RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538333.3

LIMK1-208, Transcript of LIM domain kinase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LIMK1, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1-208ENST00000538333 RPA4Q13156 261 aa13.46□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 RFX4Q33E94 735 aa13.46□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 IQCCQ4KMZ1 466 aa13.46□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa13.46□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa13.46□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 PNCKQ6P2M8 343 aa13.46□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 LCTLQ6UWM7 567 aa13.46□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 VN1R5Q7Z5H4 357 aa13.46□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 CYP4Z1Q86W10 505 aa13.46□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 FAM129CQ86XR2 697 aa13.46□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 METTL4Q8N3J2 472 aa13.46□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 OR5AR1Q8NGP9 310 aa13.46□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 SNX19Q92543 992 aa13.46□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 HSH2DQ96JZ2 352 aa13.46□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 DOK1Q99704 481 aa13.46□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 CXorf21Q9HAI6 301 aa13.46□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 GPATCH2Q9NW75 528 aa13.46□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 CDC14AQ9UNH5 594 aa13.46□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 CORO2BQ9UQ03 480 aa13.46□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 ASF1AQ9Y294 204 aa13.46□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 CKAP5Q14008 2032 aa13.46□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 TMEM229AB2RXF0 380 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 SAP18O00422 153 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 FABP3P05413 133 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 TAS2R38P59533 333 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 HBA1P69905 142 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 CDK3Q00526 305 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 CD47Q08722 323 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 FCHO2Q0JRZ9 810 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 RUNX3Q13761 415 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 MPEG1Q2M385 716 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 C6orf141Q5SZD1 244 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 ZNF691Q5VV52 312 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 FAM71E1Q6IPT2 247 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 AMZ2Q86W34 360 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 OR4K1Q8NGD4 311 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 OR4A15Q8NGL6 344 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 RAD51AP1Q96B01 352 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 LGR4Q9BXB1 951 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 MYNNQ9NPC7 610 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 PLAGL1Q9UM63 463 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 VPS4AQ9UN37 437 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 hCG_2039718K7EN88 272 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 ITGAMP11215 1152 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 KELP23276 732 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 DCKP27707 260 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 RAD23AP54725 363 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 MC1RQ01726 317 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 MEP1AQ16819 746 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 WSCD2Q2TBF2 565 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 TMEM26Q6ZUK4 368 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 NAGSQ8N159 534 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 OXR1Q8N573 874 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 C16orf78Q8WTQ4 265 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 FBLIM1Q8WUP2 373 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 MAL2Q969L2 176 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 TUBA1CQ9BQE3 449 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 CERS4Q9HA82 394 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 REV3LO60673 3130 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 IGLON5A6NGN9 336 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 MITFO75030 526 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 DIRAS1O95057 198 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 KAT7O95251 611 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 PCCBP05166 539 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 PCGF2P35227 344 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 DAPP51397 102 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 IL18R1Q13478 541 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 LAPTM4AQ15012 233 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 IER5LQ5T953 404 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 AGBL4Q5VU57 503 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 KDM4DQ6B0I6 523 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 XAF1Q6GPH4 301 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 ZNF852Q6ZMS4 543 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 PIK3C3Q8NEB9 887 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 SGCDQ92629 289 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 UBE2E3Q969T4 207 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 C7orf34Q96L11 122 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 NRTNQ99748 197 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 MENTQ9BUN1 341 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 PRM3Q9NNZ6 103 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 TM7SF3Q9NS93 570 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMK1-208ENST00000538333 DPM1O60762 260 aa13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms