RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577426.1

TRAPPC8-202, Transcript of trafficking protein particle complex 8, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC8, Length 437 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8-202ENST00000577426 HBQ1P09105 142 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 TPBGLP0DKB5 382 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 UGT2B7P16662 529 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 AGXTP21549 392 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 GNLYP22749 145 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 FOXN2P32314 431 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 LSP1P33241 339 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 UQCRFS1P47985 274 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 GABRA4P48169 554 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 CCL11P51671 97 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 ACVR1Q04771 509 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRKG2Q13237 762 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 RPS6KA1Q15418 735 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 OASLQ15646 514 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZIC1Q15915 447 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 PTCHD3Q3KNS1 767 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 NADK2Q4G0N4 442 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 FAM69BQ5VUD6 431 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 MED25Q71SY5 747 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 TAS2R42Q7RTR8 314 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 LINC00523Q86TU6 105 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 HPS6Q86YV9 775 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 MCEMP1Q8IX19 187 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 TBC1D21Q8IYX1 336 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 RASGEF1CQ8N431 466 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZBTB2Q8N680 514 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 Q8NA96 180 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 GLIS1Q8NBF1 620 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 MNS1Q8NEH6 495 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 FDCSPQ8NFU4 85 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 OR52K1Q8NGK4 314 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 OR13J1Q8NGT2 312 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 OR5K2Q8NHB8 316 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 CPT1CQ8TCG5 803 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 ACTRT1Q8TDG2 376 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 COG1Q8WTW3 980 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 ELMO1Q92556 727 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 PBKQ96KB5 322 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 OR2A14Q96R47 310 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 RANBP9Q96S59 729 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 TMEM121Q9BTD3 319 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 NUDT9Q9BW91 350 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 CARD6Q9BX69 1037 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 XKR8Q9H6D3 395 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 FAM60AQ9NP50 221 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 CASS4Q9NQ75 786 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 OR6C2Q9NZP2 312 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 POLG2Q9UHN1 485 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 RIMKLBQ9ULI2 386 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 SNX7Q9UNH6 387 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 CDYLQ9Y232 598 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 PADI2Q9Y2J8 665 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC8-202ENST00000577426 ESPL1Q14674 2120 aa4.84□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 A0A0J9YY10 115 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 CCDC78A2IDD5 438 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 HEATR9A2RTY3 570 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 CTAGE15A4D2H0 777 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 C9J4A7 227 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 DYNC1I1O14576 645 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF185O15231 689 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 LIASO43766 372 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 OR1I1O60431 355 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 TRIM13O60858 407 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 GPC4O75487 556 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 OR2B3O76000 313 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 GAS8O95995 478 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 GOT2P00505 430 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 CD63P08962 238 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 OR56A5P0C7T3 313 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 CTAGE8P0CG41 777 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 CBSLP0DN79 551 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 CD40P25942 277 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 STIP1P31948 543 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 CCR7P32248 378 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 CXCR5P32302 372 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 CBSP35520 551 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 GRIA1P42261 906 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 ROM1Q03395 351 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 CDH17Q12864 832 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 ATP1A4Q13733 1029 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 GRB7Q14451 532 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 KIR2DS3Q14952 304 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 BRD3Q15059 726 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLC5A12Q1EHB4 618 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 SYTL3Q4VX76 610 aa4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.6 ms