RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327331.2

CDCA8-201, Transcript of cell division cycle associated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDCA8, Length 2,303 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8-201ENST00000327331 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa14.61□□□□□ -0.07
CDCA8-201ENST00000327331 ACSBG1Q96GR2 724 aa14.61□□□□□ -0.07
CDCA8-201ENST00000327331 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.61□□□□□ -0.07
CDCA8-201ENST00000327331 USP16Q9Y5T5 823 aa14.61□□□□□ -0.07
CDCA8-201ENST00000327331 PTPRCP08575 1304 aa14.61□□□□□ -0.07
CDCA8-201ENST00000327331 HEG1Q9ULI3 1381 aa14.6□□□□□ -0.07
CDCA8-201ENST00000327331 ERVV-2B6SEH9 535 aa14.6□□□□□ -0.07
CDCA8-201ENST00000327331 MYL6BP14649 208 aa14.6□□□□□ -0.07
CDCA8-201ENST00000327331 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa14.6□□□□□ -0.07
CDCA8-201ENST00000327331 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CDCA8-201ENST00000327331 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CDCA8-201ENST00000327331 PIGBQ92521 554 aa14.6□□□□□ -0.07
CDCA8-201ENST00000327331 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.6□□□□□ -0.07
CDCA8-201ENST00000327331 C5P01031 1676 aa14.59□□□□□ -0.07
CDCA8-201ENST00000327331 DDRGK1Q96HY6 314 aa14.59□□□□□ -0.07
CDCA8-201ENST00000327331 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.59□□□□□ -0.07
CDCA8-201ENST00000327331 TNS2Q63HR2 1409 aa14.59□□□□□ -0.07
CDCA8-201ENST00000327331 HOXB7P09629 217 aa14.59□□□□□ -0.07
CDCA8-201ENST00000327331 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CDCA8-201ENST00000327331 NWD2Q9ULI1 1742 aa14.58□□□□□ -0.07
CDCA8-201ENST00000327331 NFKBIBQ15653 356 aa14.58□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 KAT6BQ8WYB5 2073 aa14.58□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 VPS72Q15906 364 aa14.58□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 FAM182BQ5T319 152 aa14.58□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 MEIS3Q99687 375 aa14.58□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 AFF2P51816 1311 aa14.57□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 WNK3Q9BYP7 1800 aa14.57□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 PDIA6Q15084 440 aa14.57□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 PI4KAP2A4QPH2 592 aa14.56□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.56□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 BARGINQ6ZT62 677 aa14.55□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.55□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 PKNOX2Q96KN3 472 aa14.55□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 ATG3Q9NT62 314 aa14.55□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 RGS3P49796 1198 aa14.55□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 GLI3P10071 1580 aa14.54□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 KCPQ6ZWJ8 1503 aa14.54□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 KCNQ2O43526 872 aa14.54□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 A1BGP04217 495 aa14.54□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 ADCY9O60503 1353 aa14.53□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.53□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.53□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 COPS6Q7L5N1 327 aa14.52□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 SIRT2Q8IXJ6 389 aa14.52□□□□□ -0.08
CDCA8-201ENST00000327331 DOT1LQ8TEK3 1739 aa14.52□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 BCL9O00512 1426 aa14.52□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 NBPF26B4DH59 902 aa14.52□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 AAMPQ13685 434 aa14.52□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 NBPF14Q5TI25 921 aa14.52□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 PTF1AQ7RTS3 328 aa14.52□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 DNAJC10Q8IXB1 793 aa14.52□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 NBPF15Q8N660 670 aa14.52□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.52□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 HYPKQ9NX55 129 aa14.52□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 ITGB4P16144 1822 aa14.51□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 SLC4A9Q96Q91 983 aa14.51□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 PAPPAQ13219 1627 aa14.5□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 BEND3Q5T5X7 828 aa14.49□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.49□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa14.49□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa14.49□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 UBR2Q8IWV8 1755 aa14.49□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 KSR2Q6VAB6 950 aa14.49□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 RIC3Q7Z5B4 369 aa14.49□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.49□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 KCNQ4P56696 695 aa14.48□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 TTLL7Q6ZT98 887 aa14.48□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 ARXQ96QS3 562 aa14.48□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 USP44Q9H0E7 712 aa14.48□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 CEP85Q6P2H3 762 aa14.47□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 APBB1O00213 710 aa14.47□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 MYD88Q99836 296 aa14.47□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 ATP10DQ9P241 1426 aa14.46□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 EP400Q96L91 3159 aa14.46□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 CACNA1FO60840 1977 aa14.46□□□□□ -0.09
CDCA8-201ENST00000327331 SLC4A3P48751 1232 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms