RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641549.1

PTPRVP-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

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Gene PTPRVP, Length 5,067 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-205ENST00000641549 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 HOXC12P31275 282 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 TRIM74Q86UV6 250 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 KCT2Q8NC54 265 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 BBS10Q8TAM1 723 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 BCL2L14Q9BZR8 327 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 ETAA1Q9NY74 926 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 AREL1O15033 823 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 SLC22A1O15245 554 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 PLOD3O60568 738 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 APBB3O95704 486 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 PENKP01210 267 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 CDKL4Q5MAI5 379 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 PJA1Q8NG27 643 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 OR52E4Q8NGH9 312 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 CCDC106Q9BWC9 280 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 PIGUQ9H490 435 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 HRASLS2Q9NWW9 162 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 A0A1W2PQU0 124 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 OPN1SWP03999 348 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 MOGSQ13724 837 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 MANEALQ5VSG8 457 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 HACD2Q6Y1H2 254 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 SYVN1Q86TM6 617 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 CEP97Q8IW35 865 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 APCDD1Q8J025 514 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 CPXM2Q8N436 756 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 NCSTNQ92542 709 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 HHATLQ9HCP6 504 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 TAS2R9Q9NYW1 312 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 IFT52Q9Y366 437 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 DRGXA6NNA5 263 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 H7BY64 318 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 CASP9P55211 416 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 COQ5Q5HYK3 327 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 GPR150Q8NGU9 434 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 KLHL6Q8WZ60 621 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 PRAP1Q96NZ9 151 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 PKP4Q99569 1192 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 CTPS2Q9NRF8 586 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 AIG1Q9NVV5 245 aa13□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 A0A1W2PQ72 361 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 LILRB3O75022 631 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 ECHS1P30084 290 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 MAGEA6P43360 314 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 KCNC1P48547 511 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 MTTPP55157 894 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 CST6Q15828 149 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 SYT16Q17RD7 645 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 TMEM35AQ53FP2 167 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 CYBRD1Q53TN4 286 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 RABL3Q5HYI8 236 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 ASPGQ86U10 573 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 MEIOBQ8N635 442 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 GOLM1Q8NBJ4 401 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 KCNC2Q96PR1 638 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 TCF7L1Q9HCS4 588 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 PRODH2Q9UF12 536 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 SUSD2Q9UGT4 822 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF222Q9UK12 451 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 PLAGL1Q9UM63 463 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 DFNA5O60443 496 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 BMP8BP34820 402 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 TIGD6Q17RP2 521 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 L3HYPDHQ96EM0 354 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 HHIPL1Q96JK4 782 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 CASD1Q96PB1 797 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 RMI1Q9H9A7 625 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 GMEB2Q9UKD1 530 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 MGAT4BQ9UQ53 548 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 WDR45Q9Y484 360 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 FAM221BA6H8Z2 402 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 FAM170BA6NMN3 283 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 RFPL2O75678 378 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 C6P13671 934 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 CDKN2DP55273 166 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 PPP2R2BQ00005 443 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 RPA4Q13156 261 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRVP-205ENST00000641549 NPTX1Q15818 432 aa12.99□□□□□ -0.33
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