RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636621.1

LINC00598-211, long intergenic non-protein coding RNA 598, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC00598, Length 3,241 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00598-211ENST00000636621 BTBD3Q9Y2F9 522 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 GABRR3A8MPY1 467 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 HOXA2O43364 376 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 MPZL2O60487 215 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 AP2A2O94973 939 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 LRATO95237 230 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 IGSF6O95976 241 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 COX7A2P14406 83 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 HIST1H2ADP20671 130 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 IDSP22304 550 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 ZXDBP98169 803 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 IFITM2Q01629 132 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 CRHR2Q13324 411 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 GAB1Q13480 694 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 SPIN4Q56A73 249 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF621Q6ZSS3 439 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 TSPAN33Q86UF1 283 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 VRK3Q8IV63 474 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 CLECL1Q8IZS7 167 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 APCDD1Q8J025 514 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 METTL4Q8N3J2 472 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 FLCNQ8NFG4 579 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 OR2AP1Q8NGE2 309 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 PIK3R3Q92569 461 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 WDR34Q96EX3 536 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 VN1R3Q9BXE9 311 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 POLE4Q9NR33 117 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 GABRQQ9UN88 632 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 HS3ST2Q9Y278 367 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 CFL2Q9Y281 166 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 TNFRSF11BO00300 401 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 KMOO15229 486 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 SEC14L5O43304 696 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 TLL1O43897 1013 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 HLA-EP13747 358 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 CBLP22681 906 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 LHCGRP22888 699 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 BMPR1AP36894 532 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 CASP3P42574 277 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 MAPK9P45984 424 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 XCR1P46094 333 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 CHIT1Q13231 466 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 SYT16Q17RD7 645 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 LRRC66Q68CR7 880 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 GPR153Q6NV75 609 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 GALNT10Q86SR1 603 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 VPS37AQ8NEZ2 397 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 OR10G2Q8NGC3 310 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 WDFY2Q96P53 400 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 TM6SF2Q9BZW4 377 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 FTSJ1Q9UET6 329 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF229Q9UJW7 825 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 A0A1W2PQ67 120 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 ZAR1LA6NP61 321 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 SNPHO15079 494 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 TBX1O43435 398 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 NBNO60934 754 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 MED26O95402 600 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 PTHP01270 115 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 NUDT7P0C024 238 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 ITGA2P17301 1181 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 DDX5P17844 614 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 PNLIPRP1P54315 467 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 FPGSQ05932 587 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 CDH18Q13634 790 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 DGKKQ5KSL6 1271 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 COLEC12Q5KU26 742 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 CPTPQ5TA50 214 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 AGAP6Q5VW22 663 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 DESI1Q6ICB0 168 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms