RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233330.6

RTKN-201, Transcript of rhotekin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RTKN, Length 2,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKN-201ENST00000233330 CHRNA2Q15822 529 aa24.3■■□□□ 1.48
RTKN-201ENST00000233330 SPG7Q9UQ90 795 aa24.3■■□□□ 1.48
RTKN-201ENST00000233330 C5P01031 1676 aa24.29■■□□□ 1.48
RTKN-201ENST00000233330 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.29■■□□□ 1.48
RTKN-201ENST00000233330 POLA2Q14181 598 aa24.29■■□□□ 1.48
RTKN-201ENST00000233330 PROSER3Q2NL68 480 aa24.29■■□□□ 1.48
RTKN-201ENST00000233330 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.29■■□□□ 1.48
RTKN-201ENST00000233330 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.29■■□□□ 1.48
RTKN-201ENST00000233330 MX1P20591 662 aa24.28■■□□□ 1.48
RTKN-201ENST00000233330 USP26Q9BXU7 913 aa24.28■■□□□ 1.48
RTKN-201ENST00000233330 BRINP3Q76B58 766 aa24.27■■□□□ 1.48
RTKN-201ENST00000233330 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.27■■□□□ 1.48
RTKN-201ENST00000233330 ZNF790Q6PG37 636 aa24.26■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 MRC1P22897 1456 aa24.26■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 GSE1Q14687 1217 aa24.26■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 KSR2Q6VAB6 950 aa24.26■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.26■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 HYPKQ9NX55 129 aa24.26■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.26■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.25■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 STAP2Q9UGK3 403 aa24.25■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 SRGAP3O43295 1099 aa24.24■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 RAB11FIP3O75154 756 aa24.24■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 ALDH1L1O75891 902 aa24.24■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 DDIT3P35638 169 aa24.24■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.24■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 SLC39A6Q13433 755 aa24.23■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 SURF6O75683 361 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.23■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 ERC2O15083 957 aa24.22■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 REC8O95072 547 aa24.22■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 PDIA6Q15084 440 aa24.22■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 AOX1Q06278 1338 aa24.21■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 CYP27B1O15528 508 aa24.21■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 RABEP1Q15276 862 aa24.21■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 DCAF5Q96JK2 942 aa24.2■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa24.2■■□□□ 1.47
RTKN-201ENST00000233330 MTX1Q13505 466 aa24.2■■□□□ 1.46
RTKN-201ENST00000233330 RHPN1Q8TCX5 695 aa24.19■■□□□ 1.46
RTKN-201ENST00000233330 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
RTKN-201ENST00000233330 KIF1BPQ96EK5 621 aa24.18■■□□□ 1.46
RTKN-201ENST00000233330 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
RTKN-201ENST00000233330 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
RTKN-201ENST00000233330 AK9Q5TCS8 1911 aa24.18■■□□□ 1.46
RTKN-201ENST00000233330 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
RTKN-201ENST00000233330 LINS1Q8NG48 757 aa24.17■■□□□ 1.46
RTKN-201ENST00000233330 ABCA3Q99758 1704 aa24.17■■□□□ 1.46
RTKN-201ENST00000233330 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
RTKN-201ENST00000233330 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa24.16■■□□□ 1.46
RTKN-201ENST00000233330 SLAIN2Q9P270 581 aa24.16■■□□□ 1.46
RTKN-201ENST00000233330 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
RTKN-201ENST00000233330 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
RTKN-201ENST00000233330 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa24.15■■□□□ 1.46
RTKN-201ENST00000233330 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
RTKN-201ENST00000233330 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.15■■□□□ 1.46
RTKN-201ENST00000233330 RILPL2Q969X0 211 aa24.15■■□□□ 1.46
RTKN-201ENST00000233330 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.15■■□□□ 1.46
RTKN-201ENST00000233330 HDAC5Q9UQL6 1122 aa24.15■■□□□ 1.46
RTKN-201ENST00000233330 UTYO14607 1347 aa24.15■■□□□ 1.46
RTKN-201ENST00000233330 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.14■■□□□ 1.46
RTKN-201ENST00000233330 MCM4P33991 863 aa24.14■■□□□ 1.46
RTKN-201ENST00000233330 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.14■■□□□ 1.46
RTKN-201ENST00000233330 CHMLP26374 656 aa24.14■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 TTC5Q8N0Z6 440 aa24.14■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.14■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 GLI3P10071 1580 aa24.14■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 GRM8O00222 908 aa24.13■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.13■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.13■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 MYL6BP14649 208 aa24.12■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 PI4K2BQ8TCG2 481 aa24.12■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.11■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.11■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 IGKV5-2P06315 115 aa24.1■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 CABP4P57796 275 aa24.1■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.1■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.1■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 USP16Q9Y5T5 823 aa24.1■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 KAZALD1Q96I82 304 aa24.1■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 SUCLG2Q96I99 432 aa24.1■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 COPS6Q7L5N1 327 aa24.09■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.08■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 FOXD4L1Q9NU39 408 aa24.08■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.08■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.08■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 RAB3GAP1Q15042 981 aa24.08■■□□□ 1.45
RTKN-201ENST00000233330 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.08■■□□□ 1.44
RTKN-201ENST00000233330 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.07■■□□□ 1.44
RTKN-201ENST00000233330 ST18O60284 1047 aa24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.4 ms