RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000198767.10

RRN3-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RRN3, Length 3,762 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-201ENST00000198767 MYO3AQ8NEV4 1616 aa10.67□□□□□ -0.7
RRN3-201ENST00000198767 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa10.67□□□□□ -0.7
RRN3-201ENST00000198767 USP26Q9BXU7 913 aa10.67□□□□□ -0.7
RRN3-201ENST00000198767 PODXL2Q9NZ53 605 aa10.67□□□□□ -0.7
RRN3-201ENST00000198767 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
RRN3-201ENST00000198767 IQSEC2Q5JU85 1478 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3-201ENST00000198767 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3-201ENST00000198767 KIF13AQ9H1H9 1805 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3-201ENST00000198767 NPHP3Q7Z494 1330 aa10.66□□□□□ -0.7
RRN3-201ENST00000198767 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
RRN3-201ENST00000198767 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP10.66□□□□□ -0.7
RRN3-201ENST00000198767 SRGAP3O43295 1099 aa10.65□□□□□ -0.7
RRN3-201ENST00000198767 PALD1Q9ULE6 856 aa10.65□□□□□ -0.7
RRN3-201ENST00000198767 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa10.65□□□□□ -0.7
RRN3-201ENST00000198767 RABEP1Q15276 862 aa10.65□□□□□ -0.7
RRN3-201ENST00000198767 NUTM1Q86Y26 1132 aa10.65□□□□□ -0.7
RRN3-201ENST00000198767 SPC24Q8NBT2 197 aa10.65□□□□□ -0.7
RRN3-201ENST00000198767 PRDM4Q9UKN5 801 aa10.65□□□□□ -0.7
RRN3-201ENST00000198767 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
RRN3-201ENST00000198767 SPG7Q9UQ90 795 aa10.65□□□□□ -0.7
RRN3-201ENST00000198767 TTC22Q5TAA0 569 aa10.65□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 GCC1Q96CN9 775 aa10.65□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 SLAIN2Q9P270 581 aa10.65□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 NUCB2P80303 420 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 ANO2Q9NQ90 1003 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 ST18O60284 1047 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 KCNJ4P48050 445 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 CCT4P50991 539 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 LRRC7Q96NW7 1537 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 NEURL4Q96JN8 1562 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 MAP3K5Q99683 1374 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 NEXNQ0ZGT2 675 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 ARHGEF25Q86VW2 580 aa10.64□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 IGSF1Q8N6C5 1336 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 GNAI3P08754 354 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 ZNF853P0CG23 659 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 ZNF445P59923 1031 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 TMX3Q96JJ7 454 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 IFT172Q9UG01 1749 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 AMOTQ4VCS5 1084 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa10.63□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 CPA1P15085 419 aa10.62□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 RNMTO43148 476 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 AKAP4Q5JQC9 854 aa10.62□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 LRSAM1Q6UWE0 723 aa10.62□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 SHPRHQ149N8 1683 aa10.61□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 DDX58O95786 925 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 DNAAF4Q8WXU2 420 aa10.61□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 ARHGAP45Q92619 1136 aa10.61□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 FIBPO43427 364 aa10.61□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 PROSER3Q2NL68 480 aa10.61□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 MYD88Q99836 296 aa10.61□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 ZBTB3Q9H5J0 574 aa10.61□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 IFNL2Q8IZJ0 200 aa10.6□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 TSPY26PQ9H489 355 aa10.6□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 DLC1Q96QB1 1528 aa10.6□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 CEP85Q6P2H3 762 aa10.6□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa10.6□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 TECPR2O15040 1411 aa10.6□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 COPS6Q7L5N1 327 aa10.6□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 LRRCC1Q9C099 1032 aa10.6□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 KIAA0232Q92628 1395 aa10.6□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa10.59□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 PDLIM2Q96JY6 352 aa10.59□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 CCDC39Q9UFE4 941 aa10.59□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 CNPY2Q9Y2B0 182 aa10.59□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 ARHGEF10O15013 1369 aa10.59□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 PTPRCP08575 1304 aa10.59□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 KIAA2012Q0VF49 1180 aa10.59□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa10.59□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 GIMAP6Q6P9H5 292 aa10.59□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 SASS6Q6UVJ0 657 aa10.59□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 USP48Q86UV5 1035 aa10.59□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 XAGE3Q8WTP9 111 aa10.59□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 BTG4Q9NY30 223 aa10.59□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 PIK3R4Q99570 1358 aa10.59□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 NPHP1O15259 732 aa10.59□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 UNC5CLQ8IV45 518 aa10.59□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 IL25Q9H293 177 aa10.59□□□□□ -0.71
RRN3-201ENST00000198767 PTMSP20962 102 aa10.58□□□□□ -0.72
RRN3-201ENST00000198767 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
RRN3-201ENST00000198767 ATP2B3Q16720 1220 aa10.58□□□□□ -0.72
RRN3-201ENST00000198767 TAF7LQ5H9L4 462 aa10.58□□□□□ -0.72
RRN3-201ENST00000198767 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
RRN3-201ENST00000198767 DCTPP1Q9H773 170 aa10.58□□□□□ -0.72
RRN3-201ENST00000198767 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms