RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592826.1

APBA3-208, Transcript of amyloid beta precursor protein binding family A member 3, human

TSL 2

Gene APBA3, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APBA3-208	ENST00000592826	GSTA1	P08263	222 aa		21.35	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	FURIN	P09958	794 aa		21.35	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	21.35	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	HSD17B3	P37058	310 aa		21.35	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	IRF8	Q02556	426 aa		21.35	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	E2F2	Q14209	437 aa		21.35	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	SLC9A5	Q14940	896 aa		21.35	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		21.35	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	XKR6	Q5GH73	641 aa		21.35	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	ABHD13	Q7L211	337 aa		21.35	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	21.35	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		21.35	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	21.35	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	CAVIN3	Q969G5	261 aa		21.35	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	ESAM	Q96AP7	390 aa		21.35	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		21.35	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	21.35	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		21.35	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		21.35	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		21.35	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		21.35	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		21.34	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	21.34	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		21.34	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	21.34	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	STX16	O14662	325 aa		21.34	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	PCDH17	O14917	1159 aa		21.34	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	CDH16	O75309	829 aa		21.34	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	AGTR2	P50052	363 aa		21.34	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	RRAD	P55042	308 aa		21.34	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	21.34	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		21.34	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	MED25	Q71SY5	747 aa		21.34	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	21.34	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		21.34	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	KCT2	Q8NC54	265 aa		21.34	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	21.34	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	MIEF2	Q96C03	454 aa		21.34	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	SPSB2	Q99619	263 aa		21.34	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	21.34	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	XPR1	Q9UBH6	696 aa		21.34	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		21.34	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		21.33	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	PEX12	O00623	359 aa		21.33	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	UGDH	O60701	494 aa		21.33	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	21.33	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	WFS1	O76024	890 aa		21.33	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	SHBG	P04278	402 aa		21.33	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	SERPIND1	P05546	499 aa		21.33	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	NUDT17	P0C025	328 aa		21.33	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		21.33	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	IL10	P22301	178 aa		21.33	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	21.33	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	CHIT1	Q13231	466 aa		21.33	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		21.33	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		21.33	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		21.33	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		21.33	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		21.33	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		21.33	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		21.33	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	CLMP	Q9H6B4	373 aa		21.33	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF358	Q9NW07	568 aa		21.33	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		21.33	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	CTSF	Q9UBX1	484 aa		21.33	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	TBK1	Q9UHD2	729 aa		21.33	■■□□□ 1.01
APBA3-208	ENST00000592826	CLEC3A	O75596	197 aa		21.32	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	CYC1	P08574	325 aa		21.32	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	ALOX12	P18054	663 aa		21.32	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	TAC1	P20366	129 aa		21.32	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	MMP11	P24347	488 aa		21.32	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	SERPINB1	P30740	379 aa		21.32	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	POLE2	P56282	527 aa		21.32	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	DOC2A	Q14183	400 aa		21.32	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	TEX9	Q8N6V9	391 aa		21.32	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	AMER3	Q8N944	861 aa		21.32	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		21.32	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	MZB1	Q8WU39	189 aa		21.32	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		21.32	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		21.32	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	RHBG	Q9H310	441 aa		21.32	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	21.32	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		21.32	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	RAB21	Q9UL25	225 aa		21.32	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	UMOD	P07911	640 aa		21.31	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	KRT15	P19012	456 aa		21.31	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	EPOR	P19235	508 aa		21.31	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	OTX2	P32243	289 aa		21.31	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	HNF4A	P41235	474 aa		21.31	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	LIPJ	Q5W064	366 aa		21.31	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	21.31	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		21.31	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		21.31	■■□□□ 1
APBA3-208	ENST00000592826	ASB1	Q9Y576	335 aa		21.31	■■□□□ 1

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