RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551592.5

SENP1-208, Transcript of SUMO specific peptidase 1, human

TSL 3

Gene SENP1, Length 866 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SENP1-208	ENST00000551592	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	TNN	Q9UQP3	1299 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	CFAP73	A6NFT4	308 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	KPNA7	A9QM74	516 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592		E5RGE8	158 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	PSMD3	O43242	534 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	GRAP2	O75791	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	BMP15	O95972	392 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	IGHV4-59	P01825	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	PGK2	P07205	417 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	CCDC192	P0DO97	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	CPA3	P15088	417 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	FER	P16591	822 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	MARK3	P27448	753 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	HUNK	P57058	714 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	OR1D5	P58170	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	GALK2	Q01415	458 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	MYL7	Q01449	175 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	GPR17	Q13304	367 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	P2RY6	Q15077	328 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	PTPN14	Q15678	1187 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	WDR38	Q5JTN6	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	ISCA2	Q86U28	154 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	STH	Q8IWL8	128 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	LMO3	Q8TAP4	145 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	LYZL4	Q96KX0	146 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	SAMD8	Q96LT4	415 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	GUCD1	Q96NT3	240 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	NYX	Q9GZU5	481 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	NSG2	Q9Y328	171 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	UBE4B	O95155	1302 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	SERINC4	A6NH21	518 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	LACTBL1	A8MY62	500 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592		K7EPI3	171 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	RASGRF2	O14827	1237 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	KIF5C	O60282	957 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	SOCS5	O75159	536 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	CLN5	O75503	358 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	STBD1	O95210	358 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	MT-ATP6	P00846	226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	TGFA	P01135	160 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	GPI	P06744	558 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	NUDT17	P0C025	328 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	CETP	P11597	493 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	CDK4	P11802	303 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	CAMLG	P49069	296 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	DNA2	P51530	1060 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	CDH18	Q13634	790 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	GPC2	Q8N158	579 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	SMYD1	Q8NB12	490 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	POC1A	Q8NBT0	407 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	CD101	Q93033	1021 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	VOPP1	Q96AW1	172 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	ULK4	Q96C45	1275 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	ALG14	Q96F25	216 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	LMLN	Q96KR4	655 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	MEIS3	Q99687	375 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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