RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264839.11

RIMS1-201, Transcript of regulating synaptic membrane exocytosis 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RIMS1, Length 7,055 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS1-201ENST00000264839 C8orf76Q96K31 380 aa14.67□□□□□ -0.06
RIMS1-201ENST00000264839 NACAP1Q9BZK3 213 aa14.67□□□□□ -0.06
RIMS1-201ENST00000264839 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
RIMS1-201ENST00000264839 TMPOP42166 694 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RIMS1-201ENST00000264839 MAP9Q49MG5 647 aa14.66□□□□□ -0.06
RIMS1-201ENST00000264839 ANO6Q4KMQ2 910 aa14.66□□□□□ -0.06
RIMS1-201ENST00000264839 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.66□□□□□ -0.06
RIMS1-201ENST00000264839 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
RIMS1-201ENST00000264839 MIA2Q96PC5 1412 aa14.66□□□□□ -0.06
RIMS1-201ENST00000264839 DYNC1I1O14576 645 aa14.65□□□□□ -0.06
RIMS1-201ENST00000264839 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RIMS1-201ENST00000264839 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RIMS1-201ENST00000264839 WDR63Q8IWG1 891 aa14.65□□□□□ -0.06
RIMS1-201ENST00000264839 NOP2P46087 812 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RIMS1-201ENST00000264839 GTF3C6Q969F1 213 aa14.65□□□□□ -0.06
RIMS1-201ENST00000264839 DNAI1Q9UI46 699 aa14.65□□□□□ -0.06
RIMS1-201ENST00000264839 SMIM23A6NLE4 172 aa14.65□□□□□ -0.06
RIMS1-201ENST00000264839 RARSP54136 660 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RIMS1-201ENST00000264839 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RIMS1-201ENST00000264839 NEBLO76041 1014 aa14.65□□□□□ -0.06
RIMS1-201ENST00000264839 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RIMS1-201ENST00000264839 CCDC186Q7Z3E2 898 aa14.64□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.64□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 GBP3Q9H0R5 595 aa14.64□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 ZNF165P49910 485 aa14.64□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 CEP57Q86XR8 500 aa14.64□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 AIDAQ96BJ3 306 aa14.64□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 FKBP15Q5T1M5 1219 aa14.64□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 CYB5RLQ6IPT4 315 aa14.64□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 GPRASP1Q5JY77 1395 aa14.64□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 CDKL5O76039 1030 aa14.63□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 CCDC175P0C221 793 aa14.63□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 STX6O43752 255 aa14.63□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 CCDC91Q7Z6B0 441 aa14.63□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 USP48Q86UV5 1035 aa14.63□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 NACADO15069 1562 aa14.63□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 CCDC160A6NGH7 325 aa14.63□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 DUSP27Q5VZP5 1158 aa14.63□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 VPS18Q9P253 973 aa14.63□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 KIF21BO75037 1637 aa14.63□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 FAM170AA1A519 330 aa14.63□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 ATF3P18847 181 aa14.62□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 MYD88Q99836 296 aa14.62□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 VAT1LQ9HCJ6 419 aa14.62□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 AFMP43652 599 aa14.62□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 ANAPC15P60006 121 aa14.62□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 SCLT1Q96NL6 688 aa14.62□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 GOLGA8BA8MQT2 603 aa14.62□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 AFAP1Q8N556 730 aa14.62□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 KRT222Q8N1A0 295 aa14.62□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 PAFAH1B1P43034 410 aa14.62□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa14.61□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 FBLN1P23142 703 aa14.61□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 DNAJC25Q9H1X3 360 aa14.61□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 HYPKQ9NX55 129 aa14.61□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa14.61□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 ERBINQ96RT1 1412 aa14.61□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 SNRKQ9NRH2 765 aa14.61□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.6□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 RHOXF2BP0C7M4 288 aa14.6□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 STX1AQ16623 288 aa14.6□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 METTL24Q5JXM2 366 aa14.6□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 TMCO4Q5TGY1 634 aa14.6□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 LRSAM1Q6UWE0 723 aa14.6□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 RHOXF2Q9BQY4 288 aa14.6□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.6□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.6□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 SKILP12757 684 aa14.6□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 RGS22Q8NE09 1264 aa14.6□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 ATRIPQ8WXE1 791 aa14.6□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 ZEB2O60315 1214 aa14.6□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 TRIM27P14373 513 aa14.59□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 MICALCLQ6ZW33 695 aa14.59□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 TXLNBQ8N3L3 684 aa14.59□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 CFTRP13569 1480 aa14.59□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 MYOM3Q5VTT5 1437 aa14.59□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 AOPEPQ8N6M6 819 aa14.59□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 CEP131Q9UPN4 1083 aa14.59□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 TNNQ9UQP3 1299 aa14.59□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 CAPN2P17655 700 aa14.59□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 ARID5AQ03989 594 aa14.59□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RIMS1-201ENST00000264839 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms