RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560336.6

LINC00520-206, long intergenic non-protein coding RNA 520, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LINC00520, Length 883 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00520-206ENST00000560336 CCDC138Q96M89 665 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 ATG10Q9H0Y0 220 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 DPEP2Q9H4A9 486 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 RMI1Q9H9A7 625 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 LTB4R2Q9NPC1 389 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 ITM2CQ9NQX7 267 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 KLC4Q9NSK0 619 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 DNAJC11Q9NVH1 559 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 WNT16Q9UBV4 365 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 PSMD13Q9UNM6 376 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 KANSL1LA0AUZ9 987 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 KRT87PA6NCN2 255 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 CFAP73A6NFT4 308 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 PRAMEF25A6NGN4 478 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 CAPN14A8MX76 684 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 PLD2O14939 933 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 CLGNO14967 610 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 UBDO15205 165 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 ATP6AP2O75787 350 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 C1orf105O95561 183 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 RPN2P04844 631 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 CAPN1P07384 714 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 SLC35G4P0C7Q5 338 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 EBLN1P0CF75 366 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 T-ENOLP0DO92 83 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 ACP5P13686 325 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 LBPP18428 481 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 AOC1P19801 751 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 KELP23276 732 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 PTPN4P29074 926 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 OXTRP30559 389 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 GGT5P36269 586 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 HALP42357 657 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 GNPDA1P46926 289 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 CPA2P48052 419 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 THOP1P52888 689 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 CLDN2P57739 230 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 STARD6P59095 220 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 KIAA1024LP59773 190 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 ERVPABLB-1P60509 514 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 STX1BP61266 288 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 NFATC3Q12968 1075 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 TRAF3Q13114 568 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 NAE1Q13564 534 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 UGT3A2Q3SY77 523 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 FAM219BQ5XKK7 198 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 TMEM198Q66K66 360 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 CPZQ66K79 652 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 ANO7Q6IWH7 933 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 AGTRAPQ6RW13 159 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 IL27RAQ6UWB1 636 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 SCIMPQ6UWF3 145 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 ENPP7Q6UWV6 458 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 UNC5DQ6UXZ4 953 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 OVCH1Q7RTY7 1134 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 KLHL36Q8N4N3 616 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 PYCR2Q96C36 320 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 MED8Q96G25 268 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 WDR92Q96MX6 357 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 NELL2Q99435 816 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 PKP4Q99569 1192 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 TIMM29Q9BSF4 260 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 NTMT1Q9BV86 223 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 ACTR8Q9H981 624 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 TM7SF3Q9NS93 570 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 MRGBPQ9NV56 204 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 KLQ9UEF7 1012 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 SLC23A2Q9UGH3 650 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 CIDEBQ9UHD4 219 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 TRPS1Q9UHF7 1281 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 ACSL5Q9ULC5 683 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 ASF1AQ9Y294 204 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00520-206ENST00000560336 CDH23Q9H251 3354 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms