RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 ECM1Q16610 540 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 FAM171BQ6P995 826 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 RTL4Q6ZR62 310 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 RNF44Q7L0R7 432 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 LACC1Q8IV20 430 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ACBD4Q8NC06 268 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CHST4Q8NCG5 386 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GPR156Q8NFN8 814 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ZFP90Q8TF47 636 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 OVCA2Q8WZ82 227 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ABCG5Q9H222 651 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM185BQ9H7F4 350 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 B3GNT2Q9NY97 397 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 KLF15Q9UIH9 416 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 FBXW11Q9UKB1 542 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 MAFFQ9ULX9 164 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ASF1AQ9Y294 204 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 A0A1W2PRQ8 180 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SOBPA7XYQ1 873 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF487B1APH4 448 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CLDN4O14493 209 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 OIP5O43482 229 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SNNO75324 88 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 IGFALSP35858 605 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GMPRP36959 345 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 DNASE1L1P49184 302 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 NDUFV1P49821 464 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 BLKP51451 505 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TSTD2Q5T7W7 516 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 AADACL4Q5VUY2 407 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SPRYD7Q5W111 196 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TCEAL6Q6IPX3 200 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SVBPQ8N300 66 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CNIH3Q8TBE1 160 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM203Q969S6 136 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 RAD51AP1Q96B01 352 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PSKH2Q96QS6 385 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 DHRS9Q9BPW9 319 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 NDC1Q9BTX1 674 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CACNA1FO60840 1977 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PCDH17O14917 1159 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 DLX3O60479 287 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 UBXN7O94888 489 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ATE1O95260 518 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 NMBRP28336 390 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 NUDT6P53370 316 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 MC2RQ01718 297 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GRIK2Q13002 908 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 BTN1A1Q13410 526 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 INAVAQ3KP66 663 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GPR33Q49SQ1 333 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ATAT1Q5SQI0 421 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TREML2Q5T2D2 321 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SLC36A4Q6YBV0 504 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GALNT13Q8IUC8 556 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CRYBG2Q8N1P7 616 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ANGPTL6Q8NI99 470 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PMEPA1Q969W9 287 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 C3orf49Q96BT1 292 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 MGLLQ99685 303 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 DMAC2Q9NW81 257 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 IKZF2Q9UKS7 526 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TACSTD2P09758 323 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PRPS1L1P21108 318 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 MAN2A2P49641 1150 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF425Q6IV72 752 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SLC25A25Q6KCM7 469 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GPR135Q8IZ08 494 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 OR4C6Q8NH72 309 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SLC22A18Q96BI1 424 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TESCQ96BS2 214 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TMED9Q9BVK6 235 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 MS4A12Q9NXJ0 267 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CA5BQ9Y2D0 317 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PRAMEF12O95522 483 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 RGS19P49795 217 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CCR4P51679 360 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TAF10Q12962 218 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SCARB2Q14108 478 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 EEF1DP3Q658K8 133 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 FUT10Q6P4F1 479 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms