RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARPC2O15144 300 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 VEGFDO43915 354 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR1I1O60431 355 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 EEDO75530 441 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 H6PDO95479 791 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 NPPAP01160 153 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 PF4P02776 101 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 PCCBP05166 539 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 UMPSP11172 480 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF23P17027 643 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 CKMT2P17540 419 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 DGKAP23743 735 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC6A2P23975 617 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 FASP25445 335 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 ACSL1P33121 698 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 ALDH3B2P48448 385 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 GSK3BP49841 420 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCR5P51681 352 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADARP55265 1226 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 TAS2R38P59533 333 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 IL2P60568 153 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 ERVK-8P63133 956 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 LIPEQ05469 1076 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 MTAPQ13126 283 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 RCAN2Q14206 197 aa5.39□□□□□ -1.55
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ARHGEF3-215ENST00000498517 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
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ARHGEF3-215ENST00000498517 ATP6AP1Q15904 470 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 TTLL9Q3SXZ7 439 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 KCTD21Q4G0X4 260 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 SYTL3Q4VX76 610 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 XKR7Q5GH72 579 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 CTSL3PQ5NE16 218 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 GPRC6AQ5T6X5 926 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM219BQ5XKK7 198 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM220Q6QAJ8 160 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 ISLR2Q6UXK2 745 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 RFLNAQ6ZTI6 216 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 DET1Q7L5Y6 550 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPRED1Q7Z699 444 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRIM69Q86WT6 500 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 GPSM1Q86YR5 675 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPPL2CQ8IUH8 684 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADGRG5Q8IZF4 528 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 MYO1HQ8N1T3 1032 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 TNIP2Q8NFZ5 429 aa5.39□□□□□ -1.55
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ARHGEF3-215ENST00000498517 ASZ1Q8WWH4 475 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 SNX19Q92543 992 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 KCNJ9Q92806 393 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM125Q96AQ2 219 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 VOPP1Q96AW1 172 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 LINGO1Q96FE5 620 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 RHOVQ96L33 236 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF382Q96SR6 550 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC29A1Q99808 456 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCM2Q9BSQ5 444 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 APOOQ9BUR5 198 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 TPSD1Q9BZJ3 242 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 BRINP2Q9C0B6 783 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR2AG1Q9H205 316 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 WDR26Q9H7D7 661 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC52A3Q9NQ40 469 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 CD274Q9NZQ7 290 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZIM2Q9NZV7 527 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 SERGEFQ9UGK8 458 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
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ARHGEF3-215ENST00000498517 PCTPQ9UKL6 214 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 GPR34Q9UPC5 381 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 AURKCQ9UQB9 309 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 MED16Q9Y2X0 877 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 TIMM22Q9Y584 194 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 CEPT1Q9Y6K0 416 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 LRRK1Q38SD2 2015 aa5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 COL4A3Q01955 1670 aa5.38□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A087WXM4 84 aa5.38□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 TCRBV5S2A0A599 114 aa5.38□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM82A0PJX8 343 aa5.38□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 KLHL33A6NCF5 533 aa5.38□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANKRD33BA6NCL7 494 aa5.38□□□□□ -1.55
ARHGEF3-215ENST00000498517 ASPDHA6ND91 283 aa5.38□□□□□ -1.55
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