RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF763Q0D2J5 394 aa20.08■□□□□ 0.81
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PRDM4-205ENST00000550376 TPT1P8Q9HAU6 139 aa20.08■□□□□ 0.81
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PRDM4-205ENST00000550376 U3KQV3 271 aa20.08■□□□□ 0.8
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PRDM4-205ENST00000550376 HBA1P69905 142 aa20.07■□□□□ 0.8
PRDM4-205ENST00000550376 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
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PRDM4-205ENST00000550376 OR52E1Q8NGJ3 308 aa20.07■□□□□ 0.8
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PRDM4-205ENST00000550376 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
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PRDM4-205ENST00000550376 C6orf47O95873 294 aa20.07■□□□□ 0.8
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PRDM4-205ENST00000550376 ASMTP46597 345 aa20.07■□□□□ 0.8
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PRDM4-205ENST00000550376 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
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PRDM4-205ENST00000550376 SLC30A9Q6PML9 568 aa20.06■□□□□ 0.8
PRDM4-205ENST00000550376 WASH2PQ6VEQ5 465 aa20.06■□□□□ 0.8
PRDM4-205ENST00000550376 PGBD3Q8N328 593 aa20.06■□□□□ 0.8
PRDM4-205ENST00000550376 FAM131CQ96AQ9 280 aa20.06■□□□□ 0.8
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PRDM4-205ENST00000550376 DIRAS1O95057 198 aa20.05■□□□□ 0.8
PRDM4-205ENST00000550376 SCELO95171 688 aa20.05■□□□□ 0.8
PRDM4-205ENST00000550376 CST1P01037 141 aa20.05■□□□□ 0.8
PRDM4-205ENST00000550376 FURINP09958 794 aa20.05■□□□□ 0.8
PRDM4-205ENST00000550376 FCGR1AP12314 374 aa20.05■□□□□ 0.8
PRDM4-205ENST00000550376 DRD1P21728 446 aa20.05■□□□□ 0.8
PRDM4-205ENST00000550376 PRKACGP22612 351 aa20.05■□□□□ 0.8
PRDM4-205ENST00000550376 PIK3CBP42338 1070 aa20.05■□□□□ 0.8
PRDM4-205ENST00000550376 HSPA13P48723 471 aa20.05■□□□□ 0.8
PRDM4-205ENST00000550376 PLA2G16P53816 162 aa20.05■□□□□ 0.8
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