RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 PTPN3P26045 913 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 CCR2P41597 374 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 RPS5P46782 204 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 CDH4P55283 916 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 RHOAP61586 193 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 BTN1A1Q13410 526 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 C2orf27AQ580R0 203 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF678Q5SXM1 525 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ZBTB37Q5TC79 503 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 PIK3R6Q5UE93 754 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 LETMD1Q6P1Q0 360 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 TCTE3Q8IZS6 198 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 DNASE1L2Q92874 299 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ELSPBP1Q96BH3 223 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 REPS1Q96D71 796 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 SLC47A1Q96FL8 570 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 APOL4Q9BPW4 351 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM30AQ9NV96 361 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ATP6V1HQ9UI12 483 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 V9GYH0 126 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 OR5K4A6NMS3 321 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 WBP4O75554 376 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 SERPINF2P08697 491 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 CXCR3P49682 368 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 SEC13P55735 322 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 SRP54P61011 504 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 CCNJQ5T5M9 372 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 KCTD11Q693B1 232 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 BRAT1Q6PJG6 821 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 HACD1B0YJ81 288 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 EEDO75530 441 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 GGT1P19440 569 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 SEMA3BQ13214 749 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 LAX1Q8IWV1 398 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 FAM3CQ92520 227 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ZSWIM3Q96MP5 696 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 SIGLEC11Q96RL6 698 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 TBCDQ9BTW9 1192 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 FAM83DQ9H4H8 585 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ABCB8Q9NUT2 735 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ADGRE2Q9UHX3 823 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 GMPPBQ9Y5P6 360 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 NCOR1O75376 2440 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 BTN3A3O00478 584 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ANKRD28O15084 1053 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 PCDHGA12O60330 932 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ERN1O75460 977 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 SLC22A5O76082 557 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 MLYCDO95822 493 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 LATS1O95835 1130 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 HSMCR30P0CW71 290 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 RHOQP17081 205 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ERCC2P18074 760 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 LBPP18428 481 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 WASP42768 502 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 KIR2DL3P43628 341 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ETV1P50549 477 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 TEKQ02763 1124 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 FLYWCH1Q4VC44 716 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM81Q6P7N7 255 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 PRSS42Q7Z5A4 293 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 LIX1LQ8IVB5 337 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 NTAN1Q96AB6 310 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 FRMD6Q96NE9 622 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 NUP205Q92621 2012 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 KIAA0513O60268 411 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 C1QBP02746 253 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF33BQ06732 778 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 FBXL22Q6P050 247 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 CEP68Q76N32 757 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 SVOPLQ8N434 492 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 SETD6Q8TBK2 473 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00862A6NCI5 91 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 PPM1BO75688 479 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ALPPP05187 535 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 NFKB1P19838 968 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 HTR7P34969 479 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 EPHA5P54756 1037 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 TATDN3Q17R31 274 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 GARNL3Q5VVW2 1013 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 KDELC1Q6UW63 502 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 DLEU7Q6UYE1 221 aa9.74□□□□□ -0.85
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