□□□ 1.54
VSTM2B-201ENST00000335523 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.68■■□□□ 1.54
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC87Q9NVE4 849 aa24.67■■□□□ 1.54
VSTM2B-201ENST00000335523 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
VSTM2B-201ENST00000335523 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.66■■□□□ 1.54
VSTM2B-201ENST00000335523 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
VSTM2B-201ENST00000335523 ADCY9O60503 1353 aa24.66■■□□□ 1.54
VSTM2B-201ENST00000335523 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
VSTM2B-201ENST00000335523 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.65■■□□□ 1.54
VSTM2B-201ENST00000335523 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.65■■□□□ 1.54
VSTM2B-201ENST00000335523 CRKLP46109 303 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
VSTM2B-201ENST00000335523 BAG6P46379 1132 aa24.64■■□□□ 1.54
VSTM2B-201ENST00000335523 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.64■■□□□ 1.54
VSTM2B-201ENST00000335523 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.64■■□□□ 1.54
VSTM2B-201ENST00000335523 BEND3Q5T5X7 828 aa24.64■■□□□ 1.53
VSTM2B-201ENST00000335523 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
VSTM2B-201ENST00000335523 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.64■■□□□ 1.53
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
VSTM2B-201ENST00000335523 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.64■■□□□ 1.53
VSTM2B-201ENST00000335523 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.63■■□□□ 1.53
VSTM2B-201ENST00000335523 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
VSTM2B-201ENST00000335523 BTAF1O14981 1849 aa24.62■■□□□ 1.53
VSTM2B-201ENST00000335523 SBF2Q86WG5 1849 aa24.62■■□□□ 1.53
VSTM2B-201ENST00000335523 ALDH1L1O75891 902 aa24.62■■□□□ 1.53
VSTM2B-201ENST00000335523 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms