RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
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USP18-201ENST00000215794 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
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USP18-201ENST00000215794 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.6■■□□□ 1.21
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USP18-201ENST00000215794 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.58■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 EP400Q96L91 3159 aa22.58■■□□□ 1.21
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USP18-201ENST00000215794 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.54■■□□□ 1.2
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USP18-201ENST00000215794 CABP4P57796 275 aa22.52■■□□□ 1.2
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USP18-201ENST00000215794 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
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USP18-201ENST00000215794 USP44Q9H0E7 712 aa22.46■■□□□ 1.19
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USP18-201ENST00000215794 PIGBQ92521 554 aa22.45■■□□□ 1.18
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USP18-201ENST00000215794 KCNQ2O43526 872 aa22.44■■□□□ 1.18
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USP18-201ENST00000215794 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.42■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.42■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.42■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 SDSP20132 328 aa22.4■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 PROSER3Q2NL68 480 aa22.4■■□□□ 1.18
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